Protein–RNA interactions for Protein: P31041

Cd28, T-cell-specific surface glycoprotein CD28, mousemouse

Predictions only

Length 218 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd28P31041 Col6a5-203ENSMUST00000190193 9289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.69□□□□□ -0.86
Cd28P31041 Git2-203ENSMUST00000112183 4886 ntTSL 5 BASIC9.69□□□□□ -0.86
Cd28P31041 Clasp1-208ENSMUST00000187713 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.69□□□□□ -0.86
Cd28P31041 Gm23061-201ENSMUST00000102348 116 ntBASIC9.69□□□□□ -0.86
Cd28P31041 Gsg1-202ENSMUST00000111909 1087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.69□□□□□ -0.86
Cd28P31041 Dnajc25-204ENSMUST00000152199 1141 ntTSL 5 BASIC9.69□□□□□ -0.86
Cd28P31041 Crem-233ENSMUST00000154135 2530 ntTSL 5 BASIC9.69□□□□□ -0.86
Cd28P31041 Rps19-ps9-201ENSMUST00000161787 414 ntBASIC9.69□□□□□ -0.86
Cd28P31041 Gm17105-201ENSMUST00000163715 652 ntTSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Cd28P31041 Eif4ebp2-202ENSMUST00000167087 1422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.69□□□□□ -0.86
Cd28P31041 Creb3-206ENSMUST00000167751 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.69□□□□□ -0.86
Cd28P31041 Ctdspl-202ENSMUST00000172464 798 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.69□□□□□ -0.86
Cd28P31041 Gm21859-201ENSMUST00000178424 1045 ntTSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Cd28P31041 Gm37301-201ENSMUST00000195412 568 ntBASIC9.69□□□□□ -0.86
Cd28P31041 4921513H07Rik-201ENSMUST00000201403 2238 ntBASIC9.69□□□□□ -0.86
Cd28P31041 Gm21221-201ENSMUST00000202876 1073 ntTSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Cd28P31041 Cmtm2a-203ENSMUST00000212492 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC9.69□□□□□ -0.86
Cd28P31041 8030455M16Rik-201ENSMUST00000213014 902 ntTSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Cd28P31041 AC160052.1-201ENSMUST00000213173 1248 ntTSL 5 BASIC9.69□□□□□ -0.86
Cd28P31041 Olfr368-202ENSMUST00000217299 1200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.69□□□□□ -0.86
Cd28P31041 AC122371.3-201ENSMUST00000223402 1061 ntBASIC9.69□□□□□ -0.86
Cd28P31041 CT010480.4-201ENSMUST00000224654 2283 ntBASIC9.69□□□□□ -0.86
Cd28P31041 Snai2-201ENSMUST00000023356 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Cd28P31041 Defb22-201ENSMUST00000028966 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Cd28P31041 D630029K05Rik-201ENSMUST00000033651 2133 ntTSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Cd28P31041 Crygs-201ENSMUST00000040592 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Cd28P31041 Fam90a1b-201ENSMUST00000044989 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Cd28P31041 Ticam1-201ENSMUST00000058136 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Cd28P31041 Rps15-202ENSMUST00000068408 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Cd28P31041 Cfi-201ENSMUST00000077918 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Cd28P31041 Slco5a1-202ENSMUST00000115403 8509 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.69□□□□□ -0.86
Cd28P31041 Ehmt1-202ENSMUST00000091348 4615 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.69□□□□□ -0.86
Cd28P31041 Asxl2-207ENSMUST00000153102 4462 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.69□□□□□ -0.86
Cd28P31041 Kcng4-201ENSMUST00000061828 3806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Cd28P31041 Cfap43-202ENSMUST00000095998 3764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Cd28P31041 Lig3-210ENSMUST00000173347 3631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Cd28P31041 Cd2bp2-202ENSMUST00000166791 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Cd28P31041 Lct-201ENSMUST00000073490 6174 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.69□□□□□ -0.86
Cd28P31041 Mapre2-203ENSMUST00000118826 3052 ntTSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Cd28P31041 Cap1-201ENSMUST00000069533 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Cd28P31041 Ankrd46-201ENSMUST00000057486 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
Cd28P31041 Polr3b-201ENSMUST00000077175 4975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
Cd28P31041 Grip1-216ENSMUST00000154238 2482 ntTSL 5 BASIC9.68□□□□□ -0.86
Cd28P31041 Vmn2r18-201ENSMUST00000165928 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.68□□□□□ -0.86
Cd28P31041 Srpx2-201ENSMUST00000033606 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
Cd28P31041 Lrrc8a-201ENSMUST00000095078 4301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.68□□□□□ -0.86
Cd28P31041 Optc-201ENSMUST00000124051 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
Cd28P31041 Trim17-201ENSMUST00000047697 3664 ntTSL 2 BASIC9.68□□□□□ -0.86
Cd28P31041 Gabrr2-201ENSMUST00000024035 1820 ntTSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
Cd28P31041 Ttll9-201ENSMUST00000099197 1797 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
Cd28P31041 Nktr-201ENSMUST00000035112 7022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
Cd28P31041 Gm44153-201ENSMUST00000204162 1580 ntBASIC9.68□□□□□ -0.86
Cd28P31041 Tcf4-203ENSMUST00000114977 3070 ntTSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
Cd28P31041 Spen-202ENSMUST00000105786 12299 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.68□□□□□ -0.86
Cd28P31041 Mapk8-204ENSMUST00000111944 1528 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
Cd28P31041 Gm12915-201ENSMUST00000131381 1499 ntTSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
Cd28P31041 Gm43972-201ENSMUST00000181398 1467 ntBASIC9.68□□□□□ -0.86
Cd28P31041 Trpm2-203ENSMUST00000105401 7274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
Cd28P31041 Ppp4r1l-ps-202ENSMUST00000132669 2767 ntBASIC9.68□□□□□ -0.86
Cd28P31041 Cdc23-203ENSMUST00000133181 4133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
Cd28P31041 Txndc12-201ENSMUST00000030296 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
Cd28P31041 Dcaf11-206ENSMUST00000128490 2660 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC9.68□□□□□ -0.86
Cd28P31041 Lin37-202ENSMUST00000108164 1312 ntTSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
Cd28P31041 Tsta3-201ENSMUST00000023231 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
Cd28P31041 Fam234a-202ENSMUST00000118487 2629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
Cd28P31041 Gm11941-201ENSMUST00000119904 610 ntBASIC9.68□□□□□ -0.86
Cd28P31041 1700016P03Rik-201ENSMUST00000134252 863 ntTSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
Cd28P31041 1700007P06Rik-201ENSMUST00000160380 823 ntTSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
Cd28P31041 Gm17420-201ENSMUST00000164753 153 ntBASIC9.68□□□□□ -0.86
Cd28P31041 Erh-202ENSMUST00000166931 506 ntTSL 2 BASIC9.68□□□□□ -0.86
Cd28P31041 Gm27441-201ENSMUST00000185000 105 ntBASIC9.68□□□□□ -0.86
Cd28P31041 Abhd14b-202ENSMUST00000185347 1200 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.68□□□□□ -0.86
Cd28P31041 8030442B05Rik-201ENSMUST00000192626 1035 ntTSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
Cd28P31041 Vdac1-201ENSMUST00000020673 891 ntTSL 5 BASIC9.68□□□□□ -0.86
Cd28P31041 Gm45575-201ENSMUST00000210283 548 ntBASIC9.68□□□□□ -0.86
Cd28P31041 Gm40639-201ENSMUST00000214642 625 ntTSL 5 BASIC9.68□□□□□ -0.86
Cd28P31041 AC166349.1-201ENSMUST00000220866 695 ntBASIC9.68□□□□□ -0.86
Cd28P31041 Zfp706-203ENSMUST00000226453 517 ntAPPRIS P1 BASIC9.68□□□□□ -0.86
Cd28P31041 Pemt-201ENSMUST00000000310 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.68□□□□□ -0.86
Cd28P31041 Ndufaf5-201ENSMUST00000044825 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
Cd28P31041 Olfr707-201ENSMUST00000088687 924 ntAPPRIS P1 BASIC9.68□□□□□ -0.86
Cd28P31041 Olfr1532-ps1-201ENSMUST00000098140 924 ntAPPRIS P1 BASIC9.68□□□□□ -0.86
Cd28P31041 Hist1h2be-201ENSMUST00000051091 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
Cd28P31041 Oxsm-201ENSMUST00000022311 3759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
Cd28P31041 Prss43-201ENSMUST00000077549 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
Cd28P31041 Satb1-204ENSMUST00000133574 3461 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
Cd28P31041 Khdrbs2-204ENSMUST00000188257 5278 ntTSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
Cd28P31041 Smchd1-201ENSMUST00000127430 7052 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.68□□□□□ -0.86
Cd28P31041 Tfap2b-204ENSMUST00000187754 3023 ntTSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
Cd28P31041 Prdm16-205ENSMUST00000105637 8595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
Cd28P31041 Prdm16-201ENSMUST00000030902 8598 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
Cd28P31041 Ikbkg-204ENSMUST00000114128 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.68□□□□□ -0.86
Cd28P31041 Zc3h18-202ENSMUST00000093073 3705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
Cd28P31041 Lrrc49-204ENSMUST00000114034 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
Cd28P31041 5730455P16Rik-204ENSMUST00000179332 4536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.68□□□□□ -0.86
Cd28P31041 Col15a1-203ENSMUST00000107730 1755 ntTSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
Cd28P31041 Ifi211-201ENSMUST00000009340 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
Cd28P31041 AC122367.1-201ENSMUST00000221978 1709 ntBASIC9.68□□□□□ -0.86
Cd28P31041 Ankrd11-202ENSMUST00000098334 8455 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.67□□□□□ -0.86
Cd28P31041 Pard3-201ENSMUST00000026921 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
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