Protein–RNA interactions for Protein: P31313

Hoxc11, Homeobox protein Hox-C11, mousemouse

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Length 304 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc11P31313 Fam228a-201ENSMUST00000111154 3004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Hoxc11P31313 Gtf2h5-202ENSMUST00000100955 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Hoxc11P31313 Gm25053-201ENSMUST00000103982 133 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Hoxc11P31313 Gm25922-201ENSMUST00000104281 130 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Hoxc11P31313 Ifna2-201ENSMUST00000105147 1032 ntAPPRIS P1 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Hoxc11P31313 Ywhaq-ps2-201ENSMUST00000117738 643 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Hoxc11P31313 Gm24679-201ENSMUST00000158762 111 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Hoxc11P31313 Gm17116-201ENSMUST00000169175 1013 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Hoxc11P31313 Taar8c-201ENSMUST00000170267 1035 ntAPPRIS P1 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Hoxc11P31313 Gm29187-201ENSMUST00000186681 689 ntTSL 3 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Hoxc11P31313 D5Ertd615e-203ENSMUST00000198493 1032 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Hoxc11P31313 Gm25053-202ENSMUST00000199731 132 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Hoxc11P31313 Gm29797-201ENSMUST00000207856 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Hoxc11P31313 Gm45592-201ENSMUST00000209605 1043 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Hoxc11P31313 Pbld1-206ENSMUST00000219687 788 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Hoxc11P31313 AC153152.3-201ENSMUST00000222188 1135 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Hoxc11P31313 Crygb-201ENSMUST00000027090 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Hoxc11P31313 Taar8a-201ENSMUST00000051133 1035 ntAPPRIS P1 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Hoxc11P31313 3100002H09Rik-201ENSMUST00000053604 873 ntAPPRIS P1 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Hoxc11P31313 Gm4744-201ENSMUST00000073642 792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Hoxc11P31313 Vmn1r222-201ENSMUST00000077116 1054 ntAPPRIS P1 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Hoxc11P31313 D830039M14Rik-202ENSMUST00000217740 3362 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Hoxc11P31313 Gm8320-201ENSMUST00000177584 1762 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Hoxc11P31313 Gm8303-201ENSMUST00000178371 1762 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Hoxc11P31313 Gm8331-201ENSMUST00000178433 1762 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Hoxc11P31313 Epn3-202ENSMUST00000127305 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Hoxc11P31313 Arhgap20-204ENSMUST00000130405 3881 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Hoxc11P31313 Gm20498-203ENSMUST00000166664 2284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Hoxc11P31313 4931428F04Rik-202ENSMUST00000171788 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Hoxc11P31313 Lingo1-201ENSMUST00000053568 3295 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Hoxc11P31313 Fmod-201ENSMUST00000048183 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Hoxc11P31313 Ddx56-201ENSMUST00000004507 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Hoxc11P31313 Unc45a-202ENSMUST00000107368 3635 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Hoxc11P31313 Sik2-205ENSMUST00000176663 4107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Hoxc11P31313 Slc38a3-203ENSMUST00000177567 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Hoxc11P31313 Slc38a3-209ENSMUST00000193932 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Hoxc11P31313 Ldb3-202ENSMUST00000022328 2468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Hoxc11P31313 Ddx11-205ENSMUST00000224497 4141 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Hoxc11P31313 Rims2-202ENSMUST00000082054 4800 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Hoxc11P31313 Mpv17l-204ENSMUST00000141971 2155 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Hoxc11P31313 Prpf19-203ENSMUST00000179297 6035 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Hoxc11P31313 Ppp1r12a-205ENSMUST00000219263 3355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Hoxc11P31313 1700030K09Rik-202ENSMUST00000121902 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Hoxc11P31313 Palb2-204ENSMUST00000106469 2559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Hoxc11P31313 Slc5a8-201ENSMUST00000020255 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Hoxc11P31313 Pex13-201ENSMUST00000020523 4146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Hoxc11P31313 Capzb-201ENSMUST00000030518 1390 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Hoxc11P31313 Htr1d-203ENSMUST00000121571 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Hoxc11P31313 Ipo4-201ENSMUST00000047131 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Hoxc11P31313 Nrap-203ENSMUST00000095947 5214 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Hoxc11P31313 March7-202ENSMUST00000102747 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Hoxc11P31313 Dcst2-201ENSMUST00000208216 2285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Hoxc11P31313 Capn15-201ENSMUST00000041641 3520 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Hoxc11P31313 Mms19-201ENSMUST00000026168 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Hoxc11P31313 Anxa6-201ENSMUST00000102727 2471 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Hoxc11P31313 Zfp354b-201ENSMUST00000109124 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Hoxc11P31313 Chmp1b-202ENSMUST00000210564 2490 ntAPPRIS P1 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Hoxc11P31313 Tfap2b-204ENSMUST00000187754 3023 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Hoxc11P31313 Arih1-202ENSMUST00000165322 1431 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Hoxc11P31313 Oprm1-203ENSMUST00000056385 1440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Hoxc11P31313 AC122881.1-201ENSMUST00000225757 2695 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Hoxc11P31313 Gm19165-201ENSMUST00000204453 1982 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Hoxc11P31313 Sec14l1-202ENSMUST00000090433 4654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Hoxc11P31313 Atp4a-204ENSMUST00000170371 3447 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Hoxc11P31313 Chrne-201ENSMUST00000014753 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Hoxc11P31313 Trav13d-1-201ENSMUST00000103588 396 ntAPPRIS P1 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Hoxc11P31313 Gm8111-201ENSMUST00000117659 987 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Hoxc11P31313 Gm12194-201ENSMUST00000117756 1012 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Hoxc11P31313 Gm12990-201ENSMUST00000120372 468 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Hoxc11P31313 AC158605.1-201ENSMUST00000156803 764 ntTSL 3 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Hoxc11P31313 Gm22379-201ENSMUST00000157480 131 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Hoxc11P31313 Gm16553-201ENSMUST00000160490 716 ntTSL 3 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Hoxc11P31313 Higd1c-202ENSMUST00000177211 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Hoxc11P31313 Gm21844-201ENSMUST00000178699 663 ntTSL 3 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Hoxc11P31313 Gm29067-201ENSMUST00000190821 470 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Hoxc11P31313 4931419H13Rik-201ENSMUST00000199770 973 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Hoxc11P31313 Gm2762-206ENSMUST00000202502 335 ntTSL 3 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Hoxc11P31313 Gm2762-208ENSMUST00000202976 568 ntTSL 3 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Hoxc11P31313 Mt1-202ENSMUST00000211807 1085 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Hoxc11P31313 Tas2r125-201ENSMUST00000076119 937 ntAPPRIS P1 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Hoxc11P31313 Snrpg-201ENSMUST00000089558 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Hoxc11P31313 Iqsec3-203ENSMUST00000151397 8067 ntTSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Hoxc11P31313 Cald1-205ENSMUST00000115027 4777 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Hoxc11P31313 Npepps-201ENSMUST00000001480 4215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Hoxc11P31313 Rims2-204ENSMUST00000226410 3685 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Hoxc11P31313 AC165351.1-201ENSMUST00000219078 2020 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Hoxc11P31313 Sdccag8-201ENSMUST00000027785 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Hoxc11P31313 Acsf2-201ENSMUST00000103164 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Hoxc11P31313 Dna2-203ENSMUST00000131422 4122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Hoxc11P31313 Usp11-201ENSMUST00000033383 3467 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Hoxc11P31313 1700017B05Rik-202ENSMUST00000213199 3722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Hoxc11P31313 Cdk5rap1-201ENSMUST00000028990 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Hoxc11P31313 Adar-204ENSMUST00000118341 2399 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Hoxc11P31313 4931406C07Rik-201ENSMUST00000034414 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Hoxc11P31313 Tlr12-201ENSMUST00000074829 3177 ntAPPRIS P1 BASIC10.77□□□□□ -0.68
Hoxc11P31313 Trp53inp2-201ENSMUST00000043237 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Hoxc11P31313 Pax6-225ENSMUST00000167211 2814 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.68
Hoxc11P31313 Gm20755-201ENSMUST00000196893 1827 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Hoxc11P31313 CT010447.1-201ENSMUST00000225657 1608 ntBASIC10.77□□□□□ -0.68
Hoxc11P31313 Knop1-202ENSMUST00000063607 4884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
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