Protein–RNA interactions for Protein: Q149C2

Traf3ip1, TRAF3-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 625 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Traf3ip1Q149C2 Magt1-204ENSMUST00000151689 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Traf3ip1Q149C2 Sparc-202ENSMUST00000108858 2115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Traf3ip1Q149C2 Grm1-202ENSMUST00000105560 4265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Traf3ip1Q149C2 AC149588.2-201ENSMUST00000228182 1859 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
Traf3ip1Q149C2 Elavl2-207ENSMUST00000107118 3797 ntTSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Traf3ip1Q149C2 E2f3-201ENSMUST00000102948 5097 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Traf3ip1Q149C2 Vsir-202ENSMUST00000105459 1290 ntTSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Traf3ip1Q149C2 Scp2-202ENSMUST00000106701 772 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Traf3ip1Q149C2 Oprl1-204ENSMUST00000108767 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Traf3ip1Q149C2 Snord23-201ENSMUST00000116828 109 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
Traf3ip1Q149C2 Gm12791-201ENSMUST00000120788 655 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
Traf3ip1Q149C2 Gm12030-201ENSMUST00000121917 223 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
Traf3ip1Q149C2 1700037C06Rik-201ENSMUST00000132824 874 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
Traf3ip1Q149C2 Gm22379-201ENSMUST00000157480 131 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
Traf3ip1Q149C2 Anp32e-206ENSMUST00000169426 915 ntTSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Traf3ip1Q149C2 Rps28-203ENSMUST00000173019 437 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Traf3ip1Q149C2 Mir3547-201ENSMUST00000175461 88 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
Traf3ip1Q149C2 Higd1c-201ENSMUST00000175683 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Traf3ip1Q149C2 A930036K24Rik-201ENSMUST00000194146 1200 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
Traf3ip1Q149C2 Gm37638-201ENSMUST00000194337 1123 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
Traf3ip1Q149C2 Gm45219-201ENSMUST00000205602 465 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
Traf3ip1Q149C2 Gm44814-201ENSMUST00000207018 434 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
Traf3ip1Q149C2 Gm31401-201ENSMUST00000207352 734 ntTSL 3 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Traf3ip1Q149C2 Gm18042-201ENSMUST00000219887 790 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
Traf3ip1Q149C2 AC159196.1-201ENSMUST00000225524 377 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
Traf3ip1Q149C2 Krtap4-13-201ENSMUST00000050106 815 ntAPPRIS P1 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Traf3ip1Q149C2 Cacna1c-224ENSMUST00000219018 7516 ntTSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Traf3ip1Q149C2 Wdr19-204ENSMUST00000203653 6279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Traf3ip1Q149C2 Aurkc-203ENSMUST00000207711 1320 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Traf3ip1Q149C2 Arhgef28-201ENSMUST00000109426 5387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Traf3ip1Q149C2 Ikzf2-202ENSMUST00000187184 2013 ntTSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Traf3ip1Q149C2 Gm36940-201ENSMUST00000194281 2036 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
Traf3ip1Q149C2 Tmem41b-202ENSMUST00000118429 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Traf3ip1Q149C2 Stk4-201ENSMUST00000018353 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Traf3ip1Q149C2 Pla2g4a-202ENSMUST00000111926 2835 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Traf3ip1Q149C2 Rufy2-204ENSMUST00000131718 2816 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Traf3ip1Q149C2 Megf11-203ENSMUST00000118485 3944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Traf3ip1Q149C2 Dnmt3a-218ENSMUST00000174817 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Traf3ip1Q149C2 Zcchc8-204ENSMUST00000196282 4350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Traf3ip1Q149C2 5530401A14Rik-201ENSMUST00000021044 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Traf3ip1Q149C2 AC090962.2-201ENSMUST00000225064 1801 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
Traf3ip1Q149C2 Madd-208ENSMUST00000111370 5879 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Traf3ip1Q149C2 Madd-214ENSMUST00000111381 5873 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Traf3ip1Q149C2 Pip5k1a-205ENSMUST00000107233 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Traf3ip1Q149C2 Helq-201ENSMUST00000044684 3689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Traf3ip1Q149C2 Thoc6-202ENSMUST00000095579 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Traf3ip1Q149C2 Gm37014-201ENSMUST00000194723 2253 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
Traf3ip1Q149C2 Clec12b-201ENSMUST00000032261 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Traf3ip1Q149C2 Pdcd10-205ENSMUST00000161137 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Traf3ip1Q149C2 Ptpro-201ENSMUST00000077115 5049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Traf3ip1Q149C2 Vps16-201ENSMUST00000028900 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Traf3ip1Q149C2 Trim25-201ENSMUST00000000284 5566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Traf3ip1Q149C2 Kat6b-201ENSMUST00000069648 7649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Traf3ip1Q149C2 Gm15446-201ENSMUST00000112544 2417 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Traf3ip1Q149C2 C4b-201ENSMUST00000069507 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Traf3ip1Q149C2 Slc20a1-201ENSMUST00000028880 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Traf3ip1Q149C2 Usp44-201ENSMUST00000095333 2946 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Traf3ip1Q149C2 1500004A13Rik-209ENSMUST00000185189 1659 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Traf3ip1Q149C2 Ehmt1-203ENSMUST00000102938 4680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Traf3ip1Q149C2 Trav13d-1-201ENSMUST00000103588 396 ntAPPRIS P1 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Traf3ip1Q149C2 1700071K01Rik-201ENSMUST00000117522 819 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
Traf3ip1Q149C2 Gm16553-201ENSMUST00000160490 716 ntTSL 3 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Traf3ip1Q149C2 4930405O22Rik-201ENSMUST00000164605 954 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Traf3ip1Q149C2 Gm23153-201ENSMUST00000175323 313 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
Traf3ip1Q149C2 Dusp3-207ENSMUST00000176261 496 ntTSL 3 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Traf3ip1Q149C2 1700008A23Rik-201ENSMUST00000191694 691 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
Traf3ip1Q149C2 Gm38139-201ENSMUST00000195806 704 ntTSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Traf3ip1Q149C2 Gm35657-201ENSMUST00000215869 989 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Traf3ip1Q149C2 Naca-201ENSMUST00000073868 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Traf3ip1Q149C2 n-R5s211-201ENSMUST00000093689 119 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
Traf3ip1Q149C2 Agpat3-211ENSMUST00000166360 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Traf3ip1Q149C2 Ptpn21-202ENSMUST00000170188 5562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Traf3ip1Q149C2 Gm20671-201ENSMUST00000144673 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Traf3ip1Q149C2 Gm43061-201ENSMUST00000198850 2241 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
Traf3ip1Q149C2 Dmbx1-203ENSMUST00000124071 4017 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Traf3ip1Q149C2 Katnal2-208ENSMUST00000137498 1824 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Traf3ip1Q149C2 Chil1-207ENSMUST00000153856 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Traf3ip1Q149C2 Fut10-202ENSMUST00000110527 2327 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Traf3ip1Q149C2 Colec11-201ENSMUST00000036136 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Traf3ip1Q149C2 Egfr-202ENSMUST00000102884 2943 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Traf3ip1Q149C2 Mbtps1-201ENSMUST00000081381 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Traf3ip1Q149C2 Rfesd-201ENSMUST00000050997 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Traf3ip1Q149C2 Dennd4c-202ENSMUST00000082026 7940 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.36
Traf3ip1Q149C2 Sfrp4-203ENSMUST00000222464 4049 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Traf3ip1Q149C2 Dclk2-209ENSMUST00000195561 3486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Traf3ip1Q149C2 Asap3-201ENSMUST00000047526 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Traf3ip1Q149C2 Dnajc12-201ENSMUST00000043317 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Traf3ip1Q149C2 Add2-207ENSMUST00000203724 3143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Traf3ip1Q149C2 Art5-203ENSMUST00000106935 495 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Traf3ip1Q149C2 Olfr269-ps1-201ENSMUST00000120783 302 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Traf3ip1Q149C2 Hyal1-203ENSMUST00000123005 843 ntTSL 3 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Traf3ip1Q149C2 Gm27191-201ENSMUST00000145973 448 ntTSL 3 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Traf3ip1Q149C2 Gm12744-201ENSMUST00000146976 519 ntTSL 3 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Traf3ip1Q149C2 Tmem204-202ENSMUST00000153745 902 ntTSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Traf3ip1Q149C2 A230006K03Rik-202ENSMUST00000154958 901 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Traf3ip1Q149C2 Gm15996-201ENSMUST00000161925 762 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Traf3ip1Q149C2 Gm25072-201ENSMUST00000175233 235 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Traf3ip1Q149C2 Gm44696-201ENSMUST00000181943 1229 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Traf3ip1Q149C2 Gm9081-201ENSMUST00000182346 991 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Traf3ip1Q149C2 Gm19927-201ENSMUST00000185792 781 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34 ms