Protein–RNA interactions for Protein: Q3TP92

Ctdnep1, CTD nuclear envelope phosphatase 1, mousemouse

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Length 244 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctdnep1Q3TP92 AC211878.3-201ENSMUST00000222629 2018 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Ctdnep1Q3TP92 Smim1-214ENSMUST00000182191 3535 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ctdnep1Q3TP92 Ambra1-203ENSMUST00000099712 5021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ctdnep1Q3TP92 Gm38357-201ENSMUST00000195382 2464 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Ctdnep1Q3TP92 Stau2-202ENSMUST00000054668 2907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ctdnep1Q3TP92 Epb41l1-206ENSMUST00000109577 6251 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ctdnep1Q3TP92 Zfp526-201ENSMUST00000055604 3380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ctdnep1Q3TP92 Arhgap4-202ENSMUST00000114404 2895 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ctdnep1Q3TP92 Spock3-203ENSMUST00000118003 2860 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ctdnep1Q3TP92 Cfap53-201ENSMUST00000114895 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ctdnep1Q3TP92 Optc-201ENSMUST00000124051 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ctdnep1Q3TP92 Rpe65-202ENSMUST00000196999 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ctdnep1Q3TP92 Gm19327-201ENSMUST00000220651 3271 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Ctdnep1Q3TP92 Casc1-203ENSMUST00000111728 2682 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ctdnep1Q3TP92 Mtmr7-205ENSMUST00000174205 2679 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ctdnep1Q3TP92 Zmat1-201ENSMUST00000064659 3501 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ctdnep1Q3TP92 Kcnk10-201ENSMUST00000110113 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ctdnep1Q3TP92 Gm21142-201ENSMUST00000179999 2604 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Ctdnep1Q3TP92 Nfx1-201ENSMUST00000030133 4349 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ctdnep1Q3TP92 Ceacam1-205ENSMUST00000206171 1722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ctdnep1Q3TP92 Cat-202ENSMUST00000111168 779 ntTSL 3 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ctdnep1Q3TP92 Gm12570-201ENSMUST00000122047 1030 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Ctdnep1Q3TP92 Smim1-204ENSMUST00000130175 477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ctdnep1Q3TP92 Smim1-206ENSMUST00000132541 490 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ctdnep1Q3TP92 Tsc22d1-206ENSMUST00000134109 801 ntTSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ctdnep1Q3TP92 Elof1-202ENSMUST00000166335 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ctdnep1Q3TP92 Gm20441-201ENSMUST00000173512 756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ctdnep1Q3TP92 Dusp3-207ENSMUST00000176261 496 ntTSL 3 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ctdnep1Q3TP92 Gm6408-201ENSMUST00000179032 1171 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ctdnep1Q3TP92 Gm40414-201ENSMUST00000197608 481 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Ctdnep1Q3TP92 Gm5865-201ENSMUST00000198713 637 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Ctdnep1Q3TP92 Gm43634-201ENSMUST00000202671 675 ntTSL 3 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ctdnep1Q3TP92 9530062K07Rik-201ENSMUST00000203332 787 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ctdnep1Q3TP92 Gadd45a-206ENSMUST00000204282 460 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ctdnep1Q3TP92 Gm8959-201ENSMUST00000213150 571 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Ctdnep1Q3TP92 AC153891.1-201ENSMUST00000213761 742 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ctdnep1Q3TP92 Psmb7-201ENSMUST00000028083 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ctdnep1Q3TP92 Gaa-201ENSMUST00000026666 3363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ctdnep1Q3TP92 Kcne2-201ENSMUST00000047383 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ctdnep1Q3TP92 Inpp4a-208ENSMUST00000137266 2934 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ctdnep1Q3TP92 Pex13-201ENSMUST00000020523 4146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ctdnep1Q3TP92 Fgd5-202ENSMUST00000113466 5621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ctdnep1Q3TP92 Sertad2-201ENSMUST00000093292 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ctdnep1Q3TP92 Mms19-201ENSMUST00000026168 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ctdnep1Q3TP92 Lin54-209ENSMUST00000152387 2760 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ctdnep1Q3TP92 Esr1-204ENSMUST00000105590 6339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ctdnep1Q3TP92 Rbbp5-202ENSMUST00000187505 1977 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ctdnep1Q3TP92 Sphk2-202ENSMUST00000107737 3548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ctdnep1Q3TP92 Syt7-202ENSMUST00000076968 6624 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ctdnep1Q3TP92 Pcnx2-201ENSMUST00000047239 7236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ctdnep1Q3TP92 Ift46-201ENSMUST00000002099 4169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ctdnep1Q3TP92 Rin1-201ENSMUST00000025818 4184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ctdnep1Q3TP92 Kcnk5-201ENSMUST00000024011 3392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ctdnep1Q3TP92 Grik3-201ENSMUST00000030676 8973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ctdnep1Q3TP92 2610028H24Rik-202ENSMUST00000105415 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ctdnep1Q3TP92 Cwc25-202ENSMUST00000107579 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ctdnep1Q3TP92 Eif2s3y-201ENSMUST00000091197 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ctdnep1Q3TP92 Wwtr1-201ENSMUST00000029380 4697 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Ctdnep1Q3TP92 Vmn1r45-202ENSMUST00000226167 2893 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
Ctdnep1Q3TP92 Colec11-201ENSMUST00000036136 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Ctdnep1Q3TP92 Sh3kbp1-206ENSMUST00000112456 7317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Ctdnep1Q3TP92 Zfp36-201ENSMUST00000051241 2790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Ctdnep1Q3TP92 Sgca-202ENSMUST00000103162 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Ctdnep1Q3TP92 Ikzf1-204ENSMUST00000076700 5163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Ctdnep1Q3TP92 1500004A13Rik-209ENSMUST00000185189 1659 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Ctdnep1Q3TP92 Dpyd-201ENSMUST00000039177 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Ctdnep1Q3TP92 Rpl23-201ENSMUST00000103146 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Ctdnep1Q3TP92 Gm25766-201ENSMUST00000104101 131 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
Ctdnep1Q3TP92 Gm826-202ENSMUST00000109475 803 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Ctdnep1Q3TP92 Wdr45-206ENSMUST00000116634 1250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Ctdnep1Q3TP92 Vmn2r-ps54-203ENSMUST00000150856 1142 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Ctdnep1Q3TP92 Mir1943-201ENSMUST00000158276 73 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
Ctdnep1Q3TP92 Gm17168-201ENSMUST00000169146 345 ntTSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Ctdnep1Q3TP92 1700109G14Rik-202ENSMUST00000188538 754 ntTSL 3 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Ctdnep1Q3TP92 Gm37597-201ENSMUST00000191853 382 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
Ctdnep1Q3TP92 Gm43552-201ENSMUST00000196121 365 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Ctdnep1Q3TP92 Cabcoco1-201ENSMUST00000020103 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Ctdnep1Q3TP92 Gm42657-201ENSMUST00000201746 211 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
Ctdnep1Q3TP92 E330021D16Rik-201ENSMUST00000058713 1116 ntAPPRIS P1 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Ctdnep1Q3TP92 Gm15594-201ENSMUST00000137958 2215 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Ctdnep1Q3TP92 Dld-201ENSMUST00000110857 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Ctdnep1Q3TP92 Cryz-201ENSMUST00000029850 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Ctdnep1Q3TP92 Zeb2-201ENSMUST00000028229 5335 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Ctdnep1Q3TP92 Nrxn1-202ENSMUST00000072671 8118 ntTSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Ctdnep1Q3TP92 Dcaf8-201ENSMUST00000074144 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Ctdnep1Q3TP92 Acsm5-205ENSMUST00000207440 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Ctdnep1Q3TP92 Plxna1-201ENSMUST00000049845 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Ctdnep1Q3TP92 AC130823.1-201ENSMUST00000228929 1549 ntBASIC12.71□□□□□ -0.38
Ctdnep1Q3TP92 Tnfrsf9-201ENSMUST00000030808 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Ctdnep1Q3TP92 Fnip2-203ENSMUST00000133154 7299 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.38
Ctdnep1Q3TP92 Zmynd8-203ENSMUST00000099084 5232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.38
Ctdnep1Q3TP92 Myo5b-203ENSMUST00000121875 6065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.38
Ctdnep1Q3TP92 Gab3-202ENSMUST00000114104 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.38
Ctdnep1Q3TP92 Atg14-202ENSMUST00000226299 3729 ntAPPRIS P1 BASIC12.71□□□□□ -0.38
Ctdnep1Q3TP92 Adora1-203ENSMUST00000169927 4581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.38
Ctdnep1Q3TP92 Tldc1-201ENSMUST00000049156 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ctdnep1Q3TP92 Rcbtb2-219ENSMUST00000169513 3622 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ctdnep1Q3TP92 Lnx1-202ENSMUST00000087161 2753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ctdnep1Q3TP92 Plxnb2-201ENSMUST00000060808 6394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ctdnep1Q3TP92 Ackr2-202ENSMUST00000214340 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
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