Protein–RNA interactions for Protein: Q6DFW4

Nop58, Nucleolar protein 58, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 536 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nop58Q6DFW4 Gm16282-201ENSMUST00000162641 451 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nop58Q6DFW4 Gm17058-201ENSMUST00000168951 928 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nop58Q6DFW4 Gm10807-201ENSMUST00000177134 795 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Nop58Q6DFW4 1110059E24Rik-208ENSMUST00000179768 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nop58Q6DFW4 H2-Bl-202ENSMUST00000183560 316 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nop58Q6DFW4 Gm38002-201ENSMUST00000193255 180 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Nop58Q6DFW4 Gm43401-201ENSMUST00000198829 394 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nop58Q6DFW4 Lysmd4-208ENSMUST00000208698 551 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nop58Q6DFW4 4930447A16Rik-201ENSMUST00000022897 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nop58Q6DFW4 Syk-202ENSMUST00000118756 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nop58Q6DFW4 Gm26625-201ENSMUST00000181519 2538 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nop58Q6DFW4 Aplp2-201ENSMUST00000072634 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nop58Q6DFW4 Zcchc4-201ENSMUST00000031077 5743 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nop58Q6DFW4 AC113282.1-201ENSMUST00000225278 1707 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nop58Q6DFW4 Atp6v0a4-201ENSMUST00000040259 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nop58Q6DFW4 Zfp780b-201ENSMUST00000081618 3004 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nop58Q6DFW4 Adat1-201ENSMUST00000034427 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nop58Q6DFW4 Sun1-204ENSMUST00000110882 2454 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nop58Q6DFW4 Cpeb1-209ENSMUST00000178892 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nop58Q6DFW4 Gm43517-201ENSMUST00000110746 3904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nop58Q6DFW4 Ogdh-204ENSMUST00000101554 4106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nop58Q6DFW4 Gramd2-201ENSMUST00000098661 1368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nop58Q6DFW4 Apol9a-202ENSMUST00000089452 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nop58Q6DFW4 Mical1-201ENSMUST00000019967 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nop58Q6DFW4 Katnal2-208ENSMUST00000137498 1824 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nop58Q6DFW4 Cct3-201ENSMUST00000001452 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nop58Q6DFW4 Rnf43-202ENSMUST00000092800 4037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nop58Q6DFW4 C2cd5-204ENSMUST00000203187 3494 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nop58Q6DFW4 Ctsa-202ENSMUST00000103092 3646 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nop58Q6DFW4 Adam12-201ENSMUST00000067680 7675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nop58Q6DFW4 Gm25148-201ENSMUST00000104611 123 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Nop58Q6DFW4 Kif3a-202ENSMUST00000118353 2178 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nop58Q6DFW4 AI854703-202ENSMUST00000154570 3806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nop58Q6DFW4 Fhit-204ENSMUST00000161302 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nop58Q6DFW4 Gm8459-201ENSMUST00000162504 760 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Nop58Q6DFW4 Gm17150-201ENSMUST00000165577 381 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Nop58Q6DFW4 Neu2-207ENSMUST00000172222 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nop58Q6DFW4 Glmp-208ENSMUST00000176519 447 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nop58Q6DFW4 Gm5852-201ENSMUST00000194119 1021 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Nop58Q6DFW4 Rprl1-202ENSMUST00000198476 238 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
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Nop58Q6DFW4 Rpl18-208ENSMUST00000211061 552 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nop58Q6DFW4 Saa-ps-201ENSMUST00000211148 320 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Nop58Q6DFW4 Gm19208-201ENSMUST00000213861 912 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Nop58Q6DFW4 Slc6a18-204ENSMUST00000220650 1728 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nop58Q6DFW4 Aco2-201ENSMUST00000023116 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nop58Q6DFW4 Sit1-201ENSMUST00000030180 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nop58Q6DFW4 Mcee-201ENSMUST00000037205 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nop58Q6DFW4 3300002I08Rik-201ENSMUST00000051153 650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nop58Q6DFW4 4930432K21Rik-201ENSMUST00000093375 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nop58Q6DFW4 Lig4-201ENSMUST00000095476 5028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nop58Q6DFW4 Shank2-201ENSMUST00000097929 4418 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nop58Q6DFW4 Myh10-204ENSMUST00000108673 1315 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nop58Q6DFW4 Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 5407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nop58Q6DFW4 Pdpk1-202ENSMUST00000102927 7161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nop58Q6DFW4 Gm32219-201ENSMUST00000221234 1819 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nop58Q6DFW4 Ano2-204ENSMUST00000160496 3925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
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Nop58Q6DFW4 Gm6170-201ENSMUST00000187672 1388 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Nop58Q6DFW4 Srpk1-204ENSMUST00000130643 4465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nop58Q6DFW4 Apobr-201ENSMUST00000039522 3685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nop58Q6DFW4 Gm37660-201ENSMUST00000192754 1732 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Nop58Q6DFW4 Zfp366-201ENSMUST00000056558 6382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nop58Q6DFW4 Rgs12-204ENSMUST00000114281 3439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nop58Q6DFW4 Ahrr-202ENSMUST00000109640 2419 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nop58Q6DFW4 Lingo1-206ENSMUST00000210032 3627 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nop58Q6DFW4 Derl2-202ENSMUST00000108523 884 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nop58Q6DFW4 Styxl1-205ENSMUST00000111164 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
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Nop58Q6DFW4 Rps28-202ENSMUST00000166693 271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nop58Q6DFW4 Gm26854-201ENSMUST00000180418 705 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nop58Q6DFW4 2610016A17Rik-202ENSMUST00000186768 689 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
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Nop58Q6DFW4 Psmb2-201ENSMUST00000030642 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nop58Q6DFW4 Coq7-202ENSMUST00000098090 1215 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nop58Q6DFW4 Wdr78-201ENSMUST00000036451 3671 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nop58Q6DFW4 P4ha1-201ENSMUST00000009789 4043 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nop58Q6DFW4 Gm45140-202ENSMUST00000204419 5061 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nop58Q6DFW4 Ppm1f-201ENSMUST00000027373 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nop58Q6DFW4 Rbbp5-201ENSMUST00000027700 3385 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nop58Q6DFW4 Pla2g4a-201ENSMUST00000070200 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nop58Q6DFW4 Nudcd3-201ENSMUST00000066496 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nop58Q6DFW4 Spata31d1a-201ENSMUST00000066510 4261 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nop58Q6DFW4 Gm43143-201ENSMUST00000196083 2023 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Nop58Q6DFW4 Exoc4-202ENSMUST00000090381 2598 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nop58Q6DFW4 Fhl1-204ENSMUST00000114772 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nop58Q6DFW4 Pop1-201ENSMUST00000052290 3395 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nop58Q6DFW4 Madd-204ENSMUST00000077941 5990 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nop58Q6DFW4 Madd-205ENSMUST00000099723 5977 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nop58Q6DFW4 AC153370.2-201ENSMUST00000217920 3093 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nop58Q6DFW4 App-206ENSMUST00000227723 8167 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nop58Q6DFW4 Hmgcr-201ENSMUST00000022176 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nop58Q6DFW4 Mybph-201ENSMUST00000038445 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nop58Q6DFW4 Hcrtr2-203ENSMUST00000184757 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nop58Q6DFW4 Pcdh15-233ENSMUST00000191709 5346 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nop58Q6DFW4 Ndufb2-205ENSMUST00000135671 4371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nop58Q6DFW4 Trgv2-201ENSMUST00000103563 491 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nop58Q6DFW4 Thoc6-203ENSMUST00000115489 1083 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nop58Q6DFW4 Leng8-202ENSMUST00000117274 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nop58Q6DFW4 Gm16341-201ENSMUST00000126385 377 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
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