Protein–RNA interactions for Protein: Q3UQ97

Gm5460, Predicted gene 5460, mousemouse

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Length 254 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5460Q3UQ97 Gm25063-201ENSMUST00000104666 94 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm5460Q3UQ97 Gm10169-201ENSMUST00000121822 348 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm5460Q3UQ97 Mir1901-201ENSMUST00000122616 78 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm5460Q3UQ97 4930583K01Rik-201ENSMUST00000138180 925 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm5460Q3UQ97 Gm14154-201ENSMUST00000142642 579 ntTSL 3 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm5460Q3UQ97 Gm15952-202ENSMUST00000144542 556 ntTSL 3 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm5460Q3UQ97 4631405J19Rik-204ENSMUST00000145926 936 ntTSL 3 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm5460Q3UQ97 Gm10631-201ENSMUST00000153288 494 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm5460Q3UQ97 AC158605.1-201ENSMUST00000156803 764 ntTSL 3 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm5460Q3UQ97 Rsph14-206ENSMUST00000166088 1203 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm5460Q3UQ97 U2af1l4-218ENSMUST00000166960 747 ntTSL 3 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm5460Q3UQ97 Gm3233-201ENSMUST00000168997 693 ntAPPRIS P1 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm5460Q3UQ97 Gm25072-201ENSMUST00000175233 235 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm5460Q3UQ97 Gm20714-202ENSMUST00000176436 748 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm5460Q3UQ97 Gm26134-201ENSMUST00000178484 110 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm5460Q3UQ97 Rsph14-207ENSMUST00000179546 1190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm5460Q3UQ97 Gm17798-201ENSMUST00000182282 1035 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm5460Q3UQ97 Gm9358-201ENSMUST00000183067 927 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm5460Q3UQ97 Nkx2-2os-202ENSMUST00000184407 458 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm5460Q3UQ97 Gm4753-201ENSMUST00000188327 1255 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm5460Q3UQ97 C630004L07Rik-201ENSMUST00000193236 1275 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm5460Q3UQ97 Gm42790-201ENSMUST00000201268 969 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm5460Q3UQ97 Bcl2l12-205ENSMUST00000207755 605 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
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Gm5460Q3UQ97 AC153152.3-201ENSMUST00000222188 1135 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm5460Q3UQ97 Atp6v1g1-201ENSMUST00000035301 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
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Gm5460Q3UQ97 Rsph14-201ENSMUST00000009214 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm5460Q3UQ97 n-R5s211-201ENSMUST00000093689 119 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm5460Q3UQ97 A230077H06Rik-202ENSMUST00000189574 2477 ntTSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm5460Q3UQ97 Hrc-201ENSMUST00000085351 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm5460Q3UQ97 Rgs8-201ENSMUST00000041776 8474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm5460Q3UQ97 Gm3764-205ENSMUST00000181134 2203 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm5460Q3UQ97 Rad51ap2-201ENSMUST00000124065 3175 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm5460Q3UQ97 Rad1-202ENSMUST00000100775 4085 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm5460Q3UQ97 Srpk3-201ENSMUST00000002081 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm5460Q3UQ97 Zfp110-201ENSMUST00000004614 3591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm5460Q3UQ97 Il34-201ENSMUST00000076846 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm5460Q3UQ97 Kcnma1-207ENSMUST00000172099 3354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm5460Q3UQ97 Nin-201ENSMUST00000021468 6708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm5460Q3UQ97 Plod3-201ENSMUST00000004968 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm5460Q3UQ97 Txndc16-203ENSMUST00000123879 4069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm5460Q3UQ97 Oplah-201ENSMUST00000023222 3970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm5460Q3UQ97 Slc17a5-202ENSMUST00000117645 3114 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm5460Q3UQ97 Epha7-204ENSMUST00000108194 2323 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
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Gm5460Q3UQ97 Fmnl1-207ENSMUST00000218163 3824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm5460Q3UQ97 Dpep1-201ENSMUST00000019422 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm5460Q3UQ97 Eml5-201ENSMUST00000065716 9482 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm5460Q3UQ97 Ddr1-212ENSMUST00000166980 3627 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm5460Q3UQ97 Sparc-202ENSMUST00000108858 2115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
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Gm5460Q3UQ97 Wars-201ENSMUST00000109848 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
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Gm5460Q3UQ97 Bdnf-205ENSMUST00000111045 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
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Gm5460Q3UQ97 Smco2-201ENSMUST00000032433 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
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Gm5460Q3UQ97 Tmem246-201ENSMUST00000042750 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
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Gm5460Q3UQ97 Flvcr2-201ENSMUST00000040461 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm5460Q3UQ97 Cep97-203ENSMUST00000118500 3389 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm5460Q3UQ97 Slc25a48-201ENSMUST00000021971 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm5460Q3UQ97 Agrn-202ENSMUST00000105574 7193 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm5460Q3UQ97 Myh2-201ENSMUST00000018641 6018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm5460Q3UQ97 Tmem109-201ENSMUST00000038128 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm5460Q3UQ97 Rnf44-217ENSMUST00000150806 3772 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm5460Q3UQ97 Gnas-203ENSMUST00000087876 3719 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm5460Q3UQ97 Syk-202ENSMUST00000118756 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm5460Q3UQ97 Acox3-203ENSMUST00000114237 2956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm5460Q3UQ97 Thoc6-202ENSMUST00000095579 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm5460Q3UQ97 Gm45496-201ENSMUST00000209918 2917 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm5460Q3UQ97 Papln-202ENSMUST00000121733 4373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm5460Q3UQ97 Syt14-201ENSMUST00000016344 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm5460Q3UQ97 Tmub2-201ENSMUST00000036376 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm5460Q3UQ97 Cd93-201ENSMUST00000099269 6677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm5460Q3UQ97 Lin54-210ENSMUST00000154921 3734 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm5460Q3UQ97 Tnc-201ENSMUST00000030056 6833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm5460Q3UQ97 Arhgap11a-202ENSMUST00000110947 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm5460Q3UQ97 Tcof1-204ENSMUST00000176630 4529 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm5460Q3UQ97 Mphosph10-201ENSMUST00000032735 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm5460Q3UQ97 Pax5-205ENSMUST00000107827 1315 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.2 ms