Protein–RNA interactions for Protein: P47758

Srprb, Signal recognition particle receptor subunit beta, mousemouse

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Length 269 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrprbP47758 Cttn-201ENSMUST00000033407 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
SrprbP47758 Cntnap1-201ENSMUST00000103109 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
SrprbP47758 Acrbp-204ENSMUST00000112413 672 ntTSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.37
SrprbP47758 Sgcg-202ENSMUST00000121148 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
SrprbP47758 Gm11952-201ENSMUST00000121172 821 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
SrprbP47758 Gm15856-201ENSMUST00000124853 1162 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
SrprbP47758 Gm22138-201ENSMUST00000158748 128 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
SrprbP47758 Tmem40-206ENSMUST00000170625 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.71□□□□□ -0.37
SrprbP47758 Gm20420-201ENSMUST00000173178 639 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
SrprbP47758 Gm6407-201ENSMUST00000176468 549 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
SrprbP47758 Gm5523-201ENSMUST00000180415 997 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
SrprbP47758 1700109G14Rik-202ENSMUST00000188538 754 ntTSL 3 BASIC12.71□□□□□ -0.37
SrprbP47758 Gm44158-201ENSMUST00000203881 505 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
SrprbP47758 Gm8285-201ENSMUST00000208293 759 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
SrprbP47758 Gm15802-202ENSMUST00000209595 1094 ntTSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
SrprbP47758 AC164618.2-201ENSMUST00000224770 573 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
SrprbP47758 Nmi-201ENSMUST00000028314 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
SrprbP47758 Tsga8-201ENSMUST00000049420 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
SrprbP47758 Srsf5-205ENSMUST00000110356 1568 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
SrprbP47758 Gm20427-201ENSMUST00000168978 3703 ntTSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.37
SrprbP47758 Gm18210-201ENSMUST00000209001 1524 ntBASIC12.71□□□□□ -0.38
SrprbP47758 AC130823.1-201ENSMUST00000228929 1549 ntBASIC12.71□□□□□ -0.38
SrprbP47758 Bet1-201ENSMUST00000049166 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
SrprbP47758 Smarca2-216ENSMUST00000176769 5703 ntTSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.38
SrprbP47758 Gm26672-201ENSMUST00000180922 2685 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
SrprbP47758 Jmjd4-202ENSMUST00000108777 4351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
SrprbP47758 Habp2-201ENSMUST00000078284 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.38
SrprbP47758 Cep112-213ENSMUST00000150863 3453 ntTSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.38
SrprbP47758 Dglucy-204ENSMUST00000110073 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.38
SrprbP47758 Cep128-210ENSMUST00000141429 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
SrprbP47758 Vipr2-201ENSMUST00000011315 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
SrprbP47758 Slc25a17-201ENSMUST00000023040 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
SrprbP47758 Trim16-202ENSMUST00000072639 1929 ntTSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
SrprbP47758 Gm16677-201ENSMUST00000181229 2174 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
SrprbP47758 Gm27174-201ENSMUST00000184493 2174 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
SrprbP47758 Myo18a-211ENSMUST00000130627 6202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
SrprbP47758 Gm4869-201ENSMUST00000197549 2955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
SrprbP47758 Crot-201ENSMUST00000003720 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
SrprbP47758 Pax5-205ENSMUST00000107827 1315 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
SrprbP47758 Syncrip-208ENSMUST00000174282 3404 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
SrprbP47758 Krt33b-201ENSMUST00000073890 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
SrprbP47758 Tmc5-203ENSMUST00000121715 3906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
SrprbP47758 Cblb-203ENSMUST00000226593 3864 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
SrprbP47758 Mki67-201ENSMUST00000033310 10061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
SrprbP47758 Gpatch2l-204ENSMUST00000221368 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
SrprbP47758 Gm26013-201ENSMUST00000104404 119 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
SrprbP47758 Gm11451-201ENSMUST00000118946 630 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
SrprbP47758 Mir1896-201ENSMUST00000122641 81 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
SrprbP47758 Gm24398-201ENSMUST00000157870 109 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
SrprbP47758 Gm18159-201ENSMUST00000174516 1070 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
SrprbP47758 Dusp3-207ENSMUST00000176261 496 ntTSL 3 BASIC12.7□□□□□ -0.38
SrprbP47758 Ly6c1-202ENSMUST00000179762 838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
SrprbP47758 Gm17597-201ENSMUST00000181220 1115 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
SrprbP47758 Gm17877-201ENSMUST00000192578 814 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
SrprbP47758 Gm38321-201ENSMUST00000195053 235 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
SrprbP47758 9530062K07Rik-201ENSMUST00000203332 787 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
SrprbP47758 Gm7972-202ENSMUST00000208453 505 ntTSL 3 BASIC12.7□□□□□ -0.38
SrprbP47758 AC159196.1-201ENSMUST00000225524 377 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
SrprbP47758 CT025618.1-203ENSMUST00000227008 589 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
SrprbP47758 Olfr284-201ENSMUST00000063289 918 ntAPPRIS P1 BASIC12.7□□□□□ -0.38
SrprbP47758 Bicra-204ENSMUST00000210781 5975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
SrprbP47758 Satb1-204ENSMUST00000133574 3461 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
SrprbP47758 Stk32b-201ENSMUST00000094836 3458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
SrprbP47758 BC052040-201ENSMUST00000110918 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
SrprbP47758 Elavl2-204ENSMUST00000107110 3671 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
SrprbP47758 Tube1-201ENSMUST00000019991 2929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
SrprbP47758 Igsf1-204ENSMUST00000114893 2671 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
SrprbP47758 Fn1-216ENSMUST00000189821 7410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
SrprbP47758 Zfp606-202ENSMUST00000123589 3509 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
SrprbP47758 March1-207ENSMUST00000110258 2581 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
SrprbP47758 Dennd4a-201ENSMUST00000038890 8645 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
SrprbP47758 Galm-201ENSMUST00000039205 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
SrprbP47758 Tbc1d14-210ENSMUST00000140607 4649 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
SrprbP47758 Ncdn-201ENSMUST00000030637 3681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
SrprbP47758 Dcst2-201ENSMUST00000208216 2285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
SrprbP47758 Frmd4a-202ENSMUST00000091497 6208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
SrprbP47758 Speg-201ENSMUST00000087122 10801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
SrprbP47758 Abi1-203ENSMUST00000093171 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
SrprbP47758 Kcnd1-201ENSMUST00000009875 5287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
SrprbP47758 Gtf2i-202ENSMUST00000082057 4375 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
SrprbP47758 Xlr4c-201ENSMUST00000068551 1500 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
SrprbP47758 Stk4-201ENSMUST00000018353 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
SrprbP47758 Asz1-201ENSMUST00000010940 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
SrprbP47758 Ceacam1-205ENSMUST00000206171 1722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
SrprbP47758 Robo4-201ENSMUST00000102895 3226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
SrprbP47758 9130227L01Rik-202ENSMUST00000189293 1906 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
SrprbP47758 Gdf2-201ENSMUST00000100720 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
SrprbP47758 Tnip1-203ENSMUST00000102731 2973 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
SrprbP47758 Il1rn-202ENSMUST00000114485 728 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
SrprbP47758 Snord23-201ENSMUST00000116828 109 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
SrprbP47758 4930571N24Rik-202ENSMUST00000142914 598 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
SrprbP47758 Gm17115-201ENSMUST00000164075 885 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
SrprbP47758 Gm19013-201ENSMUST00000183895 1222 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
SrprbP47758 Gm19014-201ENSMUST00000184828 1189 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
SrprbP47758 Prr30-202ENSMUST00000187304 2104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
SrprbP47758 Gm42816-201ENSMUST00000198433 325 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
SrprbP47758 Polr1d-204ENSMUST00000200993 1167 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
SrprbP47758 4933402C05Rik-201ENSMUST00000208189 1035 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
SrprbP47758 Gm44753-202ENSMUST00000208297 562 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
SrprbP47758 Gm18042-201ENSMUST00000219887 790 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
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