Protein–RNA interactions for Protein: P70217

Hoxd13, Homeobox protein Hox-D13, mousemouse

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Length 339 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd13P70217 Tfdp2-205ENSMUST00000179416 2408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Hoxd13P70217 Kdm5c-201ENSMUST00000082177 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Hoxd13P70217 Zmat1-201ENSMUST00000064659 3501 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Hoxd13P70217 Triml2-202ENSMUST00000209200 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Hoxd13P70217 4921524J17Rik-201ENSMUST00000047749 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Hoxd13P70217 4930402K13Rik-201ENSMUST00000059967 1781 ntAPPRIS P1 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Hoxd13P70217 Acly-201ENSMUST00000007131 4393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Hoxd13P70217 Sspn-201ENSMUST00000032383 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Hoxd13P70217 Sh3tc2-201ENSMUST00000051720 4536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Hoxd13P70217 Itgb4-204ENSMUST00000106460 5919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Hoxd13P70217 Kcnma1-207ENSMUST00000172099 3354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Hoxd13P70217 Nars2-201ENSMUST00000044466 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Hoxd13P70217 Jak3-203ENSMUST00000110013 4009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Hoxd13P70217 A230077H06Rik-202ENSMUST00000189574 2477 ntTSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Hoxd13P70217 Kcnk10-201ENSMUST00000110113 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Hoxd13P70217 Wars-201ENSMUST00000109848 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Hoxd13P70217 Ppp3r1-201ENSMUST00000102880 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Hoxd13P70217 Prkar1a-201ENSMUST00000049527 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Hoxd13P70217 Matn2-202ENSMUST00000163455 3577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Hoxd13P70217 Gm15625-201ENSMUST00000117617 1093 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Hoxd13P70217 Gm13094-201ENSMUST00000117930 409 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Hoxd13P70217 Olfr29-ps1-201ENSMUST00000117959 963 ntAPPRIS P1 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Hoxd13P70217 Gm5909-201ENSMUST00000119768 1281 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Hoxd13P70217 Gm13204-201ENSMUST00000120110 821 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Hoxd13P70217 Gm16459-201ENSMUST00000121443 686 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Hoxd13P70217 Gm22344-201ENSMUST00000122642 278 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Hoxd13P70217 Aamdc-206ENSMUST00000136757 789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Hoxd13P70217 Gm12052-201ENSMUST00000142151 933 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Hoxd13P70217 Gm37197-201ENSMUST00000195607 401 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Hoxd13P70217 Gm18010-201ENSMUST00000203553 202 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Hoxd13P70217 Gm44605-201ENSMUST00000206892 949 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Hoxd13P70217 Gm45258-201ENSMUST00000210042 853 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Hoxd13P70217 Atp5j2-201ENSMUST00000037056 540 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Hoxd13P70217 Lsm3-201ENSMUST00000040607 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Hoxd13P70217 Olfr1313-201ENSMUST00000099599 938 ntAPPRIS P1 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Hoxd13P70217 Il1f5-205ENSMUST00000147885 1392 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Hoxd13P70217 Arhgap33-201ENSMUST00000044338 4280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Hoxd13P70217 Tns2-201ENSMUST00000046144 4718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Hoxd13P70217 Vstm2a-202ENSMUST00000109647 1745 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Hoxd13P70217 Rbm47-209ENSMUST00000201544 5211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Hoxd13P70217 Timd2-201ENSMUST00000055102 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Hoxd13P70217 Ubl5-201ENSMUST00000129414 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Hoxd13P70217 Traf3ip3-201ENSMUST00000043550 2122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Hoxd13P70217 Acoxl-201ENSMUST00000028859 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Hoxd13P70217 Tex10-206ENSMUST00000164866 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Hoxd13P70217 Adck2-204ENSMUST00000140364 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Hoxd13P70217 Sh3tc1-201ENSMUST00000070203 4549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Hoxd13P70217 Foxn2-201ENSMUST00000112238 5085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Hoxd13P70217 Kdm2a-201ENSMUST00000047898 8578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Hoxd13P70217 Gtf2i-210ENSMUST00000173341 4302 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Hoxd13P70217 Dtl-201ENSMUST00000027933 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Hoxd13P70217 Gm15587-201ENSMUST00000146326 3493 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Hoxd13P70217 Acad8-202ENSMUST00000120367 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Hoxd13P70217 Il2rb-201ENSMUST00000089398 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Hoxd13P70217 Zbtb43-203ENSMUST00000113156 1828 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Hoxd13P70217 Gypa-201ENSMUST00000063359 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Hoxd13P70217 Il34-201ENSMUST00000076846 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Hoxd13P70217 4921507G05Rik-201ENSMUST00000181348 1653 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Hoxd13P70217 Bpifb1-202ENSMUST00000081816 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Hoxd13P70217 Hsd3b3-204ENSMUST00000107019 1533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
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Hoxd13P70217 Nit1-203ENSMUST00000111296 1394 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Hoxd13P70217 Gm42498-201ENSMUST00000199981 1372 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
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Hoxd13P70217 Gm12745-201ENSMUST00000121767 214 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Hoxd13P70217 Gm15498-201ENSMUST00000126693 723 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Hoxd13P70217 Treml4-203ENSMUST00000136272 811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Hoxd13P70217 Tpi1-203ENSMUST00000149610 802 ntTSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Hoxd13P70217 Gm12426-201ENSMUST00000153083 371 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Hoxd13P70217 Treml4-206ENSMUST00000154335 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Hoxd13P70217 1700001J11Rik-201ENSMUST00000185917 759 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Hoxd13P70217 Gm37723-201ENSMUST00000194480 565 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Hoxd13P70217 Gm40639-201ENSMUST00000214642 625 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Hoxd13P70217 AC160929.1-201ENSMUST00000221247 415 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Hoxd13P70217 AC154532.1-201ENSMUST00000227860 965 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Hoxd13P70217 Olfr435-201ENSMUST00000058118 942 ntAPPRIS P1 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Hoxd13P70217 Olfr115-201ENSMUST00000076936 939 ntAPPRIS P2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Hoxd13P70217 St14-201ENSMUST00000034478 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Hoxd13P70217 Tmem129-201ENSMUST00000019439 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Hoxd13P70217 Dhx30-212ENSMUST00000197928 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Hoxd13P70217 Pcsk7-209ENSMUST00000216672 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Hoxd13P70217 Fxr1-204ENSMUST00000197694 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Hoxd13P70217 Akap3-201ENSMUST00000095440 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Hoxd13P70217 Gm13135-201ENSMUST00000117628 3121 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
Hoxd13P70217 Zfp516-202ENSMUST00000171238 7725 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Hoxd13P70217 Zfp516-201ENSMUST00000071233 7703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Hoxd13P70217 Cpeb1-209ENSMUST00000178892 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Hoxd13P70217 Zim1-203ENSMUST00000203908 1740 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Hoxd13P70217 D630008O14Rik-201ENSMUST00000144260 1568 ntTSL 2 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Hoxd13P70217 Gm4780-202ENSMUST00000215200 2644 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
Hoxd13P70217 Gaa-203ENSMUST00000106259 3633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Hoxd13P70217 Hmgcs2-202ENSMUST00000120541 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Hoxd13P70217 Ccdc114-201ENSMUST00000038720 2460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Hoxd13P70217 2610028H24Rik-202ENSMUST00000105415 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Hoxd13P70217 Palld-204ENSMUST00000121785 6349 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Hoxd13P70217 Rbp3-201ENSMUST00000035695 5295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Hoxd13P70217 Mest-210ENSMUST00000157040 2383 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Hoxd13P70217 Tat-201ENSMUST00000001720 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Hoxd13P70217 Traf7-201ENSMUST00000070777 2384 ntTSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
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