Protein–RNA interactions for Protein: P62069

Usp46, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 46, mousemouse

Predictions only

Length 366 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp46P62069 Chrne-201ENSMUST00000014753 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Usp46P62069 Gm20757-201ENSMUST00000182870 1604 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Usp46P62069 Gm4900-201ENSMUST00000222046 1628 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Usp46P62069 Igsf3-201ENSMUST00000043983 7371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Usp46P62069 Gm20121-201ENSMUST00000198547 1594 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Usp46P62069 Grip2-201ENSMUST00000159684 3006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Usp46P62069 Gm6655-201ENSMUST00000201932 1309 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Usp46P62069 Gm14169-201ENSMUST00000124676 2519 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Usp46P62069 Ablim1-210ENSMUST00000111550 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Usp46P62069 Wdr45-203ENSMUST00000115688 1510 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Usp46P62069 Gm26013-201ENSMUST00000104404 119 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Usp46P62069 Gm4294-201ENSMUST00000105169 614 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Usp46P62069 Polr2i-203ENSMUST00000108193 488 ntTSL 3 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Usp46P62069 Cetn2-203ENSMUST00000114551 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Usp46P62069 Gm5392-201ENSMUST00000122189 789 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Usp46P62069 Mir1901-201ENSMUST00000122616 78 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Usp46P62069 Gm12446-201ENSMUST00000123933 798 ntTSL 3 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Usp46P62069 Smim1-204ENSMUST00000130175 477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Usp46P62069 Smim1-206ENSMUST00000132541 490 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Usp46P62069 Gm14236-201ENSMUST00000142374 872 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Usp46P62069 Gm16347-202ENSMUST00000149000 772 ntTSL 3 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Usp46P62069 Gm25492-201ENSMUST00000157383 129 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Usp46P62069 Gm15734-201ENSMUST00000163076 1040 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Usp46P62069 Gm7289-201ENSMUST00000168993 734 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Usp46P62069 Gm17727-201ENSMUST00000171898 643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Usp46P62069 Gm26238-201ENSMUST00000175538 117 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Usp46P62069 Tceanc-203ENSMUST00000180322 1080 ntAPPRIS P1 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Usp46P62069 Mir6998-201ENSMUST00000183343 64 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Usp46P62069 Gm8531-201ENSMUST00000188319 893 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Usp46P62069 Vmn1r-ps7-201ENSMUST00000202355 928 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Usp46P62069 Lect2-202ENSMUST00000225183 823 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Usp46P62069 AC154527.3-201ENSMUST00000225519 989 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Usp46P62069 Cysrt1-201ENSMUST00000043379 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Usp46P62069 Lyrm1-201ENSMUST00000054440 752 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Usp46P62069 Lect2-201ENSMUST00000062806 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Usp46P62069 Lhfpl5-201ENSMUST00000080780 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Usp46P62069 1810009A15Rik-201ENSMUST00000096251 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Usp46P62069 Atxn2l-203ENSMUST00000167759 4023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Usp46P62069 Kir3dl2-202ENSMUST00000113108 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Usp46P62069 Rprd1b-203ENSMUST00000109518 4399 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Usp46P62069 Thrap3-201ENSMUST00000080919 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Usp46P62069 Sh3pxd2a-202ENSMUST00000111800 10380 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Usp46P62069 Lrmp-201ENSMUST00000032396 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Usp46P62069 Ly75-202ENSMUST00000112533 6901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Usp46P62069 Lgr5-208ENSMUST00000173740 2508 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Usp46P62069 Lhx9-204ENSMUST00000112026 2065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Usp46P62069 Cdrt4os1-201ENSMUST00000130177 2090 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Usp46P62069 Dhx30-212ENSMUST00000197928 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Usp46P62069 B230317F23Rik-201ENSMUST00000052189 2472 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Usp46P62069 Frmpd1-202ENSMUST00000107804 5241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Usp46P62069 Acvr1c-201ENSMUST00000028178 9162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Usp46P62069 Ttc30a2-201ENSMUST00000099995 2431 ntAPPRIS P1 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Usp46P62069 Txndc5-204ENSMUST00000162075 2619 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Usp46P62069 Parvg-201ENSMUST00000023074 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Usp46P62069 Galntl6-208ENSMUST00000204128 5680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Usp46P62069 Gm26642-201ENSMUST00000180981 2782 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Usp46P62069 Nhlh2-201ENSMUST00000066187 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Usp46P62069 Gm39204-201ENSMUST00000210045 1307 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Usp46P62069 Catsper3-201ENSMUST00000021961 1330 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Usp46P62069 Ndc1-204ENSMUST00000139560 4584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Usp46P62069 Gm37082-201ENSMUST00000192629 1927 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Usp46P62069 A130077B15Rik-201ENSMUST00000219429 2547 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Usp46P62069 Akap10-202ENSMUST00000102650 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Usp46P62069 Cmklr1-201ENSMUST00000047936 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Usp46P62069 Gm43221-201ENSMUST00000197612 2071 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Usp46P62069 Aldoart2-201ENSMUST00000080123 1658 ntAPPRIS P1 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Usp46P62069 Cep112-202ENSMUST00000106715 1161 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Usp46P62069 E130114P18Rik-201ENSMUST00000107067 1092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Usp46P62069 Gm10999-201ENSMUST00000108743 207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Usp46P62069 4933400A11Rik-203ENSMUST00000112102 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Usp46P62069 Acrbp-204ENSMUST00000112413 672 ntTSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Usp46P62069 Gm13924-201ENSMUST00000119899 486 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Usp46P62069 Gm14395-201ENSMUST00000120494 563 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Usp46P62069 Dnmt3l-203ENSMUST00000131825 1113 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Usp46P62069 Dnmt3l-206ENSMUST00000139539 1279 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Usp46P62069 Fhit-204ENSMUST00000161302 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Usp46P62069 Gm16147-201ENSMUST00000162143 373 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Usp46P62069 Gm13147-202ENSMUST00000177526 1173 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Usp46P62069 Trav13d-3-201ENSMUST00000179512 391 ntAPPRIS P1 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Usp46P62069 Trav13n-3-201ENSMUST00000179580 337 ntAPPRIS P1 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Usp46P62069 Gm9358-201ENSMUST00000183067 927 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Usp46P62069 Ccdc12-201ENSMUST00000019803 834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Usp46P62069 Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Usp46P62069 Gm7600-201ENSMUST00000209657 785 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Usp46P62069 Gm31166-202ENSMUST00000210638 1268 ntTSL 3 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Usp46P62069 Gm45488-201ENSMUST00000210747 371 ntTSL 3 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Usp46P62069 Gm40652-201ENSMUST00000218944 895 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Usp46P62069 Gm40578-201ENSMUST00000220837 390 ntTSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Usp46P62069 Gm6722-201ENSMUST00000221586 390 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Usp46P62069 Olfr1277-201ENSMUST00000099619 962 ntAPPRIS P1 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Usp46P62069 3830406C13Rik-209ENSMUST00000224389 2444 ntAPPRIS P1 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Usp46P62069 Bpnt1-201ENSMUST00000027916 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Usp46P62069 Myo7a-203ENSMUST00000107127 6806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Usp46P62069 Zc3hc1-201ENSMUST00000080812 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Usp46P62069 Plrg1-202ENSMUST00000122128 1608 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Usp46P62069 Gm44573-201ENSMUST00000191753 2370 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Usp46P62069 Wdcp-202ENSMUST00000085793 1992 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Usp46P62069 Vmn1r45-206ENSMUST00000227977 3297 ntAPPRIS P1 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Usp46P62069 Btnl4-201ENSMUST00000065841 1761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Usp46P62069 Meaf6-205ENSMUST00000154689 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.3 ms