Protein–RNA interactions for Protein: Q6VGS5

Ccdc88c, Protein Daple, mousemouse

Predictions only

Length 2,009 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc88cQ6VGS5 Plek2-201ENSMUST00000021544 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Ccdc88cQ6VGS5 Ppp2r5c-205ENSMUST00000221715 2367 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Ccdc88cQ6VGS5 Gm6793-201ENSMUST00000071732 1604 ntAPPRIS P1 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Ccdc88cQ6VGS5 Gtf2ird1-207ENSMUST00000111245 3299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Ccdc88cQ6VGS5 D830039M14Rik-202ENSMUST00000217740 3362 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
Ccdc88cQ6VGS5 Stx17-203ENSMUST00000107721 1771 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Ccdc88cQ6VGS5 Meltf-201ENSMUST00000023464 4133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Ccdc88cQ6VGS5 Mapkap1-209ENSMUST00000147337 3111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Ccdc88cQ6VGS5 Agpat5-202ENSMUST00000149565 10779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Ccdc88cQ6VGS5 Golga4-201ENSMUST00000084820 7583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Ccdc88cQ6VGS5 Gm11554-201ENSMUST00000105056 890 ntAPPRIS P1 BASIC12.21□□□□□ -0.46
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Ccdc88cQ6VGS5 Gm13290-201ENSMUST00000177806 968 ntAPPRIS P1 BASIC12.21□□□□□ -0.46
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Ccdc88cQ6VGS5 Gapdhs-203ENSMUST00000182634 1457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
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Ccdc88cQ6VGS5 Thoc6-202ENSMUST00000095579 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Ccdc88cQ6VGS5 Smtn-202ENSMUST00000020721 3335 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
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Ccdc88cQ6VGS5 Tmcc2-203ENSMUST00000132435 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Ccdc88cQ6VGS5 Eif2s3y-201ENSMUST00000091197 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
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Ccdc88cQ6VGS5 Csnk1a1-204ENSMUST00000165123 4083 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Ccdc88cQ6VGS5 Gtf2i-210ENSMUST00000173341 4302 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
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Ccdc88cQ6VGS5 Clip1-202ENSMUST00000063905 4589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Ccdc88cQ6VGS5 Snap23-201ENSMUST00000028743 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
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Ccdc88cQ6VGS5 Spop-201ENSMUST00000107722 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Ccdc88cQ6VGS5 Bbs2-201ENSMUST00000034206 3064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Ccdc88cQ6VGS5 Alms1-ps2-202ENSMUST00000161983 2290 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
Ccdc88cQ6VGS5 Dcun1d2-204ENSMUST00000110840 2853 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
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Ccdc88cQ6VGS5 Arid3a-201ENSMUST00000019708 5361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
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Ccdc88cQ6VGS5 Oma1-201ENSMUST00000035780 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Ccdc88cQ6VGS5 Mrpl55-205ENSMUST00000108787 718 ntTSL 2 BASIC12.19□□□□□ -0.46
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Ccdc88cQ6VGS5 Gm5944-201ENSMUST00000118182 1001 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.6 ms