Protein–RNA interactions for Protein: P48281

Vdr, Vitamin D3 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 422 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VdrP48281 Gm18539-201ENSMUST00000204745 1090 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
VdrP48281 Gm38979-201ENSMUST00000207099 698 ntTSL 3 BASIC11.38□□□□□ -0.59
VdrP48281 Cdc34-208ENSMUST00000219791 799 ntTSL 3 BASIC11.38□□□□□ -0.59
VdrP48281 Tmem14a-202ENSMUST00000027065 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
VdrP48281 Fabp4-201ENSMUST00000029041 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
VdrP48281 Gm9072-201ENSMUST00000218390 1514 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
VdrP48281 Inpp4a-202ENSMUST00000058307 2963 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
VdrP48281 Rere-202ENSMUST00000105682 7728 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
VdrP48281 Cacna1c-226ENSMUST00000219833 7591 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
VdrP48281 Mcf2l-217ENSMUST00000145067 5313 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
VdrP48281 Tom1-201ENSMUST00000078847 1769 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
VdrP48281 Tspear-201ENSMUST00000092366 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
VdrP48281 Mageb4-201ENSMUST00000096378 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
VdrP48281 Adgrl3-215ENSMUST00000120673 5178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
VdrP48281 Grem1-201ENSMUST00000099575 4148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
VdrP48281 Xirp1-201ENSMUST00000111635 5839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
VdrP48281 Tmem184b-202ENSMUST00000178522 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
VdrP48281 AA474408-201ENSMUST00000098110 3339 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
VdrP48281 Gm20498-203ENSMUST00000166664 2284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
VdrP48281 Dyrk4-202ENSMUST00000078521 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
VdrP48281 Anxa9-202ENSMUST00000107183 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
VdrP48281 Nos3-202ENSMUST00000115090 3697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
VdrP48281 H2-T3-201ENSMUST00000025312 2114 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
VdrP48281 Paqr8-203ENSMUST00000187651 1463 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
VdrP48281 Gm17767-201ENSMUST00000189410 1470 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
VdrP48281 Fbxo39-201ENSMUST00000108504 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
VdrP48281 Bace1-202ENSMUST00000078111 4041 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
VdrP48281 Zfp384-204ENSMUST00000088308 2875 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
VdrP48281 Trappc9-202ENSMUST00000089770 4047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
VdrP48281 Trim36-202ENSMUST00000167364 4543 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
VdrP48281 Gm8872-201ENSMUST00000197475 1341 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
VdrP48281 Gm31816-202ENSMUST00000209591 1332 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
VdrP48281 Zdhhc3-208ENSMUST00000147563 6987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
VdrP48281 Pip5k1b-201ENSMUST00000025800 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
VdrP48281 Rfesd-201ENSMUST00000050997 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
VdrP48281 Tcte1-201ENSMUST00000113547 3074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
VdrP48281 Mical1-203ENSMUST00000119962 3565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
VdrP48281 3830406C13Rik-209ENSMUST00000224389 2444 ntAPPRIS P1 BASIC11.37□□□□□ -0.59
VdrP48281 Trim16-202ENSMUST00000072639 1929 ntTSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
VdrP48281 Ift88os-201ENSMUST00000149702 2016 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
VdrP48281 Bahcc1-203ENSMUST00000122148 10712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
VdrP48281 C030037D09Rik-203ENSMUST00000138007 3220 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
VdrP48281 Wsb2-ps-201ENSMUST00000117937 1217 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
VdrP48281 Gm15884-201ENSMUST00000143765 643 ntTSL 3 BASIC11.37□□□□□ -0.59
VdrP48281 Csn3-201ENSMUST00000001667 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
VdrP48281 Mir3547-201ENSMUST00000175461 88 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
VdrP48281 Gm43138-201ENSMUST00000199123 708 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
VdrP48281 Gm36503-201ENSMUST00000204284 875 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
VdrP48281 1700011D18Rik-201ENSMUST00000205762 277 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
VdrP48281 Gm45072-201ENSMUST00000208673 929 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
VdrP48281 Lysmd4-208ENSMUST00000208698 551 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
VdrP48281 Gm45399-201ENSMUST00000209955 1016 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
VdrP48281 Gm18212-201ENSMUST00000211678 889 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
VdrP48281 Acy1-208ENSMUST00000214275 1284 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
VdrP48281 Clec4b2-201ENSMUST00000088455 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
VdrP48281 Zfp629-203ENSMUST00000122066 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
VdrP48281 AC149588.2-201ENSMUST00000228182 1859 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
VdrP48281 Srgap3-202ENSMUST00000088373 8887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
VdrP48281 Gm42669-202ENSMUST00000160160 3080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
VdrP48281 Gm45165-201ENSMUST00000207763 1631 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
VdrP48281 Gm42879-201ENSMUST00000198656 2214 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
VdrP48281 Disp1-201ENSMUST00000003035 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
VdrP48281 Pomt1-201ENSMUST00000036473 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
VdrP48281 Tenm2-201ENSMUST00000057207 8298 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
VdrP48281 Tdrd3-202ENSMUST00000168275 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
VdrP48281 Gpr37-202ENSMUST00000200812 3035 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
VdrP48281 Cnot8-202ENSMUST00000108843 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
VdrP48281 Acsm2-202ENSMUST00000098084 2099 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
VdrP48281 Ern1-201ENSMUST00000001059 6946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
VdrP48281 Armt1-201ENSMUST00000095893 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
VdrP48281 Gm43908-201ENSMUST00000205074 1472 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
VdrP48281 Hsd17b6-203ENSMUST00000219447 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
VdrP48281 Mum1l1-204ENSMUST00000113045 4523 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.37□□□□□ -0.59
VdrP48281 Gtf3c6-206ENSMUST00000217537 2526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
VdrP48281 Fbxl18-202ENSMUST00000110766 7857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
VdrP48281 Slc38a4-202ENSMUST00000166223 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
VdrP48281 Gpr63-201ENSMUST00000038920 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
VdrP48281 Fam184b-201ENSMUST00000016023 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
VdrP48281 Dkk2-201ENSMUST00000029665 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
VdrP48281 Lztr1-202ENSMUST00000115681 3394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
VdrP48281 Col9a1-201ENSMUST00000054588 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
VdrP48281 Hipk2-204ENSMUST00000160360 3907 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
VdrP48281 Gm37613-201ENSMUST00000195677 3580 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
VdrP48281 Gm17980-201ENSMUST00000217977 2349 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
VdrP48281 Mthfd1l-203ENSMUST00000120585 3687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
VdrP48281 Rufy2-202ENSMUST00000119567 4130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
VdrP48281 Gm40617-201ENSMUST00000218840 2420 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
VdrP48281 Fam83a-202ENSMUST00000160942 2876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
VdrP48281 Cep350-204ENSMUST00000138762 13307 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
VdrP48281 Slc37a4-201ENSMUST00000165839 2086 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
VdrP48281 Acsf2-201ENSMUST00000103164 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
VdrP48281 Ly75-201ENSMUST00000028362 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
VdrP48281 Ralgps1-202ENSMUST00000091039 2738 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
VdrP48281 C330007P06Rik-203ENSMUST00000115249 1145 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
VdrP48281 Gm14201-201ENSMUST00000117627 289 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
VdrP48281 Rap1a-ps2-201ENSMUST00000118467 559 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
VdrP48281 Dctn6-203ENSMUST00000118811 934 ntTSL 3 BASIC11.36□□□□□ -0.59
VdrP48281 Gm12715-201ENSMUST00000121430 1128 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
VdrP48281 Gm17105-201ENSMUST00000163715 652 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
VdrP48281 Gm5616-201ENSMUST00000165252 384 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.3 ms