Protein–RNA interactions for Protein: P17533

Defa-rs1, Alpha-defensin-related sequence 1, mousemouse

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Length 116 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa-rs1P17533 Amotl1-201ENSMUST00000013220 8957 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Defa-rs1P17533 Gpr161-201ENSMUST00000111450 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Defa-rs1P17533 Cdc7-203ENSMUST00000117196 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Defa-rs1P17533 Tmppe-201ENSMUST00000111820 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Defa-rs1P17533 Srp54b-202ENSMUST00000218879 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Defa-rs1P17533 Plekhg4-206ENSMUST00000214056 3654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Defa-rs1P17533 Lig1-201ENSMUST00000098814 3091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Defa-rs1P17533 Gdpd2-201ENSMUST00000019503 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Defa-rs1P17533 Ptbp1-216ENSMUST00000172282 3110 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Defa-rs1P17533 Cln8-201ENSMUST00000027554 6857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Defa-rs1P17533 Wfdc2-203ENSMUST00000109345 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Defa-rs1P17533 Gm15373-201ENSMUST00000121495 214 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Defa-rs1P17533 Ndufb5-202ENSMUST00000121778 574 ntTSL 3 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Defa-rs1P17533 Gemin7-205ENSMUST00000122127 652 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Defa-rs1P17533 Gm15200-201ENSMUST00000149950 410 ntTSL 2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Defa-rs1P17533 H2afy3-201ENSMUST00000151919 1112 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Defa-rs1P17533 Gm10631-201ENSMUST00000153288 494 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Defa-rs1P17533 Zfp419-201ENSMUST00000173446 916 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Defa-rs1P17533 Gm23647-201ENSMUST00000175042 109 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Defa-rs1P17533 Rn5s-201ENSMUST00000177555 119 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Defa-rs1P17533 n-R5s108-201ENSMUST00000177575 119 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Defa-rs1P17533 n-R5s121-201ENSMUST00000177589 119 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Defa-rs1P17533 n-R5s146-201ENSMUST00000177889 119 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Defa-rs1P17533 Gm22109-201ENSMUST00000177995 119 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Defa-rs1P17533 Gm22291-201ENSMUST00000178027 119 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Defa-rs1P17533 n-R5s141-201ENSMUST00000178066 119 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Defa-rs1P17533 Gm23284-201ENSMUST00000178069 119 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Defa-rs1P17533 n-R5s100-201ENSMUST00000178106 119 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Defa-rs1P17533 n-R5s111-201ENSMUST00000178203 119 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Defa-rs1P17533 n-R5s105-201ENSMUST00000178499 119 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Defa-rs1P17533 n-R5s149-201ENSMUST00000178520 119 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Defa-rs1P17533 n-R5s103-201ENSMUST00000178755 119 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Defa-rs1P17533 n-R5s123-201ENSMUST00000178804 119 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Defa-rs1P17533 n-R5s142-201ENSMUST00000178820 119 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Defa-rs1P17533 n-R5s144-201ENSMUST00000178859 119 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Defa-rs1P17533 n-R5s139-201ENSMUST00000178975 119 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Defa-rs1P17533 n-R5s134-201ENSMUST00000178983 119 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Defa-rs1P17533 n-R5s136-201ENSMUST00000179080 119 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Defa-rs1P17533 Gm25018-201ENSMUST00000179081 119 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Defa-rs1P17533 n-R5s104-201ENSMUST00000179107 119 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Defa-rs1P17533 n-R5s113-201ENSMUST00000179143 119 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Defa-rs1P17533 n-R5s133-201ENSMUST00000179275 119 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Defa-rs1P17533 n-R5s117-201ENSMUST00000179431 119 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Defa-rs1P17533 Gm25212-201ENSMUST00000179432 119 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Defa-rs1P17533 n-R5s138-201ENSMUST00000179476 119 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Defa-rs1P17533 n-R5s122-201ENSMUST00000179500 119 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Defa-rs1P17533 n-R5s143-201ENSMUST00000179542 119 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Defa-rs1P17533 n-R5s107-201ENSMUST00000179704 119 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Defa-rs1P17533 Gm26391-201ENSMUST00000179843 119 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Defa-rs1P17533 n-R5s110-201ENSMUST00000179995 119 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Defa-rs1P17533 n-R5s128-201ENSMUST00000180096 119 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Defa-rs1P17533 n-R5s124-201ENSMUST00000180334 119 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Defa-rs1P17533 Gm28096-201ENSMUST00000191391 824 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Defa-rs1P17533 Gm2566-201ENSMUST00000201267 431 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Defa-rs1P17533 Gm17825-201ENSMUST00000206836 794 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Defa-rs1P17533 Gm45462-201ENSMUST00000211267 792 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Defa-rs1P17533 AC134248.1-201ENSMUST00000216113 1176 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Defa-rs1P17533 Gm33016-201ENSMUST00000221224 677 ntTSL 3 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Defa-rs1P17533 CT009550.1-201ENSMUST00000225750 864 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Defa-rs1P17533 Cacna2d3-208ENSMUST00000225985 918 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Defa-rs1P17533 AC115304.2-201ENSMUST00000226399 332 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Defa-rs1P17533 Defb12-201ENSMUST00000062113 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Defa-rs1P17533 Gm10228-201ENSMUST00000089105 532 ntAPPRIS P1 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Defa-rs1P17533 Gm24089-201ENSMUST00000093696 109 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Defa-rs1P17533 Plekhb1-204ENSMUST00000107045 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Defa-rs1P17533 Gm1995-201ENSMUST00000220838 2602 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Defa-rs1P17533 Rcsd1-201ENSMUST00000040357 2622 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Defa-rs1P17533 Igfbp5-201ENSMUST00000027377 6006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Defa-rs1P17533 Enam-201ENSMUST00000031222 5483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Defa-rs1P17533 Akap12-201ENSMUST00000045730 6195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Defa-rs1P17533 Cacna1c-205ENSMUST00000112825 7577 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Defa-rs1P17533 Arhgef2-203ENSMUST00000170653 4238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Defa-rs1P17533 Calcoco1-201ENSMUST00000023818 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Defa-rs1P17533 Il21r-202ENSMUST00000206103 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Defa-rs1P17533 Gm13608-201ENSMUST00000121807 1406 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Defa-rs1P17533 Pcif1-201ENSMUST00000041643 5772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Defa-rs1P17533 4933406C10Rik-201ENSMUST00000180391 1451 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Defa-rs1P17533 Nxpe1-ps-201ENSMUST00000209981 1454 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Defa-rs1P17533 Tcf4-230ENSMUST00000201205 2270 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Defa-rs1P17533 Gm45199-201ENSMUST00000207640 1507 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Defa-rs1P17533 Itfg2-201ENSMUST00000001559 2320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Defa-rs1P17533 Epha5-202ENSMUST00000113398 4830 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Defa-rs1P17533 Oprm1-213ENSMUST00000105604 1616 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Defa-rs1P17533 Gm5053-201ENSMUST00000208361 1678 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Defa-rs1P17533 Adcyap1r1-203ENSMUST00000165786 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Defa-rs1P17533 Per1-202ENSMUST00000101004 3507 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Defa-rs1P17533 Arl8b-201ENSMUST00000032196 4443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Defa-rs1P17533 Gm37269-201ENSMUST00000193906 1891 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Defa-rs1P17533 Zfp597-201ENSMUST00000090522 5668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Defa-rs1P17533 Gm5936-201ENSMUST00000114116 2857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Defa-rs1P17533 Gm5640-201ENSMUST00000114119 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Defa-rs1P17533 Galr1-201ENSMUST00000065224 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Defa-rs1P17533 Trp53inp2-201ENSMUST00000043237 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Defa-rs1P17533 Ifnar2-201ENSMUST00000023693 3047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Defa-rs1P17533 Gm43045-201ENSMUST00000198725 2095 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Defa-rs1P17533 Lrtm2-204ENSMUST00000168793 3407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Defa-rs1P17533 Supt16-201ENSMUST00000046709 4673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Defa-rs1P17533 Zfp710-202ENSMUST00000164056 5871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Defa-rs1P17533 Rgma-201ENSMUST00000094312 3586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Defa-rs1P17533 Sass6-204ENSMUST00000197335 2458 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.2 ms