Protein–RNA interactions for Protein: Q00977

Gjb2, Gap junction beta-2 protein, mousemouse

Predictions only

Length 226 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjb2Q00977 Satb1-208ENSMUST00000144331 6243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gjb2Q00977 Lman1-201ENSMUST00000048260 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gjb2Q00977 Impa1-202ENSMUST00000118410 2988 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gjb2Q00977 Prkaca-202ENSMUST00000211558 1399 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gjb2Q00977 Spata5-201ENSMUST00000029277 2890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gjb2Q00977 Il27ra-201ENSMUST00000005601 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gjb2Q00977 Prox1-203ENSMUST00000177288 3144 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gjb2Q00977 Anxa9-204ENSMUST00000164406 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gjb2Q00977 Gm4900-201ENSMUST00000222046 1628 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Gjb2Q00977 Eif3a-201ENSMUST00000025955 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gjb2Q00977 Nfkbiz-202ENSMUST00000096026 4067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gjb2Q00977 Gm35021-201ENSMUST00000210105 2329 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gjb2Q00977 Tmem8b-209ENSMUST00000167153 4101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gjb2Q00977 Tnc-201ENSMUST00000030056 6833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gjb2Q00977 Sod3-201ENSMUST00000101208 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gjb2Q00977 Vmn2r18-201ENSMUST00000165928 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gjb2Q00977 Gfm2-202ENSMUST00000042084 3074 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gjb2Q00977 Fam234b-201ENSMUST00000111915 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gjb2Q00977 Hemk1-201ENSMUST00000035196 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gjb2Q00977 Arhgap24-205ENSMUST00000112853 2853 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gjb2Q00977 Cstad-201ENSMUST00000102853 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gjb2Q00977 Thegl-203ENSMUST00000118941 746 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gjb2Q00977 Gm4917-201ENSMUST00000121452 650 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Gjb2Q00977 Sap25-201ENSMUST00000166099 1101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gjb2Q00977 Gm20426-201ENSMUST00000173657 440 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Gjb2Q00977 Gm27441-201ENSMUST00000185000 105 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Gjb2Q00977 Mrpl20-206ENSMUST00000185148 494 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gjb2Q00977 Gm28746-201ENSMUST00000187453 380 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Gjb2Q00977 Gm5599-201ENSMUST00000209602 788 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Gjb2Q00977 CT485606.1-201ENSMUST00000213187 878 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Gjb2Q00977 Gm19046-201ENSMUST00000221263 1298 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Gjb2Q00977 AC125070.1-201ENSMUST00000223523 555 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gjb2Q00977 AC129219.2-201ENSMUST00000224324 701 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Gjb2Q00977 Odf3-201ENSMUST00000026555 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gjb2Q00977 4921508M14Rik-201ENSMUST00000061679 1099 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Gjb2Q00977 Gm11938-201ENSMUST00000072306 663 ntAPPRIS P1 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gjb2Q00977 Naa10-202ENSMUST00000096316 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gjb2Q00977 Furin-202ENSMUST00000120753 4332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gjb2Q00977 Efcab14-203ENSMUST00000106524 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gjb2Q00977 Tcp10a-203ENSMUST00000129709 1778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gjb2Q00977 Hipk2-204ENSMUST00000160360 3907 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gjb2Q00977 Gm44617-202ENSMUST00000209122 2763 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gjb2Q00977 Tceanc-202ENSMUST00000112188 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gjb2Q00977 Zfp526-201ENSMUST00000055604 3380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gjb2Q00977 Armc1-201ENSMUST00000029125 3673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gjb2Q00977 Gm45675-201ENSMUST00000211202 3429 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Gjb2Q00977 Cd276-201ENSMUST00000039788 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gjb2Q00977 Hcn1-201ENSMUST00000006991 14141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gjb2Q00977 Gm15883-201ENSMUST00000153562 1690 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gjb2Q00977 Rin1-208ENSMUST00000225427 4503 ntAPPRIS P2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gjb2Q00977 Madd-207ENSMUST00000111369 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gjb2Q00977 Nfx1-201ENSMUST00000030133 4349 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gjb2Q00977 Ttc7b-206ENSMUST00000223020 3307 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gjb2Q00977 4632404M16Rik-201ENSMUST00000197326 2882 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Gjb2Q00977 Parp11-202ENSMUST00000112191 3414 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gjb2Q00977 A930024N18Rik-201ENSMUST00000181251 3955 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gjb2Q00977 Rpap2-204ENSMUST00000112654 2914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gjb2Q00977 Gm11571-201ENSMUST00000136820 2396 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gjb2Q00977 Ostm1-202ENSMUST00000105497 770 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gjb2Q00977 Ccl27a-203ENSMUST00000108033 428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gjb2Q00977 Polr2i-203ENSMUST00000108193 488 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gjb2Q00977 Zmynd11-203ENSMUST00000110634 3824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gjb2Q00977 1700071K01Rik-201ENSMUST00000117522 819 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Gjb2Q00977 Hint1-202ENSMUST00000117710 580 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gjb2Q00977 Gm15869-201ENSMUST00000126427 734 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gjb2Q00977 B9d1os-201ENSMUST00000137010 674 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Gjb2Q00977 Gm14275-201ENSMUST00000152112 430 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gjb2Q00977 Tmem204-202ENSMUST00000153745 902 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gjb2Q00977 Zdhhc4-208ENSMUST00000161915 1216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gjb2Q00977 Gm5294-201ENSMUST00000179205 651 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gjb2Q00977 9930004E17Rik-201ENSMUST00000180031 498 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Gjb2Q00977 Gm10550-201ENSMUST00000188846 982 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gjb2Q00977 Gm43701-201ENSMUST00000202047 391 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gjb2Q00977 Gm17749-201ENSMUST00000216282 690 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gjb2Q00977 AC155637.1-201ENSMUST00000218560 636 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Gjb2Q00977 Gm36176-201ENSMUST00000218749 501 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gjb2Q00977 Sec14l1-202ENSMUST00000090433 4654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gjb2Q00977 Cldn19-202ENSMUST00000094823 4168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gjb2Q00977 2700068H02Rik-201ENSMUST00000137882 1872 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gjb2Q00977 Kyat1-201ENSMUST00000044038 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gjb2Q00977 Satb1-204ENSMUST00000133574 3461 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gjb2Q00977 5033403F01Rik-201ENSMUST00000181376 1678 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gjb2Q00977 Ccdc93-202ENSMUST00000112621 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gjb2Q00977 Gtf3c6-206ENSMUST00000217537 2526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gjb2Q00977 Xlr4c-201ENSMUST00000068551 1500 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gjb2Q00977 Cox15-201ENSMUST00000045562 4798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gjb2Q00977 Rbbp5-201ENSMUST00000027700 3385 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gjb2Q00977 Kif22-ps-201ENSMUST00000119302 1984 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Gjb2Q00977 Gm5766-201ENSMUST00000160520 1977 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Gjb2Q00977 Arc-202ENSMUST00000110009 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gjb2Q00977 Arc-201ENSMUST00000023268 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gjb2Q00977 Smok3a-201ENSMUST00000085886 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gjb2Q00977 Rpl35a-205ENSMUST00000115079 510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gjb2Q00977 Dmrtc1a-204ENSMUST00000121197 1067 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gjb2Q00977 Prss36-208ENSMUST00000156152 1132 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gjb2Q00977 Mrgpra2a-201ENSMUST00000159004 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gjb2Q00977 Ly6l-201ENSMUST00000177479 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gjb2Q00977 Gm7929-201ENSMUST00000178711 624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gjb2Q00977 Gm3015-202ENSMUST00000179803 624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gjb2Q00977 Iqcf3-202ENSMUST00000186668 633 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 93.5 ms