Protein–RNA interactions for Protein: Q8BL06

Usp54, Inactive ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 54, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,588 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp54Q8BL06 Galntl5-202ENSMUST00000114965 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Usp54Q8BL06 Gm6783-201ENSMUST00000120916 1437 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Usp54Q8BL06 A1cf-204ENSMUST00000224564 1432 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Usp54Q8BL06 Ighv1-12-201ENSMUST00000103500 294 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Usp54Q8BL06 Gm13624-201ENSMUST00000120263 462 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Usp54Q8BL06 Olfr1372-ps1-201ENSMUST00000121007 934 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Usp54Q8BL06 Gm14145-201ENSMUST00000133385 508 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Usp54Q8BL06 2810433D01Rik-202ENSMUST00000154798 1045 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Usp54Q8BL06 Gm14146-201ENSMUST00000155885 508 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Usp54Q8BL06 AC165092.1-201ENSMUST00000224018 486 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Usp54Q8BL06 Faah-201ENSMUST00000049095 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Usp54Q8BL06 Bmp1-201ENSMUST00000022693 3684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Usp54Q8BL06 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Usp54Q8BL06 Aatk-201ENSMUST00000064307 5336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Usp54Q8BL06 Ccdc154-203ENSMUST00000182621 2402 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Usp54Q8BL06 Gm38048-201ENSMUST00000193778 2174 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Usp54Q8BL06 Acat1-201ENSMUST00000034547 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Usp54Q8BL06 Pou4f2-201ENSMUST00000034115 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Usp54Q8BL06 Clmp-201ENSMUST00000034522 4154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Usp54Q8BL06 Rpap2-202ENSMUST00000112650 2992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Usp54Q8BL06 4930431P19Rik-202ENSMUST00000207761 2959 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Usp54Q8BL06 Chrna3-201ENSMUST00000034851 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Usp54Q8BL06 Cpeb3-204ENSMUST00000126188 4224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Usp54Q8BL06 Grin1-201ENSMUST00000028335 4238 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Usp54Q8BL06 Dab2ip-209ENSMUST00000135741 4128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Usp54Q8BL06 Gm12736-201ENSMUST00000119330 236 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Usp54Q8BL06 Gm15793-201ENSMUST00000121857 495 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Usp54Q8BL06 Gm15650-201ENSMUST00000135451 770 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Usp54Q8BL06 Gm19798-201ENSMUST00000201502 457 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Usp54Q8BL06 AC124503.1-201ENSMUST00000218524 526 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Usp54Q8BL06 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Usp54Q8BL06 Pik3cd-214ENSMUST00000177654 4765 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Usp54Q8BL06 Gm15651-201ENSMUST00000159953 2507 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Usp54Q8BL06 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Usp54Q8BL06 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Usp54Q8BL06 Fam53c-201ENSMUST00000049281 4475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Usp54Q8BL06 Nfatc4-202ENSMUST00000172271 3775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Usp54Q8BL06 Rtl6-201ENSMUST00000069476 4426 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Usp54Q8BL06 Gm2238-201ENSMUST00000192074 3669 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Usp54Q8BL06 1500012K07Rik-201ENSMUST00000181846 2345 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Usp54Q8BL06 Abcb8-201ENSMUST00000073076 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Usp54Q8BL06 Gm42849-201ENSMUST00000202834 1584 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Usp54Q8BL06 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Usp54Q8BL06 Grid2ip-203ENSMUST00000120825 3865 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Usp54Q8BL06 Gm42851-201ENSMUST00000201325 1411 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Usp54Q8BL06 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Usp54Q8BL06 Gm13722-201ENSMUST00000117964 3066 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Usp54Q8BL06 Grin2b-205ENSMUST00000152012 2461 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Usp54Q8BL06 Tpm1-205ENSMUST00000113685 1208 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Usp54Q8BL06 Olfr333-ps1-201ENSMUST00000122311 940 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Usp54Q8BL06 Gm11670-201ENSMUST00000143435 511 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Usp54Q8BL06 6820431F20Rik-201ENSMUST00000150051 936 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Usp54Q8BL06 Gm11655-201ENSMUST00000153899 765 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Usp54Q8BL06 Sectm1b-206ENSMUST00000168459 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Usp54Q8BL06 4930505M18Rik-201ENSMUST00000175854 1288 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Usp54Q8BL06 D330041H03Rik-202ENSMUST00000180390 411 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Usp54Q8BL06 1110020A21Rik-201ENSMUST00000181147 853 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Usp54Q8BL06 Tex35-206ENSMUST00000187546 856 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Usp54Q8BL06 Gm37009-201ENSMUST00000193297 361 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Usp54Q8BL06 2010008C14Rik-201ENSMUST00000203956 593 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Usp54Q8BL06 0610033M10Rik-202ENSMUST00000205236 1102 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Usp54Q8BL06 AC107711.3-201ENSMUST00000228939 1035 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Usp54Q8BL06 Mcu-201ENSMUST00000009791 1079 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Usp54Q8BL06 Gm10581-201ENSMUST00000097986 231 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Usp54Q8BL06 Ncf1-202ENSMUST00000111275 2721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Usp54Q8BL06 Vldlr-207ENSMUST00000167487 7971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Usp54Q8BL06 Bcar1-203ENSMUST00000212349 3116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Usp54Q8BL06 CT010498.2-201ENSMUST00000225690 1659 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Usp54Q8BL06 D230017M19Rik-201ENSMUST00000180722 3096 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Usp54Q8BL06 Gfm2-202ENSMUST00000042084 3074 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Usp54Q8BL06 Nprl3-202ENSMUST00000109389 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Usp54Q8BL06 Sgk3-202ENSMUST00000166384 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Usp54Q8BL06 Hsph1-201ENSMUST00000074846 3240 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Usp54Q8BL06 Tmem201-202ENSMUST00000103208 3620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Usp54Q8BL06 Epha7-204ENSMUST00000108194 2323 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Usp54Q8BL06 Fkbp6-201ENSMUST00000044972 1447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Usp54Q8BL06 Tcirg1-204ENSMUST00000126070 3041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Usp54Q8BL06 Sirpa-214ENSMUST00000179001 3812 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Usp54Q8BL06 L3mbtl2-208ENSMUST00000174229 2578 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Usp54Q8BL06 Matn2-203ENSMUST00000226766 3252 ntBASIC15.46■□□□□ 0.06
Usp54Q8BL06 Edrf1-202ENSMUST00000128901 4380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Usp54Q8BL06 Aicda-201ENSMUST00000043301 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Usp54Q8BL06 Mybl1-201ENSMUST00000088658 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Usp54Q8BL06 Nptn-202ENSMUST00000114121 863 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Usp54Q8BL06 Muc2-202ENSMUST00000167366 711 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Usp54Q8BL06 BC025446-202ENSMUST00000185307 758 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Usp54Q8BL06 Gm28342-201ENSMUST00000190308 589 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Usp54Q8BL06 Gm25125-201ENSMUST00000083340 136 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Usp54Q8BL06 Gm5148-202ENSMUST00000099128 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Usp54Q8BL06 Gpatch1-201ENSMUST00000079693 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Usp54Q8BL06 Plcb2-202ENSMUST00000102524 5145 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Usp54Q8BL06 Gm26615-201ENSMUST00000181522 3201 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Usp54Q8BL06 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Usp54Q8BL06 Luc7l3-209ENSMUST00000166312 5244 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Usp54Q8BL06 Phc1-204ENSMUST00000159252 3744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Usp54Q8BL06 Brinp2-201ENSMUST00000004133 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Usp54Q8BL06 Dcstamp-201ENSMUST00000022913 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Usp54Q8BL06 Pbrm1-206ENSMUST00000112094 5154 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Usp54Q8BL06 Wnt9b-201ENSMUST00000018630 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Usp54Q8BL06 Gm9-201ENSMUST00000101636 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45 ms