Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGG7

Ubash3b, Ubiquitin-associated and SH3 domain-containing protein B, mousemouse

Predictions only

Length 638 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubash3bQ8BGG7 Gm8199-201ENSMUST00000121323 823 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Ubash3bQ8BGG7 Asb8-202ENSMUST00000123626 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Ubash3bQ8BGG7 Asb8-203ENSMUST00000123922 1162 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Ubash3bQ8BGG7 Gm12718-202ENSMUST00000156144 660 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Ubash3bQ8BGG7 Gm14249-201ENSMUST00000156239 1017 ntTSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Ubash3bQ8BGG7 Gm8459-201ENSMUST00000162504 760 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Ubash3bQ8BGG7 Ccdc127-205ENSMUST00000162672 677 ntTSL 3 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Ubash3bQ8BGG7 Tnnt3-224ENSMUST00000169299 1013 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Ubash3bQ8BGG7 Tnnt3-226ENSMUST00000180152 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Ubash3bQ8BGG7 9030407P20Rik-201ENSMUST00000180933 2310 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Ubash3bQ8BGG7 Gm19705-203ENSMUST00000181491 678 ntTSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Ubash3bQ8BGG7 Gm27530-201ENSMUST00000184096 98 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Ubash3bQ8BGG7 Pmvk-203ENSMUST00000184515 1156 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Ubash3bQ8BGG7 Gm2260-201ENSMUST00000184965 657 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Ubash3bQ8BGG7 Rpl7a-ps10-201ENSMUST00000190579 798 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Ubash3bQ8BGG7 4930422M22Rik-201ENSMUST00000191492 948 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Ubash3bQ8BGG7 Gstp-ps-201ENSMUST00000195526 631 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Ubash3bQ8BGG7 Gm37466-201ENSMUST00000195692 652 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Ubash3bQ8BGG7 Gm43050-202ENSMUST00000201152 651 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Ubash3bQ8BGG7 Gm42800-201ENSMUST00000202494 733 ntTSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Ubash3bQ8BGG7 Olfr1490-202ENSMUST00000213900 5165 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Ubash3bQ8BGG7 AC156801.1-201ENSMUST00000216158 493 ntTSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Ubash3bQ8BGG7 AC124171.1-201ENSMUST00000221151 567 ntTSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Ubash3bQ8BGG7 CT030182.1-201ENSMUST00000225935 533 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Ubash3bQ8BGG7 Snai2-201ENSMUST00000023356 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Ubash3bQ8BGG7 Krba1-201ENSMUST00000031815 3685 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Ubash3bQ8BGG7 Neil1-201ENSMUST00000034842 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Ubash3bQ8BGG7 Acrbp-202ENSMUST00000088294 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Ubash3bQ8BGG7 Rpl7a-ps3-201ENSMUST00000090170 796 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Ubash3bQ8BGG7 Rpl7a-ps5-201ENSMUST00000095218 807 ntAPPRIS P1 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Ubash3bQ8BGG7 Gm10702-201ENSMUST00000098929 1268 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Ubash3bQ8BGG7 D030055H07Rik-202ENSMUST00000150953 4325 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Ubash3bQ8BGG7 Kcnj9-201ENSMUST00000062387 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Ubash3bQ8BGG7 Serpine1-202ENSMUST00000077523 2697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Ubash3bQ8BGG7 Kif2c-202ENSMUST00000106436 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Ubash3bQ8BGG7 Hivep2-204ENSMUST00000187083 9268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Ubash3bQ8BGG7 Pdzk1-202ENSMUST00000107069 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Ubash3bQ8BGG7 Pde2a-201ENSMUST00000163751 4218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Ubash3bQ8BGG7 Gm37954-201ENSMUST00000195400 2071 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Ubash3bQ8BGG7 Chrne-201ENSMUST00000014753 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Ubash3bQ8BGG7 Tmem176b-202ENSMUST00000164733 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Ubash3bQ8BGG7 Ippk-202ENSMUST00000220447 4421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Ubash3bQ8BGG7 Etfrf1-201ENSMUST00000039729 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Ubash3bQ8BGG7 Gm12296-201ENSMUST00000144922 3220 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Ubash3bQ8BGG7 Kpna7-202ENSMUST00000110673 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Ubash3bQ8BGG7 AC159308.2-201ENSMUST00000213592 2325 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Ubash3bQ8BGG7 Dld-201ENSMUST00000110857 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Ubash3bQ8BGG7 Morf4l2-202ENSMUST00000080411 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Ubash3bQ8BGG7 Tgfb1i1-201ENSMUST00000070656 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Ubash3bQ8BGG7 Lig4-201ENSMUST00000095476 5028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Ubash3bQ8BGG7 Irf5-202ENSMUST00000163511 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Ubash3bQ8BGG7 Mab21l2-201ENSMUST00000077524 2703 ntAPPRIS P1 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Ubash3bQ8BGG7 Ufd1-202ENSMUST00000115578 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Ubash3bQ8BGG7 Ldb2-204ENSMUST00000199256 2596 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Ubash3bQ8BGG7 Dpysl4-201ENSMUST00000026551 3552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Ubash3bQ8BGG7 Atp11c-201ENSMUST00000033480 5939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Ubash3bQ8BGG7 6030466F02Rik-201ENSMUST00000212339 1434 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Ubash3bQ8BGG7 Fam110a-202ENSMUST00000109863 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Ubash3bQ8BGG7 Cryba4-203ENSMUST00000112385 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Ubash3bQ8BGG7 Avpr2-203ENSMUST00000114395 936 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Ubash3bQ8BGG7 Gm5380-201ENSMUST00000119296 2136 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Ubash3bQ8BGG7 Gm11290-201ENSMUST00000124833 396 ntTSL 3 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Ubash3bQ8BGG7 4931406G06Rik-201ENSMUST00000147848 1252 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Ubash3bQ8BGG7 Hspb9-202ENSMUST00000169833 726 ntAPPRIS P2 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Ubash3bQ8BGG7 Gm10320-201ENSMUST00000170205 527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Ubash3bQ8BGG7 Gm20033-203ENSMUST00000180912 796 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Ubash3bQ8BGG7 Rpl36-ps9-201ENSMUST00000196458 277 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Ubash3bQ8BGG7 Gm8579-201ENSMUST00000201943 733 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Ubash3bQ8BGG7 Gm6905-201ENSMUST00000205729 511 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Ubash3bQ8BGG7 Gm8342-201ENSMUST00000209839 757 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Ubash3bQ8BGG7 Gm33175-201ENSMUST00000211562 461 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Ubash3bQ8BGG7 AC148334.1-201ENSMUST00000220853 370 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Ubash3bQ8BGG7 CT009713.8-202ENSMUST00000224732 385 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Ubash3bQ8BGG7 Cox6a2-201ENSMUST00000033049 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Ubash3bQ8BGG7 Dnali1-201ENSMUST00000036383 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Ubash3bQ8BGG7 Dnajc17-201ENSMUST00000038439 1008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Ubash3bQ8BGG7 Tcf21-201ENSMUST00000049930 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Ubash3bQ8BGG7 Wfdc21-201ENSMUST00000070832 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Ubash3bQ8BGG7 Bbip1-201ENSMUST00000135402 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Ubash3bQ8BGG7 Ankrd34c-202ENSMUST00000185470 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Ubash3bQ8BGG7 Zmynd8-221ENSMUST00000177633 5093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Ubash3bQ8BGG7 1700061G19Rik-201ENSMUST00000025048 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Ubash3bQ8BGG7 Exosc10-202ENSMUST00000076022 2682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Ubash3bQ8BGG7 Wif1-203ENSMUST00000175867 2183 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Ubash3bQ8BGG7 Msh3-202ENSMUST00000185852 3946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Ubash3bQ8BGG7 Dido1-204ENSMUST00000103055 4613 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Ubash3bQ8BGG7 Pofut1-207ENSMUST00000152390 4833 ntTSL 2 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Ubash3bQ8BGG7 Dab2-211ENSMUST00000161812 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Ubash3bQ8BGG7 Tceal8-204ENSMUST00000163584 2358 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Ubash3bQ8BGG7 Ddx3x-201ENSMUST00000000804 4692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Ubash3bQ8BGG7 Cops7a-202ENSMUST00000112439 1328 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Ubash3bQ8BGG7 Krtap10-10-201ENSMUST00000218843 1306 ntAPPRIS P1 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Ubash3bQ8BGG7 Ppp2r1b-201ENSMUST00000034560 3647 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Ubash3bQ8BGG7 Specc1l-201ENSMUST00000040105 5928 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Ubash3bQ8BGG7 Krt75-201ENSMUST00000042957 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Ubash3bQ8BGG7 CT010462.1-202ENSMUST00000222225 2225 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Ubash3bQ8BGG7 Gm17540-201ENSMUST00000181617 1528 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Ubash3bQ8BGG7 Gm40617-201ENSMUST00000218840 2420 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Ubash3bQ8BGG7 Gm15958-202ENSMUST00000153479 2087 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Ubash3bQ8BGG7 Kif3c-201ENSMUST00000020999 6791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.2 ms