Protein–RNA interactions for Protein: Q640P7

Tbccd1, TBCC domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 552 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tbccd1Q640P7 Aimp1-201ENSMUST00000029663 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Tbccd1Q640P7 Gatad2a-201ENSMUST00000065169 3812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Tbccd1Q640P7 1700029P11Rik-201ENSMUST00000074608 1024 ntAPPRIS P1 BASIC11□□□□□ -0.65
Tbccd1Q640P7 Krtap19-9b-201ENSMUST00000077715 461 ntAPPRIS P1 BASIC11□□□□□ -0.65
Tbccd1Q640P7 Tdpoz3-201ENSMUST00000081780 1098 ntAPPRIS P1 BASIC11□□□□□ -0.65
Tbccd1Q640P7 Gm8420-201ENSMUST00000097103 598 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Tbccd1Q640P7 Gm904-201ENSMUST00000099519 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Tbccd1Q640P7 Epha5-206ENSMUST00000113406 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Tbccd1Q640P7 Copz1-201ENSMUST00000100162 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Tbccd1Q640P7 4930518I15Rik-201ENSMUST00000099141 1331 ntAPPRIS P1 BASIC11□□□□□ -0.65
Tbccd1Q640P7 Ankrd34c-202ENSMUST00000185470 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Tbccd1Q640P7 Cbx7-203ENSMUST00000109616 2899 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Tbccd1Q640P7 Mgmt-201ENSMUST00000081510 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Tbccd1Q640P7 Gm10419-202ENSMUST00000196693 2530 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Tbccd1Q640P7 Smtn-202ENSMUST00000020721 3335 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Tbccd1Q640P7 Ikbkg-205ENSMUST00000114129 2222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Tbccd1Q640P7 Bnc2-202ENSMUST00000107198 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Tbccd1Q640P7 Acsf2-201ENSMUST00000103164 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Tbccd1Q640P7 Stk31-201ENSMUST00000024171 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Tbccd1Q640P7 Prkd1-201ENSMUST00000002765 3653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Tbccd1Q640P7 Acacb-201ENSMUST00000031583 8482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Tbccd1Q640P7 Anxa3-205ENSMUST00000198631 1523 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Tbccd1Q640P7 Gmeb1-201ENSMUST00000030733 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Tbccd1Q640P7 Ccndbp1-202ENSMUST00000099488 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Tbccd1Q640P7 Hmgcs2-202ENSMUST00000120541 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Tbccd1Q640P7 Gm29050-201ENSMUST00000190732 2528 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Tbccd1Q640P7 Phactr1-206ENSMUST00000131942 2056 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Tbccd1Q640P7 Flnc-201ENSMUST00000065090 9038 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Tbccd1Q640P7 Slc39a14-202ENSMUST00000068044 4926 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Tbccd1Q640P7 Rxrg-201ENSMUST00000015987 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Tbccd1Q640P7 Tcte1-201ENSMUST00000113547 3074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Tbccd1Q640P7 Acsl6-208ENSMUST00000108899 1662 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Tbccd1Q640P7 Ecsit-204ENSMUST00000180180 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Tbccd1Q640P7 Zdhhc20-201ENSMUST00000089473 5186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Tbccd1Q640P7 Steap3-202ENSMUST00000112640 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Tbccd1Q640P7 Trim45-204ENSMUST00000134993 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Tbccd1Q640P7 Gm18806-201ENSMUST00000207607 1775 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Tbccd1Q640P7 Snord17-201ENSMUST00000104526 238 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Tbccd1Q640P7 Klra5-202ENSMUST00000118060 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Tbccd1Q640P7 Gm7113-201ENSMUST00000120477 958 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Tbccd1Q640P7 Scgb2b25-ps-201ENSMUST00000121936 307 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Tbccd1Q640P7 BB557941-201ENSMUST00000126549 1097 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Tbccd1Q640P7 Gm11656-201ENSMUST00000137462 395 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Tbccd1Q640P7 Klra5-201ENSMUST00000014683 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Tbccd1Q640P7 Vmn2r-ps54-203ENSMUST00000150856 1142 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Tbccd1Q640P7 Gm17115-201ENSMUST00000164075 885 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Tbccd1Q640P7 Gm20822-201ENSMUST00000165756 687 ntAPPRIS P1 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Tbccd1Q640P7 Gm8723-201ENSMUST00000166076 820 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Tbccd1Q640P7 Gm8701-201ENSMUST00000169259 874 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Tbccd1Q640P7 Gm20828-201ENSMUST00000170889 687 ntAPPRIS P1 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Tbccd1Q640P7 Malat1-205ENSMUST00000174808 656 ntTSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Tbccd1Q640P7 Ly6l-201ENSMUST00000177479 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Tbccd1Q640P7 Gm7929-201ENSMUST00000178711 624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Tbccd1Q640P7 Gm3015-202ENSMUST00000179803 624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Tbccd1Q640P7 Gm19013-201ENSMUST00000183895 1222 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Tbccd1Q640P7 Gm19014-201ENSMUST00000184828 1189 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Tbccd1Q640P7 1700065I16Rik-201ENSMUST00000185277 512 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Tbccd1Q640P7 Gm37213-201ENSMUST00000193077 586 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Tbccd1Q640P7 Itgax-203ENSMUST00000205460 1215 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Tbccd1Q640P7 Gm44814-201ENSMUST00000207018 434 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Tbccd1Q640P7 Gm18463-201ENSMUST00000207258 474 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Tbccd1Q640P7 Gm18460-201ENSMUST00000208088 464 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Tbccd1Q640P7 Cox6b1-204ENSMUST00000208838 354 ntTSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Tbccd1Q640P7 AC153932.1-201ENSMUST00000218558 787 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Tbccd1Q640P7 Gm6562-201ENSMUST00000221903 464 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Tbccd1Q640P7 1700105G05Rik-201ENSMUST00000222238 411 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Tbccd1Q640P7 Spata46-201ENSMUST00000056991 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Tbccd1Q640P7 Gm25580-201ENSMUST00000083409 327 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Tbccd1Q640P7 Gm7589-201ENSMUST00000085631 534 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Tbccd1Q640P7 Olfr547-201ENSMUST00000098229 936 ntAPPRIS P1 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Tbccd1Q640P7 A830018L16Rik-202ENSMUST00000135014 6451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Tbccd1Q640P7 1700036A12Rik-202ENSMUST00000190053 1828 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Tbccd1Q640P7 Nudt8-201ENSMUST00000155405 3904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Tbccd1Q640P7 Gm39204-201ENSMUST00000210045 1307 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Tbccd1Q640P7 Esco2-201ENSMUST00000022613 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Tbccd1Q640P7 Ntng2-202ENSMUST00000071201 1881 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Tbccd1Q640P7 Hkdc1-201ENSMUST00000020277 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Tbccd1Q640P7 Fam189b-201ENSMUST00000041913 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Tbccd1Q640P7 Apopt1-203ENSMUST00000162316 3107 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Tbccd1Q640P7 Spata7-201ENSMUST00000048402 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Tbccd1Q640P7 Nhlrc2-201ENSMUST00000071423 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Tbccd1Q640P7 Gpld1-201ENSMUST00000021773 5224 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Tbccd1Q640P7 Dnmt1-203ENSMUST00000178110 5870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Tbccd1Q640P7 Amotl2-211ENSMUST00000153965 4222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Tbccd1Q640P7 C530044C16Rik-201ENSMUST00000204275 1624 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Tbccd1Q640P7 Gm15991-202ENSMUST00000212123 3565 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Tbccd1Q640P7 Fbxo18-201ENSMUST00000071564 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Tbccd1Q640P7 Ildr1-201ENSMUST00000023617 3042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Tbccd1Q640P7 Npl-201ENSMUST00000041874 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Tbccd1Q640P7 3830432H09Rik-202ENSMUST00000188909 2414 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Tbccd1Q640P7 Tbx4-203ENSMUST00000108047 3153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Tbccd1Q640P7 Otub2-202ENSMUST00000101094 3228 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Tbccd1Q640P7 Spg11-201ENSMUST00000036450 7671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Tbccd1Q640P7 Lgi4-201ENSMUST00000039775 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Tbccd1Q640P7 Gm43727-201ENSMUST00000198021 2647 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Tbccd1Q640P7 Gp2-202ENSMUST00000207887 1853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Tbccd1Q640P7 Tcf4-234ENSMUST00000201410 1915 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Tbccd1Q640P7 AC164441.2-201ENSMUST00000220818 2746 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Tbccd1Q640P7 Fosb-203ENSMUST00000207716 3546 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Tbccd1Q640P7 Specc1-213ENSMUST00000202179 6676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.2 ms