Protein–RNA interactions for Protein: Q0VF76

Ttc39d, Tetratricopeptide repeat domain 39D, mousemouse

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Length 604 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc39dQ0VF76 Gm12224-201ENSMUST00000124047 567 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
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Ttc39dQ0VF76 Gm13073-201ENSMUST00000134059 486 ntTSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ttc39dQ0VF76 Gm26461-201ENSMUST00000175064 290 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Ttc39dQ0VF76 Gm19015-201ENSMUST00000184002 1189 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Ttc39dQ0VF76 Gm29560-201ENSMUST00000191526 881 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
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Ttc39dQ0VF76 Gm32111-201ENSMUST00000207689 846 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
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Ttc39dQ0VF76 Cacna1s-202ENSMUST00000112068 6018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
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Ttc39dQ0VF76 5930430L01Rik-201ENSMUST00000145042 3994 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ttc39dQ0VF76 Dennd4c-202ENSMUST00000082026 7940 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ttc39dQ0VF76 Zfp454-201ENSMUST00000050595 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ttc39dQ0VF76 Gm6268-201ENSMUST00000115253 1453 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ttc39dQ0VF76 Pde6c-202ENSMUST00000112329 2895 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ttc39dQ0VF76 Fhl1-204ENSMUST00000114772 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ttc39dQ0VF76 Myh6-201ENSMUST00000081857 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ttc39dQ0VF76 Snw1-201ENSMUST00000021428 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ttc39dQ0VF76 Chrng-201ENSMUST00000027470 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ttc39dQ0VF76 Plin4-201ENSMUST00000002908 5755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
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Ttc39dQ0VF76 Tasp1-202ENSMUST00000099304 2127 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
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Ttc39dQ0VF76 Tmem140-201ENSMUST00000074949 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
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Ttc39dQ0VF76 4933413J09Rik-202ENSMUST00000059648 3387 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
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Ttc39dQ0VF76 Ccl27a-203ENSMUST00000108033 428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
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Ttc39dQ0VF76 1110036E04Rik-201ENSMUST00000181151 777 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
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Ttc39dQ0VF76 Cthrc1-201ENSMUST00000067072 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
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Ttc39dQ0VF76 C530005A16Rik-201ENSMUST00000142815 2436 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ttc39dQ0VF76 Atcayos-203ENSMUST00000150782 3057 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ttc39dQ0VF76 Itga4-201ENSMUST00000099972 9767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ttc39dQ0VF76 Nod1-201ENSMUST00000060655 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ttc39dQ0VF76 Gm11571-201ENSMUST00000136820 2396 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ttc39dQ0VF76 Rwdd3-205ENSMUST00000106467 1158 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
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Ttc39dQ0VF76 Scgb2b25-ps-201ENSMUST00000121936 307 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Ttc39dQ0VF76 4930571N24Rik-202ENSMUST00000142914 598 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ttc39dQ0VF76 Gm16165-201ENSMUST00000160140 795 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Ttc39dQ0VF76 1110002L01Rik-203ENSMUST00000179637 586 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ttc39dQ0VF76 Gm7467-201ENSMUST00000185173 652 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Ttc39dQ0VF76 Gm5865-201ENSMUST00000198713 637 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Ttc39dQ0VF76 Polr1d-204ENSMUST00000200993 1167 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ttc39dQ0VF76 Gm44753-202ENSMUST00000208297 562 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ttc39dQ0VF76 Gm9132-201ENSMUST00000210182 832 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Ttc39dQ0VF76 AC134328.1-201ENSMUST00000222693 667 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ttc39dQ0VF76 AC116680.1-201ENSMUST00000222804 613 ntTSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ttc39dQ0VF76 AC154276.3-201ENSMUST00000227643 998 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Ttc39dQ0VF76 Tmem210-201ENSMUST00000028340 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
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