Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSQ1

Clec18a, C-type lectin domain family 18 member A, mousemouse

Predictions only

Length 534 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clec18aQ7TSQ1 Bpgm-201ENSMUST00000045372 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Clec18aQ7TSQ1 Aff3-202ENSMUST00000039827 6010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Clec18aQ7TSQ1 Sh3gl2-201ENSMUST00000030212 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Clec18aQ7TSQ1 Alms1-ps2-202ENSMUST00000161983 2290 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Clec18aQ7TSQ1 Harbi1-202ENSMUST00000111322 1316 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Clec18aQ7TSQ1 Cfap161-201ENSMUST00000011298 1335 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Clec18aQ7TSQ1 Ndrg4-203ENSMUST00000080666 2738 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Clec18aQ7TSQ1 Stx7-205ENSMUST00000220041 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Clec18aQ7TSQ1 A930016O22Rik-202ENSMUST00000208685 2349 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Clec18aQ7TSQ1 Gm4409-201ENSMUST00000130734 1919 ntTSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Clec18aQ7TSQ1 Ptp4a3-203ENSMUST00000165541 3539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Clec18aQ7TSQ1 Tmem8b-209ENSMUST00000167153 4101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Clec18aQ7TSQ1 9330111N05Rik-203ENSMUST00000181508 1848 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Clec18aQ7TSQ1 Gm14005-209ENSMUST00000224993 1832 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Clec18aQ7TSQ1 Plekhg2-201ENSMUST00000094644 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Clec18aQ7TSQ1 Spata5-201ENSMUST00000029277 2890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Clec18aQ7TSQ1 Gm15411-201ENSMUST00000133243 3488 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Clec18aQ7TSQ1 Kcnab2-207ENSMUST00000160884 3922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Clec18aQ7TSQ1 Clcc1-202ENSMUST00000106609 2043 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Clec18aQ7TSQ1 0610010K14Rik-206ENSMUST00000108576 576 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Clec18aQ7TSQ1 Gm13549-201ENSMUST00000118339 796 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Clec18aQ7TSQ1 Gm15329-201ENSMUST00000121408 155 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Clec18aQ7TSQ1 Gm12446-201ENSMUST00000123933 798 ntTSL 3 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Clec18aQ7TSQ1 BB557941-201ENSMUST00000126549 1097 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Clec18aQ7TSQ1 2810403D21Rik-208ENSMUST00000153212 1005 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Clec18aQ7TSQ1 Ighv2-1-201ENSMUST00000170946 353 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Clec18aQ7TSQ1 Zfp516-202ENSMUST00000171238 7725 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Clec18aQ7TSQ1 Ddt-202ENSMUST00000172820 574 ntTSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Clec18aQ7TSQ1 AC238811.4-201ENSMUST00000178019 1246 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Clec18aQ7TSQ1 AC238940.3-201ENSMUST00000178830 1246 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Clec18aQ7TSQ1 Kbtbd12-206ENSMUST00000184878 3351 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Clec18aQ7TSQ1 Mrpl20-206ENSMUST00000185148 494 ntTSL 3 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Clec18aQ7TSQ1 Gm17825-201ENSMUST00000206836 794 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Clec18aQ7TSQ1 Gm39168-201ENSMUST00000210181 1423 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Clec18aQ7TSQ1 AC122346.3-201ENSMUST00000223983 306 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Clec18aQ7TSQ1 Zfp516-201ENSMUST00000071233 7703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
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Clec18aQ7TSQ1 Gm8325-201ENSMUST00000099086 453 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Clec18aQ7TSQ1 Nxpe5-203ENSMUST00000159964 3585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Clec18aQ7TSQ1 Lingo1-201ENSMUST00000053568 3295 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Clec18aQ7TSQ1 Mobp-202ENSMUST00000093773 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
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Clec18aQ7TSQ1 Cct3-208ENSMUST00000168062 1943 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Clec18aQ7TSQ1 Fgd5-202ENSMUST00000113466 5621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Clec18aQ7TSQ1 Gm6793-201ENSMUST00000071732 1604 ntAPPRIS P1 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Clec18aQ7TSQ1 Gm11413-201ENSMUST00000155822 1461 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Clec18aQ7TSQ1 Rnf133-202ENSMUST00000115354 1333 ntAPPRIS P1 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Clec18aQ7TSQ1 6820426E19Rik-201ENSMUST00000204274 1970 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Clec18aQ7TSQ1 Kat7-205ENSMUST00000107734 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Clec18aQ7TSQ1 Kcnk10-201ENSMUST00000110113 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
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Clec18aQ7TSQ1 Pdlim2-201ENSMUST00000022681 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Clec18aQ7TSQ1 Zfp280b-201ENSMUST00000061617 5097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Clec18aQ7TSQ1 Gfra2-201ENSMUST00000022699 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Clec18aQ7TSQ1 AC158636.1-201ENSMUST00000220118 1393 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Clec18aQ7TSQ1 Tcn2-207ENSMUST00000109993 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Clec18aQ7TSQ1 Alx1-203ENSMUST00000167156 2689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Clec18aQ7TSQ1 Corin-202ENSMUST00000167460 4639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Clec18aQ7TSQ1 Clpb-211ENSMUST00000209579 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Clec18aQ7TSQ1 Nfe2l1-212ENSMUST00000169828 3530 ntTSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
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Clec18aQ7TSQ1 Pak6-201ENSMUST00000099557 4411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
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Clec18aQ7TSQ1 Tdrd9-201ENSMUST00000079009 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Clec18aQ7TSQ1 Cyb5b-201ENSMUST00000034400 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Clec18aQ7TSQ1 Mdh1-201ENSMUST00000102874 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Clec18aQ7TSQ1 Rps10-202ENSMUST00000114881 604 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Clec18aQ7TSQ1 Olfr1267-ps1-201ENSMUST00000118957 930 ntAPPRIS P1 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Clec18aQ7TSQ1 Gm21987-201ENSMUST00000119704 456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Clec18aQ7TSQ1 Gm12783-201ENSMUST00000121425 397 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Clec18aQ7TSQ1 Gm15549-201ENSMUST00000121595 622 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Clec18aQ7TSQ1 Spata3-207ENSMUST00000135440 732 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Clec18aQ7TSQ1 Gm13869-201ENSMUST00000146978 1054 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Clec18aQ7TSQ1 Gm16553-201ENSMUST00000160490 716 ntTSL 3 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Clec18aQ7TSQ1 Gm21844-201ENSMUST00000178699 663 ntTSL 3 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Clec18aQ7TSQ1 Gm10100-201ENSMUST00000179726 363 ntAPPRIS P1 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Clec18aQ7TSQ1 Gm29179-208ENSMUST00000190450 1137 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Clec18aQ7TSQ1 Gm9884-201ENSMUST00000194343 1222 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Clec18aQ7TSQ1 Gm37634-201ENSMUST00000195700 650 ntTSL 3 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Clec18aQ7TSQ1 Gm43163-201ENSMUST00000196571 442 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Clec18aQ7TSQ1 Gm43634-201ENSMUST00000202671 675 ntTSL 3 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Clec18aQ7TSQ1 2010109P13Rik-201ENSMUST00000204605 392 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Clec18aQ7TSQ1 1700003I16Rik-201ENSMUST00000205198 1058 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Clec18aQ7TSQ1 Psenen-203ENSMUST00000207747 669 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Clec18aQ7TSQ1 Gm30671-201ENSMUST00000214898 318 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Clec18aQ7TSQ1 AC164618.2-201ENSMUST00000224770 573 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Clec18aQ7TSQ1 AC154532.1-201ENSMUST00000227860 965 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Clec18aQ7TSQ1 Spata3-201ENSMUST00000052854 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Clec18aQ7TSQ1 Krtap19-5-201ENSMUST00000053460 483 ntAPPRIS P1 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Clec18aQ7TSQ1 Vmn1r222-201ENSMUST00000077116 1054 ntAPPRIS P1 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Clec18aQ7TSQ1 Gm6509-201ENSMUST00000098286 1218 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Clec18aQ7TSQ1 Hars2-206ENSMUST00000152954 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
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