Protein–RNA interactions for Protein: Q02576

Nhlh1, Helix-loop-helix protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 133 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nhlh1Q02576 Gprasp1-201ENSMUST00000113144 5843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Nhlh1Q02576 Slc10a1-202ENSMUST00000218162 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Nhlh1Q02576 Mylk-201ENSMUST00000023538 7824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Nhlh1Q02576 Stx3-203ENSMUST00000075304 2430 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Nhlh1Q02576 Rtp4-202ENSMUST00000209422 1859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Nhlh1Q02576 Htr2c-207ENSMUST00000156697 4654 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Nhlh1Q02576 Reln-207ENSMUST00000161356 11699 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Nhlh1Q02576 Neurod6-201ENSMUST00000044767 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Nhlh1Q02576 Nxpe1-ps-201ENSMUST00000209981 1454 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Nhlh1Q02576 Tram1l1-201ENSMUST00000058994 3889 ntAPPRIS P1 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Nhlh1Q02576 Nme1-203ENSMUST00000135884 3181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Nhlh1Q02576 Gm44292-201ENSMUST00000205194 2364 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Nhlh1Q02576 Fn1-201ENSMUST00000055226 8315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Nhlh1Q02576 Chfr-201ENSMUST00000014812 3146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Nhlh1Q02576 Jph2-202ENSMUST00000109425 4155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Nhlh1Q02576 Tnfrsf13b-201ENSMUST00000010286 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Nhlh1Q02576 Extl3-201ENSMUST00000022550 5977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Nhlh1Q02576 Nhlrc2-201ENSMUST00000071423 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Nhlh1Q02576 Plac9b-201ENSMUST00000100809 388 ntTSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Nhlh1Q02576 Ccnk-201ENSMUST00000101055 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Nhlh1Q02576 Gm24161-201ENSMUST00000104592 130 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Nhlh1Q02576 Gm15132-201ENSMUST00000118581 652 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Nhlh1Q02576 AU015836-201ENSMUST00000120624 674 ntTSL 3 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Nhlh1Q02576 Gm13799-201ENSMUST00000138883 838 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Nhlh1Q02576 Slc39a8-205ENSMUST00000167390 3533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Nhlh1Q02576 Cchcr1-205ENSMUST00000173903 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Nhlh1Q02576 Mir3100-201ENSMUST00000174918 65 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Nhlh1Q02576 D130017N08Rik-201ENSMUST00000180460 510 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Nhlh1Q02576 Iyd-201ENSMUST00000019896 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Nhlh1Q02576 Gm42803-201ENSMUST00000201051 451 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Nhlh1Q02576 Gm5191-201ENSMUST00000222882 1236 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Nhlh1Q02576 3830406C13Rik-213ENSMUST00000225294 1191 ntAPPRIS P1 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Nhlh1Q02576 AC165260.2-201ENSMUST00000225371 395 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Nhlh1Q02576 BX649293.1-201ENSMUST00000227437 631 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Nhlh1Q02576 Tepsin-201ENSMUST00000026442 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Nhlh1Q02576 Rps4l-ps-201ENSMUST00000059737 768 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Nhlh1Q02576 Zmat1-201ENSMUST00000064659 3501 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Nhlh1Q02576 Gm10134-201ENSMUST00000074761 381 ntAPPRIS P1 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Nhlh1Q02576 Golga4-201ENSMUST00000084820 7583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Nhlh1Q02576 Larp1b-204ENSMUST00000099121 1030 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Nhlh1Q02576 Wisp1-201ENSMUST00000005255 5097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Nhlh1Q02576 Acvr1c-201ENSMUST00000028178 9162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Nhlh1Q02576 Pyroxd1-201ENSMUST00000041852 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Nhlh1Q02576 Irak4-201ENSMUST00000074936 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Nhlh1Q02576 Gorab-201ENSMUST00000045138 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Nhlh1Q02576 Zhx2-201ENSMUST00000096430 4376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Nhlh1Q02576 Gm7224-201ENSMUST00000121359 2066 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Nhlh1Q02576 Chodl-202ENSMUST00000069148 2051 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Nhlh1Q02576 Gm42928-201ENSMUST00000197338 3339 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Nhlh1Q02576 Oprm1-213ENSMUST00000105604 1616 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Nhlh1Q02576 Gm13615-201ENSMUST00000120242 1612 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Nhlh1Q02576 Setmar-201ENSMUST00000049246 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Nhlh1Q02576 Nrap-203ENSMUST00000095947 5214 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Nhlh1Q02576 Dysf-216ENSMUST00000204987 6474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Nhlh1Q02576 Kctd18-210ENSMUST00000164963 2114 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Nhlh1Q02576 Qrfp-201ENSMUST00000057407 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Nhlh1Q02576 Nek1-208ENSMUST00000211256 4810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Nhlh1Q02576 Drc1-201ENSMUST00000101448 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Nhlh1Q02576 Slc25a14-208ENSMUST00000177710 1516 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Nhlh1Q02576 Hdac5-204ENSMUST00000107152 3788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Nhlh1Q02576 Sidt1-205ENSMUST00000136381 4404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Nhlh1Q02576 Hacd2-201ENSMUST00000061156 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Nhlh1Q02576 Cramp1l-201ENSMUST00000073337 7517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Nhlh1Q02576 Pkib-203ENSMUST00000095668 3311 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Nhlh1Q02576 Cd14-201ENSMUST00000061829 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Nhlh1Q02576 Pcnx3-202ENSMUST00000113615 7264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Nhlh1Q02576 Jam3-201ENSMUST00000034472 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Nhlh1Q02576 Gm43364-201ENSMUST00000196046 3274 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Nhlh1Q02576 Mapk8ip3-206ENSMUST00000120035 4125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Nhlh1Q02576 Sh3pxd2a-202ENSMUST00000111800 10380 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Nhlh1Q02576 Cpa5-202ENSMUST00000115138 1778 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Nhlh1Q02576 Tnnt3-203ENSMUST00000105941 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Nhlh1Q02576 Tnnt3-204ENSMUST00000105942 720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Nhlh1Q02576 Tnnt3-205ENSMUST00000105943 720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Nhlh1Q02576 Tnnt3-207ENSMUST00000105945 747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Nhlh1Q02576 Tnnt3-208ENSMUST00000105946 765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Nhlh1Q02576 Gm12047-201ENSMUST00000117561 944 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Nhlh1Q02576 Fgf1-203ENSMUST00000117566 418 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Nhlh1Q02576 Defa-ps16-201ENSMUST00000121939 171 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Nhlh1Q02576 Fam229b-208ENSMUST00000139743 679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Nhlh1Q02576 Gm25694-201ENSMUST00000175448 282 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Nhlh1Q02576 Gm24466-201ENSMUST00000179978 109 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Nhlh1Q02576 Gm17797-201ENSMUST00000182175 997 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Nhlh1Q02576 Tspy-ps-203ENSMUST00000186546 989 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Nhlh1Q02576 Pik3r4-206ENSMUST00000188784 1295 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Nhlh1Q02576 6030460B20Rik-201ENSMUST00000191764 1058 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Nhlh1Q02576 Ift22-204ENSMUST00000200153 670 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Nhlh1Q02576 Gm3791-201ENSMUST00000220790 768 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Nhlh1Q02576 AC129017.2-201ENSMUST00000226118 1284 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Nhlh1Q02576 D17H6S53E-201ENSMUST00000061859 2142 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Nhlh1Q02576 Tpm3-rs7-201ENSMUST00000072359 2147 ntAPPRIS P1 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Nhlh1Q02576 Mfsd4b5-202ENSMUST00000073618 2978 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Nhlh1Q02576 Cbx3-ps5-201ENSMUST00000091545 544 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Nhlh1Q02576 Gm10617-201ENSMUST00000098368 1172 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Nhlh1Q02576 Cbx3-ps2-201ENSMUST00000099421 544 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Nhlh1Q02576 Kmt5b-207ENSMUST00000113974 4150 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Nhlh1Q02576 Jaml-201ENSMUST00000050020 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Nhlh1Q02576 Gm5122-202ENSMUST00000216854 1637 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Nhlh1Q02576 Fam160b2-201ENSMUST00000022690 4033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Nhlh1Q02576 Qrsl1-201ENSMUST00000020012 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 72 ms