Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGA3

Lrrtm2, Leucine-rich repeat transmembrane neuronal protein 2, mousemouse

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Length 515 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrtm2Q8BGA3 Fam114a2-201ENSMUST00000020831 2557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Lrrtm2Q8BGA3 Camk2g-201ENSMUST00000071816 3703 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Lrrtm2Q8BGA3 4631405K08Rik-201ENSMUST00000180420 2112 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Lrrtm2Q8BGA3 A230077H06Rik-202ENSMUST00000189574 2477 ntTSL 2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Lrrtm2Q8BGA3 Ttc23-201ENSMUST00000032774 2492 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Lrrtm2Q8BGA3 Gm45576-201ENSMUST00000210981 1322 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Lrrtm2Q8BGA3 Gm19040-201ENSMUST00000203280 4726 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Lrrtm2Q8BGA3 Pfkfb3-202ENSMUST00000049849 2076 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Lrrtm2Q8BGA3 Plscr3-203ENSMUST00000108633 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Lrrtm2Q8BGA3 Slc18a1-201ENSMUST00000037478 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Lrrtm2Q8BGA3 Mir680-2-201ENSMUST00000102163 110 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Lrrtm2Q8BGA3 Gm23251-201ENSMUST00000103773 110 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Lrrtm2Q8BGA3 Eef1d-207ENSMUST00000116440 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Lrrtm2Q8BGA3 Cspp1-204ENSMUST00000119714 1268 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Lrrtm2Q8BGA3 Vmn1r-ps104-201ENSMUST00000120960 771 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Lrrtm2Q8BGA3 Gm16341-201ENSMUST00000126385 377 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Lrrtm2Q8BGA3 4930506C21Rik-203ENSMUST00000130639 909 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Lrrtm2Q8BGA3 9130204K15Rik-202ENSMUST00000150312 696 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Lrrtm2Q8BGA3 Gm1667-201ENSMUST00000151651 558 ntTSL 3 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Lrrtm2Q8BGA3 Gm6397-201ENSMUST00000161973 1069 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Lrrtm2Q8BGA3 Olfml3-204ENSMUST00000169286 874 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Lrrtm2Q8BGA3 Gm6407-201ENSMUST00000176468 549 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Lrrtm2Q8BGA3 Gm7741-201ENSMUST00000181445 989 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Lrrtm2Q8BGA3 Gm27184-201ENSMUST00000185095 607 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Lrrtm2Q8BGA3 Gm37695-201ENSMUST00000191765 530 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Lrrtm2Q8BGA3 1700039I01Rik-201ENSMUST00000194370 479 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Lrrtm2Q8BGA3 Pmvk-204ENSMUST00000198440 978 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Lrrtm2Q8BGA3 Gm9353-201ENSMUST00000200472 604 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Lrrtm2Q8BGA3 Gm7504-201ENSMUST00000201449 424 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Lrrtm2Q8BGA3 Pgam2-201ENSMUST00000020768 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Lrrtm2Q8BGA3 Gm13522-202ENSMUST00000209682 997 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Lrrtm2Q8BGA3 Gm5996-201ENSMUST00000211110 718 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Lrrtm2Q8BGA3 Cct2-206ENSMUST00000219573 637 ntTSL 3 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Lrrtm2Q8BGA3 AC154849.4-201ENSMUST00000224868 365 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Lrrtm2Q8BGA3 Gm1821-202ENSMUST00000227415 750 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Lrrtm2Q8BGA3 Krtap19-5-201ENSMUST00000053460 483 ntAPPRIS P1 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Lrrtm2Q8BGA3 Cd320-202ENSMUST00000087559 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Lrrtm2Q8BGA3 Gm7551-201ENSMUST00000089593 1074 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Lrrtm2Q8BGA3 Ccdc129-201ENSMUST00000044729 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Lrrtm2Q8BGA3 Dkk2-201ENSMUST00000029665 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Lrrtm2Q8BGA3 Nudt13-207ENSMUST00000224311 1574 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Lrrtm2Q8BGA3 Hepacam-201ENSMUST00000051839 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Lrrtm2Q8BGA3 Hectd4-201ENSMUST00000042614 15482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Lrrtm2Q8BGA3 Usp17le-202ENSMUST00000211384 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Lrrtm2Q8BGA3 Cage1-201ENSMUST00000074969 2856 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Lrrtm2Q8BGA3 Gm12153-201ENSMUST00000148504 2509 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Lrrtm2Q8BGA3 Zfp420-202ENSMUST00000074876 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Lrrtm2Q8BGA3 Sphk2-202ENSMUST00000107737 3548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Lrrtm2Q8BGA3 Col6a4-201ENSMUST00000121963 7371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Lrrtm2Q8BGA3 Paqr8-203ENSMUST00000187651 1463 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Lrrtm2Q8BGA3 Brat1-202ENSMUST00000100505 3431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Lrrtm2Q8BGA3 Arhgef7-203ENSMUST00000098938 4628 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Lrrtm2Q8BGA3 Gpr146-203ENSMUST00000100514 4264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Lrrtm2Q8BGA3 Prdm5-204ENSMUST00000172638 1714 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Lrrtm2Q8BGA3 Ephx1-201ENSMUST00000036928 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Lrrtm2Q8BGA3 Slc6a21-201ENSMUST00000085364 1732 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Lrrtm2Q8BGA3 Fam234b-201ENSMUST00000111915 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Lrrtm2Q8BGA3 Eps8l1-204ENSMUST00000163893 3868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Lrrtm2Q8BGA3 Gm35021-201ENSMUST00000210105 2329 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Lrrtm2Q8BGA3 Gm12296-201ENSMUST00000144922 3220 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Lrrtm2Q8BGA3 Fcna-201ENSMUST00000028307 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Lrrtm2Q8BGA3 AC129336.1-201ENSMUST00000220224 2277 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Lrrtm2Q8BGA3 Zfp280d-211ENSMUST00000184036 3459 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Lrrtm2Q8BGA3 Pax6-225ENSMUST00000167211 2814 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Lrrtm2Q8BGA3 Atp6v0e2-202ENSMUST00000203011 1612 ntTSL 2 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Lrrtm2Q8BGA3 Gm6793-201ENSMUST00000071732 1604 ntAPPRIS P1 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Lrrtm2Q8BGA3 Cox17-202ENSMUST00000120495 3690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Lrrtm2Q8BGA3 Ankrd34c-202ENSMUST00000185470 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Lrrtm2Q8BGA3 Slc35a4-201ENSMUST00000036158 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Lrrtm2Q8BGA3 Wif1-203ENSMUST00000175867 2183 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Lrrtm2Q8BGA3 Cldn19-202ENSMUST00000094823 4168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Lrrtm2Q8BGA3 Gm22920-201ENSMUST00000102175 109 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Lrrtm2Q8BGA3 Gm826-202ENSMUST00000109475 803 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Lrrtm2Q8BGA3 Fam129a-203ENSMUST00000111875 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Lrrtm2Q8BGA3 Gm15617-201ENSMUST00000118973 771 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Lrrtm2Q8BGA3 Gm6506-201ENSMUST00000119775 1136 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Lrrtm2Q8BGA3 Gm15549-201ENSMUST00000121595 622 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Lrrtm2Q8BGA3 Rxrg-201ENSMUST00000015987 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Lrrtm2Q8BGA3 Omt2a-203ENSMUST00000166056 1167 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Lrrtm2Q8BGA3 Dusp13-211ENSMUST00000183943 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Lrrtm2Q8BGA3 Gm43852-201ENSMUST00000202098 917 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Lrrtm2Q8BGA3 Klk1b19-ps-201ENSMUST00000205322 696 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Lrrtm2Q8BGA3 Gm7207-201ENSMUST00000211575 1067 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Lrrtm2Q8BGA3 Gm40578-201ENSMUST00000220837 390 ntTSL 2 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Lrrtm2Q8BGA3 Gm40576-201ENSMUST00000221773 1152 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Lrrtm2Q8BGA3 Lsamp-201ENSMUST00000078873 2951 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Lrrtm2Q8BGA3 Hist1h1b-201ENSMUST00000080511 743 ntAPPRIS P1 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Lrrtm2Q8BGA3 Sh2d2a-202ENSMUST00000107581 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Lrrtm2Q8BGA3 Chrm1-202ENSMUST00000163785 6271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Lrrtm2Q8BGA3 Slco2a1-201ENSMUST00000035148 7122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Lrrtm2Q8BGA3 Gm4419-201ENSMUST00000180671 1729 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Lrrtm2Q8BGA3 Bcl2l2-203ENSMUST00000133397 3813 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Lrrtm2Q8BGA3 Camk1d-201ENSMUST00000044009 6962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Lrrtm2Q8BGA3 Rpgrip1-202ENSMUST00000111603 5380 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Lrrtm2Q8BGA3 Trim46-203ENSMUST00000107464 3252 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Lrrtm2Q8BGA3 Vstm2a-201ENSMUST00000109645 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Lrrtm2Q8BGA3 Clip1-202ENSMUST00000063905 4589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Lrrtm2Q8BGA3 Fam53a-203ENSMUST00000065162 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Lrrtm2Q8BGA3 Mrgpre-201ENSMUST00000054048 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Lrrtm2Q8BGA3 Gm5171-201ENSMUST00000214944 1415 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
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