Protein–RNA interactions for Protein: Q01320

Top2a, DNA topoisomerase 2-alpha, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,528 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Top2aQ01320 Itga6-202ENSMUST00000112101 4156 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Top2aQ01320 Csk-204ENSMUST00000215396 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Top2aQ01320 Pbrm1-206ENSMUST00000112094 5154 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Top2aQ01320 Pou2f3-201ENSMUST00000034513 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Top2aQ01320 Dapk1-201ENSMUST00000044083 5304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Top2aQ01320 Gstm6-204ENSMUST00000106684 1179 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Top2aQ01320 Kdm5c-202ENSMUST00000112584 5900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Top2aQ01320 Ccdc151-202ENSMUST00000115336 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Top2aQ01320 Bud31-203ENSMUST00000160075 928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Top2aQ01320 1810018F18Rik-201ENSMUST00000188253 277 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Top2aQ01320 Gm26901-202ENSMUST00000193106 256 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Top2aQ01320 Celf3-213ENSMUST00000199775 2351 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Top2aQ01320 Nxpe1-ps-201ENSMUST00000209981 1454 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Top2aQ01320 Gm31786-201ENSMUST00000212305 564 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Top2aQ01320 AC241616.1-201ENSMUST00000213741 166 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Top2aQ01320 Slc35b3-201ENSMUST00000021870 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Top2aQ01320 AC160410.1-201ENSMUST00000219298 1972 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Top2aQ01320 AC124687.5-201ENSMUST00000222734 596 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Top2aQ01320 Grm2-201ENSMUST00000023959 4711 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Top2aQ01320 Ttll10-202ENSMUST00000051509 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Top2aQ01320 Hnrnph2-202ENSMUST00000059297 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Top2aQ01320 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Top2aQ01320 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Top2aQ01320 Sparc-202ENSMUST00000108858 2115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Top2aQ01320 Zfp932-203ENSMUST00000112540 2081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Top2aQ01320 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Top2aQ01320 Tpst1-202ENSMUST00000118993 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Top2aQ01320 Nsd3-210ENSMUST00000153597 1865 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Top2aQ01320 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Top2aQ01320 AL732309.2-201ENSMUST00000228052 3210 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Top2aQ01320 Rnft2-202ENSMUST00000121369 4431 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Top2aQ01320 Actr1a-201ENSMUST00000040270 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Top2aQ01320 Gm5148-203ENSMUST00000108105 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Top2aQ01320 Gm14650-201ENSMUST00000120400 889 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Top2aQ01320 Gm16080-201ENSMUST00000152128 692 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Top2aQ01320 Eif4e1b-210ENSMUST00000152204 859 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Top2aQ01320 Gm12847-201ENSMUST00000156219 413 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Top2aQ01320 4930505M18Rik-201ENSMUST00000175854 1288 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Top2aQ01320 Gm29283-201ENSMUST00000187394 288 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Top2aQ01320 Gm7539-201ENSMUST00000189789 630 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Top2aQ01320 Gm8022-201ENSMUST00000191763 904 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Top2aQ01320 Cxcl10-201ENSMUST00000038816 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Top2aQ01320 Fthl17a-201ENSMUST00000048382 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Top2aQ01320 Gm9701-201ENSMUST00000077976 427 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Top2aQ01320 Gsdme-201ENSMUST00000031845 2502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Top2aQ01320 Vsx2-201ENSMUST00000021665 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Top2aQ01320 Sgip1-201ENSMUST00000066824 4305 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Top2aQ01320 Eif4g1-204ENSMUST00000115460 5638 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Top2aQ01320 Steap2-203ENSMUST00000115425 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Top2aQ01320 Cyb5r3-202ENSMUST00000162178 2547 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Top2aQ01320 Slc25a17-201ENSMUST00000023040 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Top2aQ01320 Gm43052-201ENSMUST00000201451 1628 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Top2aQ01320 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Top2aQ01320 Tram1l1-201ENSMUST00000058994 3889 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Top2aQ01320 Lbh-201ENSMUST00000024857 3064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Top2aQ01320 Foxred1-202ENSMUST00000127996 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Top2aQ01320 Nlrx1-202ENSMUST00000168499 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Top2aQ01320 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Top2aQ01320 Tmcc1-208ENSMUST00000173140 1910 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Top2aQ01320 Gm13426-201ENSMUST00000117887 795 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Top2aQ01320 Gm12377-201ENSMUST00000118656 252 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Top2aQ01320 Gm11670-201ENSMUST00000143435 511 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Top2aQ01320 C330019F10Rik-201ENSMUST00000149428 459 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Top2aQ01320 Stard6-206ENSMUST00000174118 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Top2aQ01320 Gm20091-201ENSMUST00000179683 189 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Top2aQ01320 Gm4960-201ENSMUST00000182928 1001 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Top2aQ01320 2310009A05Rik-201ENSMUST00000184126 496 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Top2aQ01320 Tex35-206ENSMUST00000187546 856 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Top2aQ01320 Gm29157-201ENSMUST00000188753 612 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Top2aQ01320 Gm37301-201ENSMUST00000195412 568 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Top2aQ01320 AC153379.1-201ENSMUST00000218174 485 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Top2aQ01320 Gm15446-201ENSMUST00000112544 2417 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Top2aQ01320 Polr3c-201ENSMUST00000029741 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Top2aQ01320 Adgre5-203ENSMUST00000109802 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Top2aQ01320 Gm26637-201ENSMUST00000180880 2289 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Top2aQ01320 Gm38569-201ENSMUST00000205476 2228 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Top2aQ01320 Sez6l-206ENSMUST00000212758 2664 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Top2aQ01320 Sgk3-202ENSMUST00000166384 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Top2aQ01320 Grin1-201ENSMUST00000028335 4238 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Top2aQ01320 Prkcd-201ENSMUST00000022521 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Top2aQ01320 Luc7l3-209ENSMUST00000166312 5244 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Top2aQ01320 Cpeb1-201ENSMUST00000098331 3111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Top2aQ01320 Bco1-203ENSMUST00000176860 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Top2aQ01320 Ccdc85a-201ENSMUST00000042534 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Top2aQ01320 Olfr322-204ENSMUST00000214392 4779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Top2aQ01320 Hps5-201ENSMUST00000014562 4953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Top2aQ01320 Exoc6b-203ENSMUST00000160197 5439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Top2aQ01320 Zfp652-201ENSMUST00000091565 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Top2aQ01320 Gm3372-201ENSMUST00000198806 1792 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Top2aQ01320 Gstm3-201ENSMUST00000004136 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Top2aQ01320 Csgalnact1-203ENSMUST00000130214 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Top2aQ01320 Ccdc15-206ENSMUST00000217238 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Top2aQ01320 Pou2f1-209ENSMUST00000160908 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Top2aQ01320 Mrpl55-205ENSMUST00000108787 718 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Top2aQ01320 1700017J07Rik-201ENSMUST00000140241 473 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Top2aQ01320 4930444A19Rik-202ENSMUST00000190007 633 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Top2aQ01320 Gm37944-201ENSMUST00000194233 414 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Top2aQ01320 Gm6370-202ENSMUST00000198912 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Top2aQ01320 Gm45893-201ENSMUST00000211899 247 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Top2aQ01320 Ndufc1-201ENSMUST00000038108 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.6 ms