Protein–RNA interactions for Protein: P81068

Irx1, Iroquois-class homeodomain protein IRX-1, mousemouse

Predictions only

Length 480 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irx1P81068 E130018N17Rik-201ENSMUST00000129713 1309 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Irx1P81068 Ift88-201ENSMUST00000122063 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Irx1P81068 Camk1g-201ENSMUST00000016323 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Irx1P81068 Speer4b-201ENSMUST00000053257 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Irx1P81068 Sema4d-201ENSMUST00000021900 4482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Irx1P81068 Fam53a-203ENSMUST00000065162 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Irx1P81068 Bora-201ENSMUST00000022656 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Irx1P81068 Pgf-201ENSMUST00000004913 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Irx1P81068 Oprm1-216ENSMUST00000105611 2420 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Irx1P81068 Gm44190-201ENSMUST00000205083 1401 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Irx1P81068 Tm4sf1-201ENSMUST00000029376 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Irx1P81068 Zer1-201ENSMUST00000044751 4100 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Irx1P81068 4930522L14Rik-201ENSMUST00000100937 599 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Irx1P81068 Gm14028-201ENSMUST00000117434 479 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Irx1P81068 Pom121l12-201ENSMUST00000117584 1039 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Irx1P81068 Rpl19-ps1-201ENSMUST00000121059 591 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Irx1P81068 Endov-204ENSMUST00000129327 1184 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Irx1P81068 Gm11651-201ENSMUST00000130673 529 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Irx1P81068 Gm11944-201ENSMUST00000152576 873 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Irx1P81068 Fundc1-204ENSMUST00000176638 448 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Irx1P81068 Park2-204ENSMUST00000179624 1108 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Irx1P81068 Gm27530-201ENSMUST00000184096 98 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Irx1P81068 AY036118-201ENSMUST00000200021 923 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Irx1P81068 AC160052.1-201ENSMUST00000213173 1248 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Irx1P81068 Gm6653-201ENSMUST00000218063 1288 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Irx1P81068 Gm21027-201ENSMUST00000219300 1236 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Irx1P81068 Cdc34-208ENSMUST00000219791 799 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Irx1P81068 H3f3a-201ENSMUST00000081026 888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Irx1P81068 Gm26448-201ENSMUST00000082446 203 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Irx1P81068 Ebf2-203ENSMUST00000176161 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Irx1P81068 Ubap2l-215ENSMUST00000198322 3385 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Irx1P81068 Nf2-202ENSMUST00000056290 2394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Irx1P81068 Tab1-201ENSMUST00000023050 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Irx1P81068 Atxn1-201ENSMUST00000091628 10569 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Irx1P81068 Pklr-201ENSMUST00000047111 2787 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Irx1P81068 Gm20089-201ENSMUST00000192391 2084 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Irx1P81068 Blk-201ENSMUST00000014597 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Irx1P81068 Fam49a-201ENSMUST00000069005 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Irx1P81068 Gpr155-204ENSMUST00000112044 4201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Irx1P81068 Ptprg-201ENSMUST00000022264 9213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Irx1P81068 Gm20757-201ENSMUST00000182870 1604 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Irx1P81068 Zfp217-201ENSMUST00000063710 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Irx1P81068 Nox4-201ENSMUST00000032781 3753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Irx1P81068 Ss18-202ENSMUST00000040964 4153 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Irx1P81068 Gm15622-201ENSMUST00000143025 1464 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Irx1P81068 Fbxl18-202ENSMUST00000110766 7857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Irx1P81068 Fam90a1b-201ENSMUST00000044989 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Irx1P81068 Synpo2l-203ENSMUST00000119483 3696 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Irx1P81068 Cyp2c53-ps-203ENSMUST00000176493 1443 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Irx1P81068 Ccpg1-206ENSMUST00000140675 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Irx1P81068 Stpg2-201ENSMUST00000062306 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Irx1P81068 3830406C13Rik-209ENSMUST00000224389 2444 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Irx1P81068 Tax1bp3-202ENSMUST00000108477 1153 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Irx1P81068 Hopx-202ENSMUST00000113453 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Irx1P81068 Gm14277-201ENSMUST00000121195 360 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Irx1P81068 Lsm2-207ENSMUST00000173004 870 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Irx1P81068 Tmem267-202ENSMUST00000176171 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Irx1P81068 Gm21859-201ENSMUST00000178424 1045 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Irx1P81068 Gapdh-ps14-201ENSMUST00000183246 1002 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Irx1P81068 Gm29615-201ENSMUST00000185371 697 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
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Irx1P81068 Fxyd2-211ENSMUST00000216289 668 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Irx1P81068 Phpt1-201ENSMUST00000039156 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Irx1P81068 4930564D02Rik-201ENSMUST00000070584 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Irx1P81068 Zfp932-201ENSMUST00000099484 451 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Irx1P81068 Elf2-206ENSMUST00000163748 2656 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Irx1P81068 Elmo3-201ENSMUST00000109375 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Irx1P81068 Zeb2-203ENSMUST00000076836 3913 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Irx1P81068 Crem-233ENSMUST00000154135 2530 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Irx1P81068 D030028A08Rik-202ENSMUST00000131501 3542 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Irx1P81068 Tns1-217ENSMUST00000191104 9904 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Irx1P81068 Arhgap24-205ENSMUST00000112853 2853 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Irx1P81068 Akr1c6-201ENSMUST00000021630 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Irx1P81068 AC109214.1-201ENSMUST00000219520 1372 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Irx1P81068 Elmod3-201ENSMUST00000070990 2122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Irx1P81068 Cep350-204ENSMUST00000138762 13307 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Irx1P81068 Pcdhga7-201ENSMUST00000192511 4730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Irx1P81068 Timeless-201ENSMUST00000055539 4457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Irx1P81068 Sun1-205ENSMUST00000110883 3714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Irx1P81068 Zfp964-203ENSMUST00000204285 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Irx1P81068 Akap12-201ENSMUST00000045730 6195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Irx1P81068 Gm18798-201ENSMUST00000187264 1700 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Irx1P81068 Uba1y-ps1-201ENSMUST00000188314 1708 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Irx1P81068 Cx3cl1-201ENSMUST00000034230 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Irx1P81068 Ighg2b-202ENSMUST00000192188 2566 ntAPPRIS P5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Irx1P81068 Ptp4a3-203ENSMUST00000165541 3539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Irx1P81068 Angel1-201ENSMUST00000021682 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
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