Protein–RNA interactions for Protein: P15314

Irf1, Interferon regulatory factor 1, mousemouse

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Length 329 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irf1P15314 Rwdd3-205ENSMUST00000106467 1158 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Irf1P15314 Gm826-202ENSMUST00000109475 803 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Irf1P15314 Fam129a-203ENSMUST00000111875 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Irf1P15314 Thegl-203ENSMUST00000118941 746 ntTSL 3 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Irf1P15314 Gm8261-201ENSMUST00000119275 1208 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Irf1P15314 Gm11667-201ENSMUST00000119828 486 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Irf1P15314 Gm11836-201ENSMUST00000121022 441 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Irf1P15314 Gm7150-201ENSMUST00000122032 981 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Irf1P15314 Dnmt3bos-201ENSMUST00000124988 718 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Irf1P15314 Psma1-203ENSMUST00000135570 960 ntTSL 3 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Irf1P15314 Gm11831-201ENSMUST00000141538 629 ntTSL 3 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Irf1P15314 Gm22094-201ENSMUST00000158976 117 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Irf1P15314 Gm7030-202ENSMUST00000172968 899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Irf1P15314 Vmn2r-ps66-201ENSMUST00000173203 1256 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Irf1P15314 Eloc-206ENSMUST00000186948 641 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Irf1P15314 Gm28694-201ENSMUST00000190681 722 ntTSL 3 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Irf1P15314 Gm37002-201ENSMUST00000194560 373 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Irf1P15314 Gm9645-201ENSMUST00000197131 792 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Irf1P15314 Gm42640-201ENSMUST00000199792 1195 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Irf1P15314 Gm6108-201ENSMUST00000208365 367 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Irf1P15314 Gm45398-201ENSMUST00000210561 165 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Irf1P15314 Ccdc153-202ENSMUST00000213891 792 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Irf1P15314 9530020I12Rik-203ENSMUST00000219371 819 ntTSL 3 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Irf1P15314 AC117797.1-201ENSMUST00000223977 695 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Irf1P15314 CT025525.2-201ENSMUST00000227743 423 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Irf1P15314 Gm9826-201ENSMUST00000029124 1299 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Irf1P15314 Polb-201ENSMUST00000033938 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Irf1P15314 Sparc-209ENSMUST00000216313 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Irf1P15314 Smchd1-201ENSMUST00000127430 7052 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Irf1P15314 BC004004-203ENSMUST00000149405 1402 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Irf1P15314 Ccdc15-204ENSMUST00000216042 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Irf1P15314 AC166836.1-201ENSMUST00000219933 1795 ntBASIC10.46□□□□□ -0.74
Irf1P15314 Cd300lf-201ENSMUST00000051264 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Irf1P15314 Tbrg1-201ENSMUST00000117654 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Irf1P15314 Tfdp2-204ENSMUST00000179065 2213 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Irf1P15314 Gm16083-201ENSMUST00000125681 2547 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Irf1P15314 C2-201ENSMUST00000025230 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Irf1P15314 Birc3-201ENSMUST00000013949 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Irf1P15314 Pars2-202ENSMUST00000106781 3046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Irf1P15314 Mical1-203ENSMUST00000119962 3565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Irf1P15314 Cdca2-207ENSMUST00000163100 3841 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Irf1P15314 Plpbp-205ENSMUST00000209856 3954 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Irf1P15314 Swap70-201ENSMUST00000033325 4027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Irf1P15314 C2cd5-201ENSMUST00000087485 4265 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Irf1P15314 Smc4-202ENSMUST00000107803 3983 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Irf1P15314 Yars-201ENSMUST00000106054 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Irf1P15314 Camkv-204ENSMUST00000194206 2827 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Irf1P15314 Mlc1-201ENSMUST00000042594 2783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Irf1P15314 AC093022.4-203ENSMUST00000228523 2657 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Irf1P15314 Reps1-201ENSMUST00000126390 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Irf1P15314 Enpp5-201ENSMUST00000024756 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Irf1P15314 Ino80c-204ENSMUST00000153360 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Irf1P15314 Ighg1-202ENSMUST00000194304 2482 ntAPPRIS P5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Irf1P15314 Fcer2a-201ENSMUST00000005678 2242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Irf1P15314 Slc29a1-213ENSMUST00000167692 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Irf1P15314 Bco1-203ENSMUST00000176860 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Irf1P15314 Lamp5-201ENSMUST00000057503 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Irf1P15314 5330417C22Rik-202ENSMUST00000106625 5836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Irf1P15314 F10-201ENSMUST00000033821 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Irf1P15314 Tbx10-201ENSMUST00000041871 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Irf1P15314 Apon-202ENSMUST00000218722 1747 ntAPPRIS P1 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Irf1P15314 Ccndbp1-203ENSMUST00000099489 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Irf1P15314 Slc26a2-202ENSMUST00000146409 7814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Irf1P15314 4930566F21Rik-201ENSMUST00000201177 1535 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Irf1P15314 Gm20658-201ENSMUST00000175871 1489 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Irf1P15314 Rbms2-201ENSMUST00000092033 1481 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Irf1P15314 Gm6655-201ENSMUST00000201932 1309 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Irf1P15314 Gm39204-201ENSMUST00000210045 1307 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Irf1P15314 Mical3-217ENSMUST00000207889 9204 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Irf1P15314 Cela3b-201ENSMUST00000102522 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Irf1P15314 Ssc4d-202ENSMUST00000111150 459 ntTSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Irf1P15314 Gm16149-201ENSMUST00000117631 309 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Irf1P15314 Gm11949-201ENSMUST00000117640 372 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Irf1P15314 Gm11700-201ENSMUST00000119409 403 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Irf1P15314 Gm12583-201ENSMUST00000120677 853 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Irf1P15314 Rps2-ps4-201ENSMUST00000121977 633 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Irf1P15314 Gm14965-201ENSMUST00000124118 565 ntTSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Irf1P15314 Gm13376-201ENSMUST00000128743 448 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Irf1P15314 Gm14199-201ENSMUST00000130021 495 ntTSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Irf1P15314 Gm13073-201ENSMUST00000134059 486 ntTSL 3 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Irf1P15314 Ctcflos-203ENSMUST00000144256 1237 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Irf1P15314 Gm3573-201ENSMUST00000168673 898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Irf1P15314 Gm10376-202ENSMUST00000169756 900 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Irf1P15314 Gm10320-201ENSMUST00000170205 527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Irf1P15314 Trub2-210ENSMUST00000177467 744 ntTSL 3 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Irf1P15314 Gm27241-202ENSMUST00000185013 570 ntTSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Irf1P15314 Gm9540-201ENSMUST00000188230 478 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Irf1P15314 Gm21301-201ENSMUST00000189476 699 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Irf1P15314 Gm7967-201ENSMUST00000190991 399 ntTSL 3 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Irf1P15314 Gm37707-201ENSMUST00000195309 325 ntTSL 3 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Irf1P15314 Gm18330-201ENSMUST00000199246 547 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Irf1P15314 Gm33201-201ENSMUST00000204791 855 ntTSL 3 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Irf1P15314 Gm44506-201ENSMUST00000206278 965 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Irf1P15314 Colca2-202ENSMUST00000215038 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Irf1P15314 Olfr44-203ENSMUST00000216316 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Irf1P15314 AC110816.1-201ENSMUST00000218559 980 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Irf1P15314 Gm18556-201ENSMUST00000219748 1031 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Irf1P15314 AC160105.1-201ENSMUST00000221931 682 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Irf1P15314 Olfr779-202ENSMUST00000222301 929 ntAPPRIS P5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Irf1P15314 AC132881.1-201ENSMUST00000223780 1062 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
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