Protein–RNA interactions for Protein: P23812

Hoxd12, Homeobox protein Hox-D12, mousemouse

Predictions only

Length 268 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd12P23812 2610318N02Rik-202ENSMUST00000207116 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Hoxd12P23812 AC164087.2-201ENSMUST00000216206 1072 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Hoxd12P23812 Nkain2-205ENSMUST00000219125 1166 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Hoxd12P23812 Rhno1-207ENSMUST00000223237 1081 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Hoxd12P23812 Ngp-201ENSMUST00000035061 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Hoxd12P23812 4930553M12Rik-201ENSMUST00000057837 498 ntAPPRIS P1 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Hoxd12P23812 Tex33-201ENSMUST00000074380 1147 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Hoxd12P23812 Prl7b1-201ENSMUST00000080595 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Hoxd12P23812 Nr1i3-201ENSMUST00000005820 1414 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Hoxd12P23812 Ptpn2-202ENSMUST00000120934 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Hoxd12P23812 AC159810.1-201ENSMUST00000214838 1480 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Hoxd12P23812 Tfr2-208ENSMUST00000199054 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Hoxd12P23812 Dnajc16-201ENSMUST00000038014 5969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Hoxd12P23812 Gm15984-202ENSMUST00000156466 1534 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Hoxd12P23812 Gm34425-201ENSMUST00000216269 3079 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Hoxd12P23812 Prdx2-202ENSMUST00000109733 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Hoxd12P23812 4930555A03Rik-201ENSMUST00000196052 1556 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Hoxd12P23812 Mirt1-202ENSMUST00000180667 1633 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Hoxd12P23812 Specc1-213ENSMUST00000202179 6676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Hoxd12P23812 Krba1-202ENSMUST00000077093 8380 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Hoxd12P23812 Kcnv2-201ENSMUST00000056708 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Hoxd12P23812 Dpep2-206ENSMUST00000227363 1844 ntAPPRIS P1 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Hoxd12P23812 Leprot-201ENSMUST00000030254 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Hoxd12P23812 Zrsr2-201ENSMUST00000090840 3867 ntTSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Hoxd12P23812 Ubl5-201ENSMUST00000129414 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Hoxd12P23812 Pfn4-204ENSMUST00000219503 4775 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Hoxd12P23812 Slc35a4-201ENSMUST00000036158 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Hoxd12P23812 Wdr25-202ENSMUST00000167816 2657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Hoxd12P23812 Csde1-207ENSMUST00000197827 2671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Hoxd12P23812 Kcnt1-212ENSMUST00000197917 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Hoxd12P23812 Acad9-201ENSMUST00000011492 3930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Hoxd12P23812 Paip2b-201ENSMUST00000058383 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Hoxd12P23812 Grm1-202ENSMUST00000105560 4265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Hoxd12P23812 Fads1-201ENSMUST00000010807 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Hoxd12P23812 Acsl6-208ENSMUST00000108899 1662 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Hoxd12P23812 Fhl1-204ENSMUST00000114772 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Hoxd12P23812 Cdk1-202ENSMUST00000119827 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Hoxd12P23812 Gm16305-201ENSMUST00000140747 556 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Hoxd12P23812 Hoxd3os1-203ENSMUST00000145799 511 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Hoxd12P23812 Tpi1-203ENSMUST00000149610 802 ntTSL 2 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Hoxd12P23812 Gm27316-201ENSMUST00000184884 277 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
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Hoxd12P23812 Myo1h-206ENSMUST00000196467 1208 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
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Hoxd12P23812 Lsm3-205ENSMUST00000206947 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
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Hoxd12P23812 Gm31718-201ENSMUST00000212406 1646 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
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Hoxd12P23812 Slc10a1-202ENSMUST00000218162 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Hoxd12P23812 Zfp410-215ENSMUST00000222832 1859 ntTSL 2 BASIC11.22□□□□□ -0.61
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Hoxd12P23812 Fdxacb1-201ENSMUST00000042391 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Hoxd12P23812 Cer1-201ENSMUST00000048430 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Hoxd12P23812 Trh-201ENSMUST00000006046 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Hoxd12P23812 Cyb561d1-201ENSMUST00000065664 4058 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Hoxd12P23812 Lysmd1-201ENSMUST00000066386 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
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Hoxd12P23812 Nol4l-202ENSMUST00000109784 5610 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
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Hoxd12P23812 Cdnf-201ENSMUST00000036350 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
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Hoxd12P23812 Pde4b-203ENSMUST00000097950 2756 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Hoxd12P23812 Slc25a22-203ENSMUST00000106007 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Hoxd12P23812 Cryz-208ENSMUST00000192462 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Hoxd12P23812 Nicn1-201ENSMUST00000035227 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Hoxd12P23812 Myh2-203ENSMUST00000170159 6083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Hoxd12P23812 A630075F10Rik-201ENSMUST00000180895 1913 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Hoxd12P23812 Cyp4f40-201ENSMUST00000165061 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Hoxd12P23812 Gm37849-201ENSMUST00000194722 1881 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Hoxd12P23812 Ehbp1l1-202ENSMUST00000075606 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Hoxd12P23812 Arhgef2-207ENSMUST00000175903 3356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Hoxd12P23812 A730071L15Rik-201ENSMUST00000181545 1615 ntAPPRIS P1 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Hoxd12P23812 AC137950.2-202ENSMUST00000227150 1635 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Hoxd12P23812 Rnf225-201ENSMUST00000045870 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Hoxd12P23812 S1pr2-201ENSMUST00000054197 6394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Hoxd12P23812 Prom2-201ENSMUST00000028855 4796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Hoxd12P23812 Zfp512-208ENSMUST00000202244 3045 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Hoxd12P23812 Gm12992-201ENSMUST00000124738 4493 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Hoxd12P23812 Ticrr-201ENSMUST00000035977 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Hoxd12P23812 Mindy1-202ENSMUST00000107187 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Hoxd12P23812 4931406C07Rik-203ENSMUST00000180339 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Hoxd12P23812 Gm5822-201ENSMUST00000161562 1378 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Hoxd12P23812 Ttc30b-201ENSMUST00000099996 2737 ntAPPRIS P1 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Hoxd12P23812 Rabl2-202ENSMUST00000094056 1322 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Hoxd12P23812 Bmp3-201ENSMUST00000031278 6548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Hoxd12P23812 Trbv31-201ENSMUST00000103300 334 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Hoxd12P23812 Ighv1-74-201ENSMUST00000103543 348 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Hoxd12P23812 Gm23604-201ENSMUST00000104311 132 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Hoxd12P23812 Pex5l-203ENSMUST00000108221 1187 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Hoxd12P23812 2610203C22Rik-201ENSMUST00000115480 1246 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Hoxd12P23812 Olfr29-ps1-201ENSMUST00000117959 963 ntAPPRIS P1 BASIC11.21□□□□□ -0.61
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