Protein–RNA interactions for Protein: P06800

Ptprc, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase C, mousemouse

Predictions only

Length 1,291 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprcP06800 Dnali1-201ENSMUST00000036383 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
PtprcP06800 St6galnac5-201ENSMUST00000044278 5667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
PtprcP06800 Rnf144a-202ENSMUST00000062149 4812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
PtprcP06800 Gps2-202ENSMUST00000072581 1311 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
PtprcP06800 Taf1b-201ENSMUST00000075954 2209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
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PtprcP06800 Axl-202ENSMUST00000085948 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
PtprcP06800 Taar7b-201ENSMUST00000092658 1077 ntAPPRIS P1 BASIC12.24□□□□□ -0.45
PtprcP06800 Smco1-201ENSMUST00000093183 1408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
PtprcP06800 Bpifb4-201ENSMUST00000099181 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
PtprcP06800 Olfr1230-201ENSMUST00000099787 918 ntAPPRIS P1 BASIC12.24□□□□□ -0.45
PtprcP06800 Ank3-205ENSMUST00000092433 5072 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
PtprcP06800 Tspan2-201ENSMUST00000029451 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
PtprcP06800 Calm1-201ENSMUST00000001204 3987 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
PtprcP06800 Nexmif-203ENSMUST00000118314 11476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
PtprcP06800 Ntrk2-202ENSMUST00000109838 6846 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
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PtprcP06800 Slc4a9-202ENSMUST00000115694 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
PtprcP06800 Spred2-201ENSMUST00000093298 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
PtprcP06800 Nxph1-202ENSMUST00000160300 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
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PtprcP06800 Epha5-206ENSMUST00000113406 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
PtprcP06800 Pafah2-201ENSMUST00000105869 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
PtprcP06800 Shtn1-201ENSMUST00000047511 4081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
PtprcP06800 Uspl1-201ENSMUST00000050472 3757 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
PtprcP06800 Hkdc1-201ENSMUST00000020277 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
PtprcP06800 Egr2-201ENSMUST00000048289 2965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
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PtprcP06800 Gripap1-202ENSMUST00000101694 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
PtprcP06800 Stat5b-202ENSMUST00000107358 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
PtprcP06800 Mir671-201ENSMUST00000102432 98 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
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PtprcP06800 Gm11993-201ENSMUST00000121861 820 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
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PtprcP06800 Myl3-202ENSMUST00000124267 575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
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PtprcP06800 Mir99ahg-209ENSMUST00000182820 835 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
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PtprcP06800 Gm44511-202ENSMUST00000204423 678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
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PtprcP06800 Lrch1-201ENSMUST00000088970 4694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
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PtprcP06800 Slc40a1-201ENSMUST00000027137 3370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
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PtprcP06800 Ptgr2-207ENSMUST00000146377 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
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PtprcP06800 Tmem246-201ENSMUST00000042750 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
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PtprcP06800 A430057M04Rik-201ENSMUST00000169054 3835 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
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PtprcP06800 Paqr5-201ENSMUST00000034817 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
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PtprcP06800 Cops3-201ENSMUST00000019517 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
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PtprcP06800 Tmem151a-201ENSMUST00000077066 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
PtprcP06800 Pabpc1l-201ENSMUST00000067715 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
PtprcP06800 Cers6-201ENSMUST00000028426 7038 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
PtprcP06800 Fam189b-201ENSMUST00000041913 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
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PtprcP06800 Gm20658-201ENSMUST00000175871 1489 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
PtprcP06800 Arhgap29-201ENSMUST00000037958 5787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
PtprcP06800 5330413D20Rik-201ENSMUST00000208649 1416 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
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PtprcP06800 Zmiz1-208ENSMUST00000162645 7482 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
PtprcP06800 Tns2-201ENSMUST00000046144 4718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
PtprcP06800 Zfp286-202ENSMUST00000108705 1979 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
PtprcP06800 Hmgn2-201ENSMUST00000100472 881 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.22□□□□□ -0.45
PtprcP06800 Gm11475-201ENSMUST00000118482 476 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
PtprcP06800 Gm15136-201ENSMUST00000120552 533 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
PtprcP06800 Vmn1r-ps104-201ENSMUST00000120960 771 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
PtprcP06800 Mpv17l-202ENSMUST00000124947 768 ntTSL 3 BASIC12.22□□□□□ -0.45
PtprcP06800 Tspan32os-201ENSMUST00000131740 975 ntTSL 2 BASIC12.22□□□□□ -0.45
PtprcP06800 Gm12906-201ENSMUST00000154610 441 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
PtprcP06800 Nmbr-207ENSMUST00000190751 921 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
PtprcP06800 Gm28096-201ENSMUST00000191391 824 ntTSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
PtprcP06800 Gm19918-201ENSMUST00000194858 400 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
PtprcP06800 9530062K07Rik-201ENSMUST00000203332 787 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
PtprcP06800 Gm31520-203ENSMUST00000204874 647 ntTSL 3 BASIC12.22□□□□□ -0.45
PtprcP06800 Gm45388-201ENSMUST00000209922 1132 ntTSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
PtprcP06800 Gm31557-201ENSMUST00000213825 973 ntTSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
PtprcP06800 Gm31557-202ENSMUST00000213995 722 ntTSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
PtprcP06800 AC156801.1-201ENSMUST00000216158 493 ntTSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.6 ms