Protein–RNA interactions for Protein: Q03366

Ccl7, C-C motif chemokine 7, mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl7Q03366 Gm6157-201ENSMUST00000199935 1897 ntBASIC9.44□□□□□ -0.9
Ccl7Q03366 Zfp410-215ENSMUST00000222832 1859 ntTSL 2 BASIC9.44□□□□□ -0.9
Ccl7Q03366 Gem-202ENSMUST00000108304 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
Ccl7Q03366 Tcn2-207ENSMUST00000109993 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
Ccl7Q03366 Phactr1-201ENSMUST00000066928 2013 ntTSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
Ccl7Q03366 Elmod3-201ENSMUST00000070990 2122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
Ccl7Q03366 A930016O22Rik-202ENSMUST00000208685 2349 ntTSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
Ccl7Q03366 CK137956-201ENSMUST00000030614 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
Ccl7Q03366 Gm28042-203ENSMUST00000156805 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.44□□□□□ -0.9
Ccl7Q03366 Idua-203ENSMUST00000119212 3022 ntTSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
Ccl7Q03366 Spop-201ENSMUST00000107722 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
Ccl7Q03366 Slc38a3-202ENSMUST00000167868 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
Ccl7Q03366 Zfat-205ENSMUST00000162173 3561 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.44□□□□□ -0.9
Ccl7Q03366 Kcnma1-212ENSMUST00000188285 4440 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
Ccl7Q03366 Mcf2l-222ENSMUST00000173099 6081 ntTSL 5 BASIC9.44□□□□□ -0.9
Ccl7Q03366 Fer1l4-201ENSMUST00000109611 6106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.44□□□□□ -0.9
Ccl7Q03366 Thbs2-201ENSMUST00000170872 5922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
Ccl7Q03366 Clip1-204ENSMUST00000111564 5609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
Ccl7Q03366 Zfp110-201ENSMUST00000004614 3591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
Ccl7Q03366 Grm5-201ENSMUST00000107263 3516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
Ccl7Q03366 Prkd2-202ENSMUST00000168093 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
Ccl7Q03366 Mkx-201ENSMUST00000079788 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
Ccl7Q03366 Tnip1-203ENSMUST00000102731 2973 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.43□□□□□ -0.9
Ccl7Q03366 Gm4869-201ENSMUST00000197549 2955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.43□□□□□ -0.9
Ccl7Q03366 Lsamp-201ENSMUST00000078873 2951 ntTSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
Ccl7Q03366 App-206ENSMUST00000227723 8167 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.43□□□□□ -0.9
Ccl7Q03366 Gm12153-201ENSMUST00000148504 2509 ntTSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
Ccl7Q03366 Atxn1l-201ENSMUST00000093162 7526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.43□□□□□ -0.9
Ccl7Q03366 1200007C13Rik-201ENSMUST00000143649 2455 ntTSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
Ccl7Q03366 Gm42683-201ENSMUST00000196136 2328 ntBASIC9.43□□□□□ -0.9
Ccl7Q03366 Bcl2l14-201ENSMUST00000032321 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
Ccl7Q03366 Rtl1-201ENSMUST00000149046 6358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
Ccl7Q03366 Fxr1-206ENSMUST00000198051 2127 ntTSL 5 BASIC9.43□□□□□ -0.9
Ccl7Q03366 Slc23a2-201ENSMUST00000028815 6364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
Ccl7Q03366 Tex13c1-201ENSMUST00000105113 2074 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.43□□□□□ -0.9
Ccl7Q03366 Asns-202ENSMUST00000115542 2016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.43□□□□□ -0.9
Ccl7Q03366 Gm36940-201ENSMUST00000194281 2036 ntBASIC9.43□□□□□ -0.9
Ccl7Q03366 Ing1-204ENSMUST00000210041 1881 ntTSL 5 BASIC9.43□□□□□ -0.9
Ccl7Q03366 Ptpn11-201ENSMUST00000054547 5535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
Ccl7Q03366 Gm10848-201ENSMUST00000192361 1811 ntTSL 2 BASIC9.43□□□□□ -0.9
Ccl7Q03366 1700010I14Rik-201ENSMUST00000024650 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
Ccl7Q03366 AC158355.1-201ENSMUST00000215895 1705 ntBASIC9.43□□□□□ -0.9
Ccl7Q03366 Sept4-203ENSMUST00000107960 1653 ntTSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
Ccl7Q03366 Atp6v0e2-202ENSMUST00000203011 1612 ntTSL 2 BASIC9.43□□□□□ -0.9
Ccl7Q03366 Kng2-203ENSMUST00000115349 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
Ccl7Q03366 Prdx2-201ENSMUST00000005292 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
Ccl7Q03366 Dhx38-201ENSMUST00000042601 4463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
Ccl7Q03366 Pml-207ENSMUST00000135310 4413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
Ccl7Q03366 Plscr1-202ENSMUST00000186364 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
Ccl7Q03366 AC158595.1-201ENSMUST00000217989 1435 ntBASIC9.43□□□□□ -0.9
Ccl7Q03366 Cstad-201ENSMUST00000102853 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
Ccl7Q03366 Snord17-201ENSMUST00000104526 238 ntBASIC9.43□□□□□ -0.9
Ccl7Q03366 Gm8737-201ENSMUST00000122208 642 ntBASIC9.43□□□□□ -0.9
Ccl7Q03366 n-R5s14-201ENSMUST00000122688 107 ntBASIC9.43□□□□□ -0.9
Ccl7Q03366 Gm12348-201ENSMUST00000138915 313 ntTSL 3 BASIC9.43□□□□□ -0.9
Ccl7Q03366 Zfp133-ps-204ENSMUST00000149523 424 ntTSL 3 BASIC9.43□□□□□ -0.9
Ccl7Q03366 2810433D01Rik-202ENSMUST00000154798 1045 ntTSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
Ccl7Q03366 H2-M2-202ENSMUST00000171139 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
Ccl7Q03366 Gm20033-203ENSMUST00000180912 796 ntTSL 5 BASIC9.43□□□□□ -0.9
Ccl7Q03366 Gm18827-201ENSMUST00000188341 790 ntBASIC9.43□□□□□ -0.9
Ccl7Q03366 Gm37590-201ENSMUST00000193294 603 ntTSL 5 BASIC9.43□□□□□ -0.9
Ccl7Q03366 Gm37284-201ENSMUST00000193607 539 ntBASIC9.43□□□□□ -0.9
Ccl7Q03366 Gm37826-201ENSMUST00000195329 322 ntBASIC9.43□□□□□ -0.9
Ccl7Q03366 Gm8615-202ENSMUST00000201946 737 ntTSL 3 BASIC9.43□□□□□ -0.9
Ccl7Q03366 Gm35549-201ENSMUST00000203176 735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.43□□□□□ -0.9
Ccl7Q03366 Olfr1460-ps1-201ENSMUST00000208975 899 ntBASIC9.43□□□□□ -0.9
Ccl7Q03366 Gm9132-201ENSMUST00000210182 832 ntBASIC9.43□□□□□ -0.9
Ccl7Q03366 Nt5dc1-206ENSMUST00000213269 802 ntTSL 5 BASIC9.43□□□□□ -0.9
Ccl7Q03366 AC164105.2-201ENSMUST00000215484 524 ntTSL 5 BASIC9.43□□□□□ -0.9
Ccl7Q03366 9430078K24Rik-201ENSMUST00000218818 1082 ntTSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
Ccl7Q03366 AC102569.1-201ENSMUST00000221563 685 ntBASIC9.43□□□□□ -0.9
Ccl7Q03366 Gm5468-202ENSMUST00000227851 682 ntBASIC9.43□□□□□ -0.9
Ccl7Q03366 CT030637.1-201ENSMUST00000228016 669 ntBASIC9.43□□□□□ -0.9
Ccl7Q03366 AC171241.1-201ENSMUST00000228144 1166 ntBASIC9.43□□□□□ -0.9
Ccl7Q03366 Psma7-201ENSMUST00000029082 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
Ccl7Q03366 Fpr-rs3-201ENSMUST00000071189 1032 ntAPPRIS P1 BASIC9.43□□□□□ -0.9
Ccl7Q03366 Tas2r125-201ENSMUST00000076119 937 ntAPPRIS P1 BASIC9.43□□□□□ -0.9
Ccl7Q03366 Olfr510-201ENSMUST00000076289 945 ntAPPRIS P1 BASIC9.43□□□□□ -0.9
Ccl7Q03366 Arl16-201ENSMUST00000076921 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
Ccl7Q03366 Armc1-201ENSMUST00000029125 3673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
Ccl7Q03366 Lman1-201ENSMUST00000048260 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
Ccl7Q03366 Arsa-202ENSMUST00000165199 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
Ccl7Q03366 Slc25a44-202ENSMUST00000168755 3418 ntTSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
Ccl7Q03366 Cep250-202ENSMUST00000094421 7919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.43□□□□□ -0.9
Ccl7Q03366 Mapkap1-209ENSMUST00000147337 3111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
Ccl7Q03366 Rab3gap2-201ENSMUST00000069652 7052 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.43□□□□□ -0.9
Ccl7Q03366 Pla2g6-206ENSMUST00000173163 3018 ntTSL 5 BASIC9.43□□□□□ -0.9
Ccl7Q03366 Txlna-201ENSMUST00000046425 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
Ccl7Q03366 Ddx54-201ENSMUST00000031598 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
Ccl7Q03366 L1td1-204ENSMUST00000173659 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.43□□□□□ -0.9
Ccl7Q03366 Gm29895-201ENSMUST00000209933 5652 ntTSL 5 BASIC9.43□□□□□ -0.9
Ccl7Q03366 Pdzk1-201ENSMUST00000058865 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
Ccl7Q03366 AC122273.1-201ENSMUST00000213634 2327 ntBASIC9.43□□□□□ -0.9
Ccl7Q03366 Ccnt2-201ENSMUST00000027587 6738 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
Ccl7Q03366 Sparc-202ENSMUST00000108858 2115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
Ccl7Q03366 Gsdme-205ENSMUST00000170142 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
Ccl7Q03366 Gm9244-201ENSMUST00000056767 2129 ntBASIC9.43□□□□□ -0.9
Ccl7Q03366 Acsm2-202ENSMUST00000098084 2099 ntTSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
Ccl7Q03366 Zfp235-201ENSMUST00000056549 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
Ccl7Q03366 Tubd1-203ENSMUST00000108030 1964 ntTSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.6 ms