Protein–RNA interactions for Protein: Q3UJD6

Usp19, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 19, mousemouse

Predictions only

Length 1,360 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp19Q3UJD6 Nxf1-211ENSMUST00000184970 5591 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Usp19Q3UJD6 Mterf3-201ENSMUST00000021991 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Usp19Q3UJD6 CT030159.3-201ENSMUST00000222936 1481 ntTSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Usp19Q3UJD6 Ptprh-201ENSMUST00000049113 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Usp19Q3UJD6 Nlrp6-201ENSMUST00000106045 3823 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Usp19Q3UJD6 Igfbp4-201ENSMUST00000017637 3831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Usp19Q3UJD6 Samd13-202ENSMUST00000125965 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Usp19Q3UJD6 4930432K21Rik-202ENSMUST00000118856 2366 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Usp19Q3UJD6 Azin1-203ENSMUST00000110329 4217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Usp19Q3UJD6 4933406M09Rik-201ENSMUST00000162187 1768 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Usp19Q3UJD6 Plekhg5-203ENSMUST00000105662 3933 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Usp19Q3UJD6 Dysf-214ENSMUST00000204354 6432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Usp19Q3UJD6 Mx2-201ENSMUST00000024112 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Usp19Q3UJD6 Tra2b-204ENSMUST00000161286 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Usp19Q3UJD6 A930038B10Rik-202ENSMUST00000181044 3415 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Usp19Q3UJD6 Synpr-201ENSMUST00000070323 2541 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Usp19Q3UJD6 Ptp4a3-203ENSMUST00000165541 3539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Usp19Q3UJD6 Taf9b-201ENSMUST00000055497 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Usp19Q3UJD6 G2e3-201ENSMUST00000054308 6803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Usp19Q3UJD6 Gm13019-201ENSMUST00000120000 276 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
Usp19Q3UJD6 Gm14034-201ENSMUST00000120147 551 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
Usp19Q3UJD6 2310034O05Rik-201ENSMUST00000185221 1107 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Usp19Q3UJD6 Gm8768-201ENSMUST00000220020 826 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
Usp19Q3UJD6 9430078K24Rik-203ENSMUST00000220293 638 ntTSL 3 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Usp19Q3UJD6 Gm11571-201ENSMUST00000136820 2396 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Usp19Q3UJD6 Klhdc10-206ENSMUST00000144272 1387 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Usp19Q3UJD6 Hdac6-201ENSMUST00000033501 4142 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Usp19Q3UJD6 Gm26912-201ENSMUST00000180988 1483 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Usp19Q3UJD6 Gm5641-201ENSMUST00000091130 1488 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
Usp19Q3UJD6 Map4-203ENSMUST00000163979 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Usp19Q3UJD6 Prr30-202ENSMUST00000187304 2104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Usp19Q3UJD6 Dennd6b-201ENSMUST00000078953 4607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Usp19Q3UJD6 Map4-206ENSMUST00000169851 3446 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Usp19Q3UJD6 Krt33b-201ENSMUST00000073890 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Usp19Q3UJD6 Ccndbp1-202ENSMUST00000099488 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Usp19Q3UJD6 Ss18-202ENSMUST00000040964 4153 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Usp19Q3UJD6 Mybph-202ENSMUST00000191577 2320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Usp19Q3UJD6 C730027H18Rik-201ENSMUST00000218381 2300 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Usp19Q3UJD6 Gm15883-201ENSMUST00000153562 1690 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Usp19Q3UJD6 Slc6a12-209ENSMUST00000171008 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Usp19Q3UJD6 Dglucy-204ENSMUST00000110073 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Usp19Q3UJD6 2810429I04Rik-203ENSMUST00000181708 4769 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Usp19Q3UJD6 Kyat1-201ENSMUST00000044038 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Usp19Q3UJD6 Arhgap25-201ENSMUST00000071024 2635 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Usp19Q3UJD6 Gfra2-201ENSMUST00000022699 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Usp19Q3UJD6 Cep76-201ENSMUST00000097542 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Usp19Q3UJD6 Smtn-202ENSMUST00000020721 3335 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Usp19Q3UJD6 Gnl2-201ENSMUST00000030684 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Usp19Q3UJD6 Supt3-201ENSMUST00000050630 1508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Usp19Q3UJD6 Mknk1-202ENSMUST00000106513 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Usp19Q3UJD6 Poldip3-202ENSMUST00000100375 3157 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Usp19Q3UJD6 Psd2-201ENSMUST00000115716 4607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
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Usp19Q3UJD6 Lnx2-201ENSMUST00000016664 4557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Usp19Q3UJD6 Clip1-202ENSMUST00000063905 4589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Usp19Q3UJD6 Lpo-201ENSMUST00000103177 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Usp19Q3UJD6 Rdh13-201ENSMUST00000008579 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Usp19Q3UJD6 Trav10d-201ENSMUST00000103646 406 ntAPPRIS P1 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Usp19Q3UJD6 Gm13351-201ENSMUST00000118087 414 ntBASIC14.31□□□□□ -0.12
Usp19Q3UJD6 Spaca9-202ENSMUST00000124840 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Usp19Q3UJD6 4930507D10Rik-201ENSMUST00000137411 1152 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Usp19Q3UJD6 Aknaos-201ENSMUST00000144095 1104 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
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Usp19Q3UJD6 CT025531.1-201ENSMUST00000214534 622 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
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Usp19Q3UJD6 Adipoq-201ENSMUST00000023593 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Usp19Q3UJD6 Eif4ebp3-201ENSMUST00000036765 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Usp19Q3UJD6 Spata46-201ENSMUST00000056991 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Usp19Q3UJD6 Olfr692-201ENSMUST00000098152 1126 ntAPPRIS P1 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Usp19Q3UJD6 Pphln1-201ENSMUST00000049122 4023 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
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Usp19Q3UJD6 Agbl4-202ENSMUST00000097920 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Usp19Q3UJD6 Immt-206ENSMUST00000166975 2469 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Usp19Q3UJD6 Tnn-202ENSMUST00000131919 3987 ntTSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Usp19Q3UJD6 Tcof1-202ENSMUST00000175934 4595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Usp19Q3UJD6 Arhgap33os-201ENSMUST00000124276 2648 ntTSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Usp19Q3UJD6 Sdf4-201ENSMUST00000050078 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Usp19Q3UJD6 Tmem237-205ENSMUST00000186794 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Usp19Q3UJD6 Mapk1ip1-201ENSMUST00000075667 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Usp19Q3UJD6 Gm14820-201ENSMUST00000126286 1449 ntTSL 3 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Usp19Q3UJD6 Arhgef2-207ENSMUST00000175903 3356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Usp19Q3UJD6 Atp1a2-202ENSMUST00000097464 3186 ntTSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Usp19Q3UJD6 Hyal2-206ENSMUST00000195681 2968 ntBASIC14.3□□□□□ -0.12
Usp19Q3UJD6 AI464131-201ENSMUST00000054920 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Usp19Q3UJD6 Eme2-201ENSMUST00000119848 5226 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Usp19Q3UJD6 Slc25a17-201ENSMUST00000023040 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Usp19Q3UJD6 Anp32e-202ENSMUST00000165307 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Usp19Q3UJD6 Klk6-201ENSMUST00000107966 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Usp19Q3UJD6 Tcf7l2-204ENSMUST00000111649 982 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Usp19Q3UJD6 Gm14234-201ENSMUST00000119539 845 ntBASIC14.3□□□□□ -0.12
Usp19Q3UJD6 Gm12337-201ENSMUST00000119634 400 ntBASIC14.3□□□□□ -0.12
Usp19Q3UJD6 Smim6-201ENSMUST00000132961 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Usp19Q3UJD6 Ighv1-76-201ENSMUST00000169155 294 ntAPPRIS P1 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Usp19Q3UJD6 Ighv1-62-1-202ENSMUST00000171270 90 ntAPPRIS P1 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Usp19Q3UJD6 Tcstv1-202ENSMUST00000190512 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Usp19Q3UJD6 Gm7047-201ENSMUST00000196224 1063 ntBASIC14.3□□□□□ -0.12
Usp19Q3UJD6 4930543N07Rik-202ENSMUST00000209503 1117 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Usp19Q3UJD6 Gm3433-201ENSMUST00000210149 1058 ntBASIC14.3□□□□□ -0.12
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