Protein–RNA interactions for Protein: Q8BVL3

Snx17, Sorting nexin-17, mousemouse

Predictions only

Length 470 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx17Q8BVL3 Rspo2-203ENSMUST00000226810 3091 ntAPPRIS P1 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Snx17Q8BVL3 Rspo3-201ENSMUST00000092623 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Snx17Q8BVL3 Ceacam1-205ENSMUST00000206171 1722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Snx17Q8BVL3 Chrdl1-202ENSMUST00000074660 4096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Snx17Q8BVL3 Scn8a-208ENSMUST00000200963 5814 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Snx17Q8BVL3 Klhdc7b-202ENSMUST00000225666 3951 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Snx17Q8BVL3 Gpr19-201ENSMUST00000046255 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Snx17Q8BVL3 Enpp7-201ENSMUST00000092373 1370 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Snx17Q8BVL3 Oprd1-201ENSMUST00000056336 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Snx17Q8BVL3 Grsf1-202ENSMUST00000113234 2286 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Snx17Q8BVL3 Impdh2-ps-201ENSMUST00000120826 1545 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Snx17Q8BVL3 Kdm4d-201ENSMUST00000058796 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Snx17Q8BVL3 Cryzl1-202ENSMUST00000114023 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Snx17Q8BVL3 Nptn-202ENSMUST00000114121 863 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Snx17Q8BVL3 Ncbp2-202ENSMUST00000115178 515 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Snx17Q8BVL3 Cryzl1-206ENSMUST00000124282 1187 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Snx17Q8BVL3 Tctex1d1-205ENSMUST00000140654 891 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Snx17Q8BVL3 Mir1941-201ENSMUST00000157834 83 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Snx17Q8BVL3 Gm27826-201ENSMUST00000175282 255 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Snx17Q8BVL3 Gm20694-201ENSMUST00000176943 404 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Snx17Q8BVL3 Gm29135-201ENSMUST00000188411 612 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Snx17Q8BVL3 Gm19891-201ENSMUST00000189771 303 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Snx17Q8BVL3 Gm42689-201ENSMUST00000202403 404 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Snx17Q8BVL3 Gm42867-201ENSMUST00000202995 469 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Snx17Q8BVL3 Gm32591-203ENSMUST00000204725 696 ntTSL 3 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Snx17Q8BVL3 Rpl15-ps5-201ENSMUST00000205636 605 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Snx17Q8BVL3 Cox6b1-204ENSMUST00000208838 354 ntTSL 3 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Snx17Q8BVL3 Gm7183-201ENSMUST00000213870 1005 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Snx17Q8BVL3 Lect2-202ENSMUST00000225183 823 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Snx17Q8BVL3 Ggta1-201ENSMUST00000044255 1221 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Snx17Q8BVL3 Gimap7-201ENSMUST00000052503 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Snx17Q8BVL3 Lect2-201ENSMUST00000062806 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Snx17Q8BVL3 Taar5-201ENSMUST00000092659 1014 ntAPPRIS P1 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Snx17Q8BVL3 Ppp1r3b-204ENSMUST00000211648 4386 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Snx17Q8BVL3 Trpv3-201ENSMUST00000049676 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Snx17Q8BVL3 Smim1-208ENSMUST00000143047 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Snx17Q8BVL3 Ajuba-201ENSMUST00000054487 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Snx17Q8BVL3 Gm38569-201ENSMUST00000205476 2228 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Snx17Q8BVL3 Sox7-201ENSMUST00000079652 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Snx17Q8BVL3 Mmab-201ENSMUST00000031560 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Snx17Q8BVL3 Atl3-202ENSMUST00000170373 6474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Snx17Q8BVL3 Paqr5-201ENSMUST00000034817 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Snx17Q8BVL3 Rabl2-202ENSMUST00000094056 1322 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Snx17Q8BVL3 Platr25-207ENSMUST00000222477 1705 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Snx17Q8BVL3 Mroh5-202ENSMUST00000110021 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Snx17Q8BVL3 Csrnp2-201ENSMUST00000061457 4126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Snx17Q8BVL3 Alox5-202ENSMUST00000164547 1854 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Snx17Q8BVL3 Accs-202ENSMUST00000068513 1872 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Snx17Q8BVL3 Tcof1-202ENSMUST00000175934 4595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.43
Snx17Q8BVL3 Herc4-208ENSMUST00000219577 3914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.43
Snx17Q8BVL3 Spr-ps1-203ENSMUST00000187705 2892 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Snx17Q8BVL3 Mxd1-201ENSMUST00000001184 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Snx17Q8BVL3 Dis3l-208ENSMUST00000168844 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Snx17Q8BVL3 Gm26818-201ENSMUST00000181367 1360 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Snx17Q8BVL3 Adipor2-202ENSMUST00000169744 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Snx17Q8BVL3 Wasf2-202ENSMUST00000105912 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Snx17Q8BVL3 Smarca2-216ENSMUST00000176769 5703 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Snx17Q8BVL3 Slc20a1-202ENSMUST00000110315 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Snx17Q8BVL3 2610203C22Rik-201ENSMUST00000115480 1246 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Snx17Q8BVL3 Itpa-ps1-201ENSMUST00000117207 597 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Snx17Q8BVL3 Gm12736-201ENSMUST00000119330 236 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Snx17Q8BVL3 Mrgpra2a-201ENSMUST00000159004 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Snx17Q8BVL3 Gm6291-201ENSMUST00000179994 309 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Snx17Q8BVL3 Gm29164-201ENSMUST00000185454 1024 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Snx17Q8BVL3 Gm37688-201ENSMUST00000195195 465 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Snx17Q8BVL3 Tfr2-208ENSMUST00000199054 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Snx17Q8BVL3 CT030195.2-201ENSMUST00000226074 1286 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Snx17Q8BVL3 Faah-201ENSMUST00000049095 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Snx17Q8BVL3 Gm5278-201ENSMUST00000055957 552 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Snx17Q8BVL3 4930579F01Rik-202ENSMUST00000199293 1598 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Snx17Q8BVL3 Ebf3-203ENSMUST00000168203 3724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Snx17Q8BVL3 Slc6a4-201ENSMUST00000021195 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Snx17Q8BVL3 Gm807-201ENSMUST00000181742 1723 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Snx17Q8BVL3 Stk32b-201ENSMUST00000094836 3458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Snx17Q8BVL3 Slc39a14-202ENSMUST00000068044 4926 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Snx17Q8BVL3 Togaram1-201ENSMUST00000066296 6372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Snx17Q8BVL3 Thrap3-201ENSMUST00000080919 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Snx17Q8BVL3 Lrrfip1-204ENSMUST00000097650 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Snx17Q8BVL3 Bahcc1-202ENSMUST00000118987 10712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Snx17Q8BVL3 Zeb2-212ENSMUST00000176438 9124 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Snx17Q8BVL3 Gm39204-201ENSMUST00000210045 1307 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Snx17Q8BVL3 Tcf4-234ENSMUST00000201410 1915 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Snx17Q8BVL3 Timd2-201ENSMUST00000055102 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Snx17Q8BVL3 Lpar1-205ENSMUST00000107575 3421 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Snx17Q8BVL3 Nudt15-201ENSMUST00000043813 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Snx17Q8BVL3 Foxj3-202ENSMUST00000106310 4660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Snx17Q8BVL3 Camk2d-216ENSMUST00000163226 4204 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Snx17Q8BVL3 Zfp108-202ENSMUST00000205982 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Snx17Q8BVL3 Evl-204ENSMUST00000172409 1955 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Snx17Q8BVL3 Wdcp-202ENSMUST00000085793 1992 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Snx17Q8BVL3 Gm17745-201ENSMUST00000212186 1692 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Snx17Q8BVL3 Abcc10-201ENSMUST00000047970 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Snx17Q8BVL3 Ttc17-203ENSMUST00000111237 4409 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Snx17Q8BVL3 Bmp1-201ENSMUST00000022693 3684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Snx17Q8BVL3 Cdc37-201ENSMUST00000019615 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Snx17Q8BVL3 Leprot-201ENSMUST00000030254 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Snx17Q8BVL3 Dgcr2-203ENSMUST00000117082 2987 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Snx17Q8BVL3 Cer1-201ENSMUST00000048430 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Snx17Q8BVL3 Adgrg5-201ENSMUST00000074570 2802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Snx17Q8BVL3 Efna1-203ENSMUST00000118860 1403 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.1 ms