Protein–RNA interactions for Protein: Q3U2P1

Sec24a, Protein transport protein Sec24A, mousemouse

Predictions only

Length 1,090 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sec24aQ3U2P1 Wars-204ENSMUST00000161154 1824 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Sec24aQ3U2P1 Gm21759-201ENSMUST00000178345 1828 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Sec24aQ3U2P1 Smc3-201ENSMUST00000025930 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Sec24aQ3U2P1 Rbm6-201ENSMUST00000035201 3999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Sec24aQ3U2P1 Gtf3c1-204ENSMUST00000205659 6570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Sec24aQ3U2P1 Lrrc55-201ENSMUST00000099930 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Sec24aQ3U2P1 Epha7-204ENSMUST00000108194 2323 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Sec24aQ3U2P1 Lef1-201ENSMUST00000029611 3482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Sec24aQ3U2P1 Dbx2-201ENSMUST00000054244 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Sec24aQ3U2P1 Ddx56-201ENSMUST00000004507 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Sec24aQ3U2P1 Csf1r-202ENSMUST00000115268 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Sec24aQ3U2P1 Sln-201ENSMUST00000048485 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Sec24aQ3U2P1 Gm13556-201ENSMUST00000132692 1412 ntTSL 3 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Sec24aQ3U2P1 Fam3a-201ENSMUST00000015427 1427 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Sec24aQ3U2P1 Clvs2-204ENSMUST00000161692 4283 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Sec24aQ3U2P1 Gm43963-201ENSMUST00000203466 2488 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
Sec24aQ3U2P1 Olfr1344-202ENSMUST00000218906 2590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Sec24aQ3U2P1 Kdm3a-202ENSMUST00000167220 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Sec24aQ3U2P1 Il34-201ENSMUST00000076846 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Sec24aQ3U2P1 Vars2-201ENSMUST00000043674 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Sec24aQ3U2P1 Thsd4-202ENSMUST00000098660 8796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Sec24aQ3U2P1 Gm15411-201ENSMUST00000133243 3488 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Sec24aQ3U2P1 Gm32828-202ENSMUST00000219198 2111 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Sec24aQ3U2P1 Syk-202ENSMUST00000118756 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Sec24aQ3U2P1 Tex2-202ENSMUST00000103070 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Sec24aQ3U2P1 Sema5b-201ENSMUST00000050625 4350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Sec24aQ3U2P1 Qrich1-202ENSMUST00000112155 3040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Sec24aQ3U2P1 Pabpc4-204ENSMUST00000106243 3111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Sec24aQ3U2P1 Wdr82-201ENSMUST00000020490 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Sec24aQ3U2P1 Trav13d-1-201ENSMUST00000103588 396 ntAPPRIS P1 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Sec24aQ3U2P1 Vsir-202ENSMUST00000105459 1290 ntTSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Sec24aQ3U2P1 Il1rn-202ENSMUST00000114485 728 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Sec24aQ3U2P1 2210406O10Rik-203ENSMUST00000149687 1198 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Sec24aQ3U2P1 Gm11417-201ENSMUST00000150536 920 ntTSL 2 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Sec24aQ3U2P1 Gm8194-201ENSMUST00000159783 859 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
Sec24aQ3U2P1 Gm17115-201ENSMUST00000164075 885 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Sec24aQ3U2P1 Platr10-202ENSMUST00000191479 818 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
Sec24aQ3U2P1 Gm43401-201ENSMUST00000198829 394 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Sec24aQ3U2P1 Gm42655-201ENSMUST00000202782 1134 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
Sec24aQ3U2P1 Gm7972-202ENSMUST00000208453 505 ntTSL 3 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Sec24aQ3U2P1 Olfr567-ps1-201ENSMUST00000210349 857 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
Sec24aQ3U2P1 Gm9102-201ENSMUST00000219250 465 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
Sec24aQ3U2P1 AC099645.1-201ENSMUST00000226476 1105 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
Sec24aQ3U2P1 AC156501.1-201ENSMUST00000228219 270 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
Sec24aQ3U2P1 Olfr71-201ENSMUST00000055401 939 ntAPPRIS P1 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Sec24aQ3U2P1 Snrpg-201ENSMUST00000089558 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Sec24aQ3U2P1 Gm13306-201ENSMUST00000098122 418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Sec24aQ3U2P1 Chd5-201ENSMUST00000005175 9122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Sec24aQ3U2P1 Gm42815-201ENSMUST00000198787 1470 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
Sec24aQ3U2P1 Stom-201ENSMUST00000028241 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Sec24aQ3U2P1 Npas2-201ENSMUST00000056815 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Sec24aQ3U2P1 Slitrk4-202ENSMUST00000114679 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Sec24aQ3U2P1 Idua-203ENSMUST00000119212 3022 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Sec24aQ3U2P1 Gm36957-201ENSMUST00000192982 2824 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
Sec24aQ3U2P1 Ap2b1-206ENSMUST00000176523 2742 ntTSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Sec24aQ3U2P1 Klhl29-202ENSMUST00000218384 2716 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Sec24aQ3U2P1 Glb1l-201ENSMUST00000113623 2339 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Sec24aQ3U2P1 A930016O22Rik-202ENSMUST00000208685 2349 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Sec24aQ3U2P1 Slc9a1-201ENSMUST00000030669 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Sec24aQ3U2P1 Gm12992-201ENSMUST00000124738 4493 ntTSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Sec24aQ3U2P1 Grm1-202ENSMUST00000105560 4265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Sec24aQ3U2P1 Rab30-202ENSMUST00000107179 1304 ntTSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Sec24aQ3U2P1 Cul5-201ENSMUST00000034529 3585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.67
Sec24aQ3U2P1 Ascc2-202ENSMUST00000109930 4844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Sec24aQ3U2P1 Cep128-210ENSMUST00000141429 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Sec24aQ3U2P1 Akap3-202ENSMUST00000202574 2879 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Sec24aQ3U2P1 Fhl1-204ENSMUST00000114772 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Sec24aQ3U2P1 Phc1-204ENSMUST00000159252 3744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Sec24aQ3U2P1 Ufd1-202ENSMUST00000115578 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Sec24aQ3U2P1 Ptgr2-207ENSMUST00000146377 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Sec24aQ3U2P1 Lpin3-204ENSMUST00000109457 3215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Sec24aQ3U2P1 1500004A13Rik-209ENSMUST00000185189 1659 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Sec24aQ3U2P1 Btg2-201ENSMUST00000020692 2743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Sec24aQ3U2P1 Zfat-205ENSMUST00000162173 3561 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Sec24aQ3U2P1 Gm10614-201ENSMUST00000181414 2538 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Sec24aQ3U2P1 Fkbp15-204ENSMUST00000107461 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Sec24aQ3U2P1 Gsg1-203ENSMUST00000111910 1384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Sec24aQ3U2P1 Swap70-201ENSMUST00000033325 4027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Sec24aQ3U2P1 Rpl23-201ENSMUST00000103146 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Sec24aQ3U2P1 Oprl1-204ENSMUST00000108767 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Sec24aQ3U2P1 Snord23-201ENSMUST00000116828 109 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
Sec24aQ3U2P1 Olfr269-ps1-201ENSMUST00000120783 302 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
Sec24aQ3U2P1 Gm11952-201ENSMUST00000121172 821 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
Sec24aQ3U2P1 4631405J19Rik-204ENSMUST00000145926 936 ntTSL 3 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Sec24aQ3U2P1 Gm12406-201ENSMUST00000155382 697 ntTSL 3 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Sec24aQ3U2P1 Gm22379-201ENSMUST00000157480 131 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
Sec24aQ3U2P1 Rwdd2a-202ENSMUST00000179212 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Sec24aQ3U2P1 Gm9081-201ENSMUST00000182346 991 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
Sec24aQ3U2P1 Gm28032-201ENSMUST00000184104 96 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
Sec24aQ3U2P1 Gm28324-201ENSMUST00000187913 264 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
Sec24aQ3U2P1 Dydc1-203ENSMUST00000189865 995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Sec24aQ3U2P1 Gm34045-201ENSMUST00000217700 988 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Sec24aQ3U2P1 AC129308.3-201ENSMUST00000225652 524 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
Sec24aQ3U2P1 Ifitm2-201ENSMUST00000081649 655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Sec24aQ3U2P1 Setx-201ENSMUST00000061578 10970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Sec24aQ3U2P1 Ddx55-201ENSMUST00000071057 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Sec24aQ3U2P1 Rims3-202ENSMUST00000106283 6437 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Sec24aQ3U2P1 Fli1-201ENSMUST00000016231 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Sec24aQ3U2P1 C4a-207ENSMUST00000160679 5371 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Sec24aQ3U2P1 Nphs1-201ENSMUST00000006825 4608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.9 ms