Protein–RNA interactions for Protein: P28663

Napb, Beta-soluble NSF attachment protein, mousemouse

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Length 298 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NapbP28663 Gm26686-201ENSMUST00000181951 3467 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
NapbP28663 C030037D09Rik-203ENSMUST00000138007 3220 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
NapbP28663 AC122273.1-201ENSMUST00000213634 2327 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
NapbP28663 Adgre5-208ENSMUST00000166939 2980 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
NapbP28663 Slc12a8-203ENSMUST00000119173 2382 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
NapbP28663 Colec11-201ENSMUST00000036136 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
NapbP28663 Prrc2b-202ENSMUST00000069817 10671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
NapbP28663 Ncf1-202ENSMUST00000111275 2721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
NapbP28663 Mab21l2-201ENSMUST00000077524 2703 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
NapbP28663 Elovl7-201ENSMUST00000022207 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
NapbP28663 Tceanc-202ENSMUST00000112188 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
NapbP28663 Tsku-201ENSMUST00000094161 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
NapbP28663 Slc6a5-202ENSMUST00000107605 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
NapbP28663 AC090962.2-201ENSMUST00000225064 1801 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
NapbP28663 Rfesd-201ENSMUST00000050997 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
NapbP28663 Gm20758-201ENSMUST00000220339 2171 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
NapbP28663 Tfdp2-204ENSMUST00000179065 2213 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
NapbP28663 Ccnt2-201ENSMUST00000027587 6738 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
NapbP28663 Furin-202ENSMUST00000120753 4332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
NapbP28663 Syt11-203ENSMUST00000107505 5020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
NapbP28663 D930020B18Rik-201ENSMUST00000120642 3335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
NapbP28663 Slc45a3-201ENSMUST00000027695 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
NapbP28663 Dopey2-207ENSMUST00000227156 7340 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
NapbP28663 Gm5766-201ENSMUST00000160520 1977 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
NapbP28663 Gm12179-201ENSMUST00000118344 1272 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
NapbP28663 Anxa8-202ENSMUST00000120077 1208 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
NapbP28663 Kcnmb4os1-201ENSMUST00000134586 824 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
NapbP28663 4631405J19Rik-204ENSMUST00000145926 936 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
NapbP28663 Zfp667-204ENSMUST00000153840 596 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
NapbP28663 A230006K03Rik-202ENSMUST00000154958 901 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
NapbP28663 Gm15996-201ENSMUST00000161925 762 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
NapbP28663 Anp32e-206ENSMUST00000169426 915 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
NapbP28663 Tlx1-202ENSMUST00000174617 806 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
NapbP28663 Dusp3-207ENSMUST00000176261 496 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
NapbP28663 Gm19927-201ENSMUST00000185792 781 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
NapbP28663 Gm42660-201ENSMUST00000197733 947 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
NapbP28663 Gm43401-201ENSMUST00000198829 394 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
NapbP28663 Gm43001-201ENSMUST00000198925 603 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
NapbP28663 Pet100-203ENSMUST00000207389 363 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
NapbP28663 Gm3028-201ENSMUST00000213805 1119 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
NapbP28663 Gm18514-201ENSMUST00000218980 436 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
NapbP28663 Gm36074-201ENSMUST00000221383 591 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
NapbP28663 Ap3s1-202ENSMUST00000224622 978 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
NapbP28663 Cmtm2a-201ENSMUST00000034344 1081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
NapbP28663 Olfr76-201ENSMUST00000087822 1048 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
NapbP28663 Smtn-203ENSMUST00000075118 3117 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
NapbP28663 Cblb-203ENSMUST00000226593 3864 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
NapbP28663 Nrros-202ENSMUST00000115163 3559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
NapbP28663 Fam110b-201ENSMUST00000054857 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
NapbP28663 Acvrl1-201ENSMUST00000000542 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
NapbP28663 Gm29050-201ENSMUST00000190732 2528 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
NapbP28663 Qsox1-201ENSMUST00000035325 3348 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
NapbP28663 Inpp4a-211ENSMUST00000168546 2964 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
NapbP28663 Epb41l1-201ENSMUST00000029155 6220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
NapbP28663 Gm10728-201ENSMUST00000194292 1829 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
NapbP28663 Carns1-201ENSMUST00000167055 3968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
NapbP28663 Thoc6-202ENSMUST00000095579 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
NapbP28663 Abcc10-202ENSMUST00000095261 5266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
NapbP28663 Slc38a4-202ENSMUST00000166223 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
NapbP28663 Celf3-213ENSMUST00000199775 2351 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
NapbP28663 Sec22b-201ENSMUST00000029476 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
NapbP28663 Gm43963-201ENSMUST00000203466 2488 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
NapbP28663 Gon4l-203ENSMUST00000107498 7537 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
NapbP28663 Bub3-203ENSMUST00000207442 3414 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
NapbP28663 Gm16083-201ENSMUST00000125681 2547 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
NapbP28663 Rnf220-201ENSMUST00000030439 3029 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
NapbP28663 Ttc14-201ENSMUST00000099153 9661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
NapbP28663 Prkcd-201ENSMUST00000022521 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
NapbP28663 Nanog-201ENSMUST00000012540 2211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
NapbP28663 Ubtf-202ENSMUST00000079589 3286 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
NapbP28663 Scp2-202ENSMUST00000106701 772 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
NapbP28663 Srd5a3-202ENSMUST00000113506 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
NapbP28663 Gm12389-201ENSMUST00000117696 418 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
NapbP28663 Gm6322-201ENSMUST00000118789 1004 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
NapbP28663 Gm14497-201ENSMUST00000119537 580 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
NapbP28663 Hyal1-203ENSMUST00000123005 843 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
NapbP28663 Utp23-202ENSMUST00000136129 779 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
NapbP28663 Gm26555-201ENSMUST00000180452 1037 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
NapbP28663 Abhd14a-204ENSMUST00000185334 1109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
NapbP28663 Gm18776-201ENSMUST00000188833 654 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
NapbP28663 Gm45460-201ENSMUST00000211385 1038 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
NapbP28663 AC154435.1-201ENSMUST00000223938 959 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
NapbP28663 Lsm8-201ENSMUST00000056398 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
NapbP28663 Catsperz-201ENSMUST00000057716 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
NapbP28663 Ctxn2-201ENSMUST00000099452 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
NapbP28663 Ttll10-202ENSMUST00000051509 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
NapbP28663 Cwc25-202ENSMUST00000107579 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
NapbP28663 Nsd3-210ENSMUST00000153597 1865 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
NapbP28663 Pdcd10-205ENSMUST00000161137 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
NapbP28663 Dis3l-201ENSMUST00000068367 3605 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
NapbP28663 Tle6-210ENSMUST00000142948 1961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
NapbP28663 Ap5s1-201ENSMUST00000089506 1432 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
NapbP28663 Agrn-202ENSMUST00000105574 7193 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
NapbP28663 Anxa3-205ENSMUST00000198631 1523 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
NapbP28663 Atl2-202ENSMUST00000112437 3371 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
NapbP28663 Iqsec1-201ENSMUST00000101151 6490 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
NapbP28663 Dab2-203ENSMUST00000110663 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
NapbP28663 Zc3h12a-201ENSMUST00000036188 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
NapbP28663 Oprm1-208ENSMUST00000092734 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
NapbP28663 Ffar1-201ENSMUST00000052700 4175 ntAPPRIS P1 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.3 ms