Protein–RNA interactions for Protein: Q68FH0

Pkp4, Plakophilin-4, mousemouse

Predictions only

Length 1,190 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkp4Q68FH0 Bicd2-202ENSMUST00000110084 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Pkp4Q68FH0 Ciita-201ENSMUST00000023147 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Pkp4Q68FH0 Samd4-206ENSMUST00000137543 6874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Pkp4Q68FH0 Gm5822-201ENSMUST00000161562 1378 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Pkp4Q68FH0 Prkaca-202ENSMUST00000211558 1399 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Pkp4Q68FH0 Atxn7l1-204ENSMUST00000125192 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Pkp4Q68FH0 Ppp1r16b-203ENSMUST00000103116 6370 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Pkp4Q68FH0 Slc25a25-202ENSMUST00000052119 3529 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Pkp4Q68FH0 Tctn3-201ENSMUST00000025981 2743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Pkp4Q68FH0 Slc4a9-201ENSMUST00000074298 2714 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Pkp4Q68FH0 Rnf20-201ENSMUST00000029989 4154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Pkp4Q68FH0 Cacna1c-219ENSMUST00000189389 6603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Pkp4Q68FH0 4921507G05Rik-201ENSMUST00000181348 1653 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Pkp4Q68FH0 Igsf1-204ENSMUST00000114893 2671 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Pkp4Q68FH0 Nox4-201ENSMUST00000032781 3753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Pkp4Q68FH0 Gm10436-202ENSMUST00000220521 1788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Pkp4Q68FH0 Acot9-201ENSMUST00000026324 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Pkp4Q68FH0 Top3a-204ENSMUST00000120417 2318 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Pkp4Q68FH0 Col6a6-203ENSMUST00000166431 7098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Pkp4Q68FH0 Eid3-201ENSMUST00000211623 1305 ntAPPRIS P1 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Pkp4Q68FH0 Abi1-203ENSMUST00000093171 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Pkp4Q68FH0 Pcsk9-201ENSMUST00000049507 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Pkp4Q68FH0 Sptbn5-204ENSMUST00000156159 3625 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Pkp4Q68FH0 Zfp286-202ENSMUST00000108705 1979 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Pkp4Q68FH0 Atp1a2-202ENSMUST00000097464 3186 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Pkp4Q68FH0 Aqr-202ENSMUST00000102543 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Pkp4Q68FH0 Ptpru-202ENSMUST00000097860 3365 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Pkp4Q68FH0 A130071D04Rik-201ENSMUST00000194467 5864 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Pkp4Q68FH0 Tmem8b-209ENSMUST00000167153 4101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Pkp4Q68FH0 Gripap1-203ENSMUST00000115675 3015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Pkp4Q68FH0 Araf-201ENSMUST00000001155 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Pkp4Q68FH0 Slc13a5-202ENSMUST00000137701 1746 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Pkp4Q68FH0 Ankrd53-201ENSMUST00000014891 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Pkp4Q68FH0 Syn2-202ENSMUST00000169345 3854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Pkp4Q68FH0 Wars-204ENSMUST00000161154 1824 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Pkp4Q68FH0 Tyro3-202ENSMUST00000110783 4460 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Pkp4Q68FH0 Camk2a-205ENSMUST00000115297 499 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Pkp4Q68FH0 Gm11949-201ENSMUST00000117640 372 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Pkp4Q68FH0 Sec11a-204ENSMUST00000120285 875 ntTSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Pkp4Q68FH0 Olfr647-ps1-201ENSMUST00000121599 960 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
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Pkp4Q68FH0 Prr3-206ENSMUST00000173585 770 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Pkp4Q68FH0 Mir5120-201ENSMUST00000175020 78 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Pkp4Q68FH0 Gm29264-201ENSMUST00000191240 1264 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Pkp4Q68FH0 C630004L07Rik-201ENSMUST00000193236 1275 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Pkp4Q68FH0 Gm45339-201ENSMUST00000210823 877 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
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Pkp4Q68FH0 AC115122.1-201ENSMUST00000224850 1040 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
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Pkp4Q68FH0 Ipo4-201ENSMUST00000047131 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Pkp4Q68FH0 Cyp4f16-208ENSMUST00000169591 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Pkp4Q68FH0 Batf2-201ENSMUST00000045042 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Pkp4Q68FH0 Snhg18-201ENSMUST00000181536 1486 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
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Pkp4Q68FH0 Fntb-201ENSMUST00000041008 2613 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Pkp4Q68FH0 Tnpo3-201ENSMUST00000012679 4251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Pkp4Q68FH0 Zcchc4-201ENSMUST00000031077 5743 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Pkp4Q68FH0 Srsf6-203ENSMUST00000130411 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Pkp4Q68FH0 Camk1g-201ENSMUST00000016323 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Pkp4Q68FH0 Fbln2-202ENSMUST00000113498 4644 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Pkp4Q68FH0 Pcnt-201ENSMUST00000001179 9331 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Pkp4Q68FH0 Mobp-202ENSMUST00000093773 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Pkp4Q68FH0 Svop-201ENSMUST00000058472 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Pkp4Q68FH0 Srgap3-202ENSMUST00000088373 8887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Pkp4Q68FH0 Zfp354a-204ENSMUST00000109122 4165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.71
Pkp4Q68FH0 Tiam1-203ENSMUST00000114122 4596 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
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Pkp4Q68FH0 Pdcd10-205ENSMUST00000161137 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Pkp4Q68FH0 Tube1-201ENSMUST00000019991 2929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Pkp4Q68FH0 Zdhhc21-201ENSMUST00000030110 8763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Pkp4Q68FH0 Dusp22-202ENSMUST00000095914 3015 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Pkp4Q68FH0 Mcf2l-202ENSMUST00000098927 3215 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Pkp4Q68FH0 Hipk2-204ENSMUST00000160360 3907 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Pkp4Q68FH0 Inf2-201ENSMUST00000101029 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Pkp4Q68FH0 Wdr78-203ENSMUST00000106868 4045 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Pkp4Q68FH0 Asap1-202ENSMUST00000110114 4409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Pkp4Q68FH0 Gm45140-202ENSMUST00000204419 5061 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Pkp4Q68FH0 Odf2-208ENSMUST00000113763 2364 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Pkp4Q68FH0 Gm43713-201ENSMUST00000198251 1896 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Pkp4Q68FH0 Gm3372-201ENSMUST00000198806 1792 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Pkp4Q68FH0 Gm14592-201ENSMUST00000117201 560 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Pkp4Q68FH0 Gm14398-201ENSMUST00000117287 1073 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Pkp4Q68FH0 Gm13422-201ENSMUST00000118834 504 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Pkp4Q68FH0 Gm15764-201ENSMUST00000150389 672 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Pkp4Q68FH0 Tmem116-209ENSMUST00000156080 1184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Pkp4Q68FH0 Gm16570-201ENSMUST00000161951 436 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Pkp4Q68FH0 Gm17231-202ENSMUST00000165858 663 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Pkp4Q68FH0 Mir7070-201ENSMUST00000183657 86 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Pkp4Q68FH0 Mir8115-201ENSMUST00000184992 119 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Pkp4Q68FH0 Gm28287-201ENSMUST00000186612 546 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Pkp4Q68FH0 Gm29019-202ENSMUST00000188623 564 ntTSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Pkp4Q68FH0 Mrnip-201ENSMUST00000020647 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Pkp4Q68FH0 AC159376.1-201ENSMUST00000218504 630 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Pkp4Q68FH0 Colec11-203ENSMUST00000220836 887 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Pkp4Q68FH0 Pbp2-201ENSMUST00000050471 1279 ntAPPRIS P1 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Pkp4Q68FH0 A330033J07Rik-201ENSMUST00000180921 2816 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Pkp4Q68FH0 Gm5859-201ENSMUST00000165401 2324 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Pkp4Q68FH0 Mybph-202ENSMUST00000191577 2320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Pkp4Q68FH0 Fgl2-201ENSMUST00000035799 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
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