Protein–RNA interactions for Protein: P55194

Sh3bp1, SH3 domain-binding protein 1, mousemouse

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Length 680 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp1P55194 Ninl-201ENSMUST00000109896 5093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Sh3bp1P55194 Prdx1-202ENSMUST00000106470 877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Sh3bp1P55194 Gm12165-201ENSMUST00000117047 342 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Sh3bp1P55194 Gm11663-201ENSMUST00000117888 290 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Sh3bp1P55194 Gm13408-201ENSMUST00000119822 798 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Sh3bp1P55194 Gm13935-201ENSMUST00000121859 798 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Sh3bp1P55194 Psma1-203ENSMUST00000135570 960 ntTSL 3 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Sh3bp1P55194 Gm53-203ENSMUST00000143887 757 ntTSL 3 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Sh3bp1P55194 Gm11683-201ENSMUST00000147006 918 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Sh3bp1P55194 Gm44805-202ENSMUST00000150569 587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Sh3bp1P55194 Gm23085-201ENSMUST00000157849 293 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Sh3bp1P55194 Omt2a-203ENSMUST00000166056 1167 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Sh3bp1P55194 Spaca6-209ENSMUST00000172097 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Sh3bp1P55194 Ctdspl-202ENSMUST00000172464 798 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Sh3bp1P55194 Ssty2-201ENSMUST00000179136 684 ntAPPRIS P1 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Sh3bp1P55194 Gm5523-201ENSMUST00000180415 997 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Sh3bp1P55194 Gm8100-201ENSMUST00000182906 988 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Sh3bp1P55194 Smim22-207ENSMUST00000184439 382 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Sh3bp1P55194 Gm19353-201ENSMUST00000184561 445 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Sh3bp1P55194 Mir124-2hg-207ENSMUST00000189868 535 ntTSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Sh3bp1P55194 Ssty2-202ENSMUST00000190565 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Sh3bp1P55194 Rbakdn-201ENSMUST00000198334 520 ntTSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Sh3bp1P55194 Gm2965-201ENSMUST00000198365 343 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Sh3bp1P55194 Gm45781-201ENSMUST00000212860 539 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Sh3bp1P55194 AC154680.1-201ENSMUST00000224376 859 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Sh3bp1P55194 1700128F08Rik-201ENSMUST00000034483 1110 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Sh3bp1P55194 Ntng1-201ENSMUST00000051253 327 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Sh3bp1P55194 Krtap5-1-201ENSMUST00000084413 588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Sh3bp1P55194 Gm10288-201ENSMUST00000084614 537 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Sh3bp1P55194 Exoc7-202ENSMUST00000106411 3205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Sh3bp1P55194 Atp6v0e2-202ENSMUST00000203011 1612 ntTSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Sh3bp1P55194 Scaf4-202ENSMUST00000163419 4169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Sh3bp1P55194 Ppp2r2a-201ENSMUST00000089230 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Sh3bp1P55194 Gem-202ENSMUST00000108304 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Sh3bp1P55194 Cxcr2-201ENSMUST00000027372 2220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Sh3bp1P55194 Mdm1-203ENSMUST00000164077 2922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Sh3bp1P55194 Tnxb-201ENSMUST00000087399 12209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Sh3bp1P55194 Anapc15-213ENSMUST00000178851 2797 ntTSL 2 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Sh3bp1P55194 A1cf-201ENSMUST00000075838 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Sh3bp1P55194 Syk-201ENSMUST00000055087 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Sh3bp1P55194 Nfic-203ENSMUST00000105321 6237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Sh3bp1P55194 Arnt2-213ENSMUST00000209133 6228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Sh3bp1P55194 Ttc29-202ENSMUST00000109902 1416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Sh3bp1P55194 Gm13556-201ENSMUST00000132692 1412 ntTSL 3 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Sh3bp1P55194 Cd79b-201ENSMUST00000044228 1431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Sh3bp1P55194 Mccc1os-202ENSMUST00000137198 2686 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Sh3bp1P55194 Dixdc1-203ENSMUST00000117646 5719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Sh3bp1P55194 Tubgcp5-205ENSMUST00000205796 3448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Sh3bp1P55194 Bnip3l-ps-201ENSMUST00000101577 657 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
Sh3bp1P55194 Mir680-2-201ENSMUST00000102163 110 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
Sh3bp1P55194 Gm23251-201ENSMUST00000103773 110 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
Sh3bp1P55194 Gm7851-201ENSMUST00000117574 323 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
Sh3bp1P55194 D630008O14Rik-202ENSMUST00000149909 1043 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Sh3bp1P55194 Fhit-201ENSMUST00000160340 1094 ntTSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Sh3bp1P55194 Gm15954-201ENSMUST00000160746 466 ntTSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Sh3bp1P55194 Gm9550-201ENSMUST00000161130 862 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
Sh3bp1P55194 Fhit-208ENSMUST00000179394 453 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Sh3bp1P55194 Crnde-207ENSMUST00000180102 732 ntTSL 3 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Sh3bp1P55194 Gm21976-204ENSMUST00000186911 528 ntTSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Sh3bp1P55194 Gm37246-201ENSMUST00000192665 835 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
Sh3bp1P55194 Gm42682-201ENSMUST00000198349 1265 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
Sh3bp1P55194 0610033M10Rik-201ENSMUST00000204546 506 ntTSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Sh3bp1P55194 Isg20-206ENSMUST00000205981 834 ntTSL 3 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Sh3bp1P55194 Bnip3l-ps-202ENSMUST00000220709 1132 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
Sh3bp1P55194 Rpl10a-201ENSMUST00000042334 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Sh3bp1P55194 Lcn6-201ENSMUST00000059693 1254 ntTSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Sh3bp1P55194 Megf8-201ENSMUST00000128119 10040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Sh3bp1P55194 Sap30bpos-201ENSMUST00000132264 2352 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Sh3bp1P55194 Myo7a-201ENSMUST00000084979 6849 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Sh3bp1P55194 Zfp629-201ENSMUST00000058038 6120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Sh3bp1P55194 Invs-201ENSMUST00000030029 5633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Sh3bp1P55194 Qars-201ENSMUST00000006838 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Sh3bp1P55194 Tchhl1-201ENSMUST00000029516 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Sh3bp1P55194 Nit1-201ENSMUST00000111289 3041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Sh3bp1P55194 Tom1l2-204ENSMUST00000095254 4940 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Sh3bp1P55194 Cutal-203ENSMUST00000113068 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Sh3bp1P55194 Alms1-ps2-202ENSMUST00000161983 2290 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
Sh3bp1P55194 Pacsin1-201ENSMUST00000045896 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Sh3bp1P55194 Camk1g-201ENSMUST00000016323 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Sh3bp1P55194 Thbs2-201ENSMUST00000170872 5922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Sh3bp1P55194 Man2c1-211ENSMUST00000160147 3820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Sh3bp1P55194 Arntl2-203ENSMUST00000111638 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Sh3bp1P55194 Slc6a18-204ENSMUST00000220650 1728 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Sh3bp1P55194 Arntl2-201ENSMUST00000080530 1740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Sh3bp1P55194 N6amt1-204ENSMUST00000120284 3473 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Sh3bp1P55194 Nrap-203ENSMUST00000095947 5214 ntTSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Sh3bp1P55194 Gm10614-201ENSMUST00000181414 2538 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Sh3bp1P55194 Pdp1-202ENSMUST00000095144 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Sh3bp1P55194 Col6a6-202ENSMUST00000098441 8781 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Sh3bp1P55194 2810454H06Rik-201ENSMUST00000189942 3148 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
Sh3bp1P55194 Gm44597-202ENSMUST00000203287 3516 ntTSL 2 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Sh3bp1P55194 Ablim2-204ENSMUST00000114204 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Sh3bp1P55194 Stat5b-202ENSMUST00000107358 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Sh3bp1P55194 Aldh1a3-201ENSMUST00000015278 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Sh3bp1P55194 A630052C17Rik-201ENSMUST00000129876 2203 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Sh3bp1P55194 C130050O18Rik-202ENSMUST00000163940 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Sh3bp1P55194 Tor1aip2-201ENSMUST00000060404 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Sh3bp1P55194 4930512J16Rik-201ENSMUST00000203704 1859 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Sh3bp1P55194 Gm45041-201ENSMUST00000207366 3108 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Sh3bp1P55194 Tfam-201ENSMUST00000092430 4167 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
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