Protein–RNA interactions for Protein: P49446

Ptpre, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase epsilon, mousemouse

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Length 699 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtpreP49446 Gm42732-201ENSMUST00000202887 1197 ntBASIC12.56□□□□□ -0.4
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PtpreP49446 Klk1b15-ps-201ENSMUST00000206273 715 ntBASIC12.56□□□□□ -0.4
PtpreP49446 AC122860.1-201ENSMUST00000217669 773 ntTSL 3 BASIC12.56□□□□□ -0.4
PtpreP49446 AC168059.2-201ENSMUST00000224473 333 ntBASIC12.56□□□□□ -0.4
PtpreP49446 CT010480.2-201ENSMUST00000225424 737 ntBASIC12.56□□□□□ -0.4
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PtpreP49446 Defb12-201ENSMUST00000062113 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
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PtpreP49446 Nme5-201ENSMUST00000079287 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
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PtpreP49446 Speer4d-201ENSMUST00000095006 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
PtpreP49446 Rtp4-202ENSMUST00000209422 1859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
PtpreP49446 Mgmt-201ENSMUST00000081510 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
PtpreP49446 Fam177a-201ENSMUST00000177768 3922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
PtpreP49446 Mmel1-207ENSMUST00000163732 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
PtpreP49446 AC126257.2-201ENSMUST00000215507 2300 ntBASIC12.56□□□□□ -0.4
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PtpreP49446 Ceacam9-201ENSMUST00000001984 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
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PtpreP49446 Fbp2-201ENSMUST00000021907 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
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PtpreP49446 Synpo-211ENSMUST00000155195 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
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PtpreP49446 Kcnb1-204ENSMUST00000207917 11153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
PtpreP49446 Gabbr1-203ENSMUST00000172792 4036 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
PtpreP49446 Zfp467-204ENSMUST00000114559 3163 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
PtpreP49446 Mocs2-216ENSMUST00000184672 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
PtpreP49446 Nudt8-201ENSMUST00000155405 3904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.55□□□□□ -0.4
PtpreP49446 Rprd1b-203ENSMUST00000109518 4399 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
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PtpreP49446 Jph2-202ENSMUST00000109425 4155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
PtpreP49446 Slc7a4-207ENSMUST00000172164 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
PtpreP49446 Gtf2e1-201ENSMUST00000023525 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
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PtpreP49446 Gm34312-201ENSMUST00000204650 1092 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
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PtpreP49446 Hsd17b3-201ENSMUST00000039832 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
PtpreP49446 Rnf181-202ENSMUST00000069595 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
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PtpreP49446 Smap1-202ENSMUST00000129254 1365 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
PtpreP49446 Pdzrn4-202ENSMUST00000169942 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
PtpreP49446 Gfap-201ENSMUST00000067444 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
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PtpreP49446 Armt1-203ENSMUST00000118544 5044 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
PtpreP49446 Gm14005-210ENSMUST00000225087 1413 ntBASIC12.54□□□□□ -0.4
PtpreP49446 Cc2d1a-202ENSMUST00000117424 3262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
PtpreP49446 Smtn-204ENSMUST00000110011 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
PtpreP49446 Ildr1-201ENSMUST00000023617 3042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
PtpreP49446 Ehbp1l1-202ENSMUST00000075606 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
PtpreP49446 Mamld1-202ENSMUST00000114629 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
PtpreP49446 AU015791-201ENSMUST00000223443 1457 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
PtpreP49446 Myo9b-202ENSMUST00000168839 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
PtpreP49446 Gm43242-201ENSMUST00000199507 1776 ntBASIC12.54□□□□□ -0.4
PtpreP49446 Prkag3-201ENSMUST00000081636 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
PtpreP49446 Syt15-202ENSMUST00000119693 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
PtpreP49446 Trak1-213ENSMUST00000211439 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
PtpreP49446 Gm10999-201ENSMUST00000108743 207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
PtpreP49446 Grin1-205ENSMUST00000114312 3838 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
PtpreP49446 Grin1-207ENSMUST00000114317 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
PtpreP49446 Snord23-201ENSMUST00000116828 109 ntBASIC12.54□□□□□ -0.4
PtpreP49446 Grm4-202ENSMUST00000118489 2976 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
PtpreP49446 Cfap100-204ENSMUST00000134224 849 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
PtpreP49446 Gm11981-201ENSMUST00000139769 664 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
PtpreP49446 2310040G07Rik-202ENSMUST00000145897 462 ntTSL 3 BASIC12.54□□□□□ -0.4
PtpreP49446 1700057H21Rik-202ENSMUST00000154530 506 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
PtpreP49446 Gm5529-201ENSMUST00000165691 891 ntBASIC12.54□□□□□ -0.4
PtpreP49446 Gm44696-201ENSMUST00000181943 1229 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
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