Protein–RNA interactions for Protein: Q3UPR8

D13Ertd608e, D13Ertd608e protein, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
D13Ertd608eQ3UPR8 Rcbtb2-219ENSMUST00000169513 3622 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
D13Ertd608eQ3UPR8 Ccndbp1-203ENSMUST00000099489 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
D13Ertd608eQ3UPR8 Zfp932-203ENSMUST00000112540 2081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
D13Ertd608eQ3UPR8 Eif2ak4-201ENSMUST00000005233 5212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
D13Ertd608eQ3UPR8 Slc19a1-208ENSMUST00000136925 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
D13Ertd608eQ3UPR8 Gpi1-201ENSMUST00000038027 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
D13Ertd608eQ3UPR8 Mylk3-202ENSMUST00000121972 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
D13Ertd608eQ3UPR8 Gphn-201ENSMUST00000052472 3570 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
D13Ertd608eQ3UPR8 Fcamr-202ENSMUST00000112477 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
D13Ertd608eQ3UPR8 Prc1-202ENSMUST00000163812 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
D13Ertd608eQ3UPR8 5730596B20Rik-201ENSMUST00000070587 3354 ntAPPRIS P1 BASIC10.06□□□□□ -0.8
D13Ertd608eQ3UPR8 Ttll9-201ENSMUST00000099197 1797 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
D13Ertd608eQ3UPR8 6430562O15Rik-201ENSMUST00000180491 2488 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
D13Ertd608eQ3UPR8 Abcc4-201ENSMUST00000036554 5715 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
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D13Ertd608eQ3UPR8 Prdm16-203ENSMUST00000097759 8544 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
D13Ertd608eQ3UPR8 Zfp111-202ENSMUST00000073833 3079 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
D13Ertd608eQ3UPR8 Oxsm-201ENSMUST00000022311 3759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
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D13Ertd608eQ3UPR8 Nlrx1-201ENSMUST00000034621 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
D13Ertd608eQ3UPR8 Rnf121-203ENSMUST00000106953 2545 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
D13Ertd608eQ3UPR8 4930417O13Rik-203ENSMUST00000204911 3458 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
D13Ertd608eQ3UPR8 Mcm3ap-201ENSMUST00000170795 6427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
D13Ertd608eQ3UPR8 Pklr-201ENSMUST00000047111 2787 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
D13Ertd608eQ3UPR8 Prss43-201ENSMUST00000077549 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
D13Ertd608eQ3UPR8 Zfp775-203ENSMUST00000204095 4143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.05□□□□□ -0.8
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D13Ertd608eQ3UPR8 Crym-201ENSMUST00000033198 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
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D13Ertd608eQ3UPR8 Ptpre-205ENSMUST00000210833 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
D13Ertd608eQ3UPR8 Prr5l-210ENSMUST00000171088 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
D13Ertd608eQ3UPR8 Uaca-202ENSMUST00000214354 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
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D13Ertd608eQ3UPR8 A330102I10Rik-202ENSMUST00000140415 682 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
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D13Ertd608eQ3UPR8 Hoxb5os-202ENSMUST00000150698 596 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
D13Ertd608eQ3UPR8 Fhit-204ENSMUST00000161302 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
D13Ertd608eQ3UPR8 Snhg9-201ENSMUST00000161706 183 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
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D13Ertd608eQ3UPR8 Gm32200-201ENSMUST00000192778 2385 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
D13Ertd608eQ3UPR8 Hspa12a-201ENSMUST00000066285 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
D13Ertd608eQ3UPR8 Ccdc93-201ENSMUST00000036025 7274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
D13Ertd608eQ3UPR8 Tmed5-205ENSMUST00000119437 3436 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
D13Ertd608eQ3UPR8 AU022252-203ENSMUST00000141112 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
D13Ertd608eQ3UPR8 Acer2-202ENSMUST00000084433 4060 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
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D13Ertd608eQ3UPR8 Sall4-203ENSMUST00000103074 3741 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
D13Ertd608eQ3UPR8 Mpv17l-204ENSMUST00000141971 2155 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
D13Ertd608eQ3UPR8 Frmpd3-203ENSMUST00000208130 7314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
D13Ertd608eQ3UPR8 Rbbp5-201ENSMUST00000027700 3385 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
D13Ertd608eQ3UPR8 Cdadc1-201ENSMUST00000022555 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
D13Ertd608eQ3UPR8 Vil1-201ENSMUST00000027366 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
D13Ertd608eQ3UPR8 Ints3-201ENSMUST00000029542 4337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
D13Ertd608eQ3UPR8 Slc5a9-201ENSMUST00000102719 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
D13Ertd608eQ3UPR8 Arhgap6-204ENSMUST00000112129 2487 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
D13Ertd608eQ3UPR8 Olfr370-203ENSMUST00000214156 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
D13Ertd608eQ3UPR8 Slc39a14-210ENSMUST00000152067 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
D13Ertd608eQ3UPR8 Folr1-202ENSMUST00000106982 1039 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.04□□□□□ -0.8
D13Ertd608eQ3UPR8 Zfp133-ps-204ENSMUST00000149523 424 ntTSL 3 BASIC10.04□□□□□ -0.8
D13Ertd608eQ3UPR8 Dnajc25-204ENSMUST00000152199 1141 ntTSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm43349-201ENSMUST00000200047 503 ntTSL 2 BASIC10.04□□□□□ -0.8
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D13Ertd608eQ3UPR8 AC122891.1-201ENSMUST00000218671 268 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm32141-201ENSMUST00000220189 488 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
D13Ertd608eQ3UPR8 Rrp36-201ENSMUST00000024766 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
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