Protein–RNA interactions for Protein: P01575

Ifnb1, Interferon beta, mousemouse

Predictions only

Length 182 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ifnb1P01575 AC115122.1-201ENSMUST00000224850 1040 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Ifnb1P01575 H2-T3-201ENSMUST00000025312 2114 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ifnb1P01575 Tasp1-202ENSMUST00000099304 2127 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ifnb1P01575 Kbtbd12-206ENSMUST00000184878 3351 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ifnb1P01575 Il1rap-202ENSMUST00000096129 4438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ifnb1P01575 Fbxo8-201ENSMUST00000040218 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ifnb1P01575 A930024N18Rik-201ENSMUST00000181251 3955 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ifnb1P01575 Cxcl12-203ENSMUST00000112871 3132 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ifnb1P01575 Git1-202ENSMUST00000100812 3476 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ifnb1P01575 Gm45165-201ENSMUST00000207763 1631 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Ifnb1P01575 Dnmt3a-218ENSMUST00000174817 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ifnb1P01575 Katnal2-208ENSMUST00000137498 1824 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ifnb1P01575 Mmp19-203ENSMUST00000219404 2236 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ifnb1P01575 Prkd2-201ENSMUST00000086104 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ifnb1P01575 Ccdc96-201ENSMUST00000060100 3585 ntAPPRIS P1 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ifnb1P01575 Gm37264-201ENSMUST00000194916 2192 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Ifnb1P01575 Tle6-210ENSMUST00000142948 1961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ifnb1P01575 Specc1l-204ENSMUST00000218766 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ifnb1P01575 Ak8-201ENSMUST00000074156 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ifnb1P01575 Myh1-202ENSMUST00000075734 6012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ifnb1P01575 Tifa-205ENSMUST00000171621 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ifnb1P01575 Mfsd7a-201ENSMUST00000031455 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ifnb1P01575 Gm11033-203ENSMUST00000156185 2321 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ifnb1P01575 Itgal-205ENSMUST00000170971 3662 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ifnb1P01575 Eef2k-201ENSMUST00000047875 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ifnb1P01575 Mdh1-201ENSMUST00000102874 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ifnb1P01575 Acsbg1-201ENSMUST00000034822 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ifnb1P01575 Ttll13-201ENSMUST00000058266 3010 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ifnb1P01575 Ces3b-202ENSMUST00000093221 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ifnb1P01575 Scml2-206ENSMUST00000112345 4847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ifnb1P01575 Zcwpw1-201ENSMUST00000035852 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ifnb1P01575 Ikzf2-202ENSMUST00000187184 2013 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ifnb1P01575 Ces5a-203ENSMUST00000212009 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ifnb1P01575 Ostm1-202ENSMUST00000105497 770 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ifnb1P01575 Polr2i-203ENSMUST00000108193 488 ntTSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ifnb1P01575 Nhp2-202ENSMUST00000127405 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ifnb1P01575 Prss36-208ENSMUST00000156152 1132 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ifnb1P01575 C730034F03Rik-201ENSMUST00000168646 1280 ntAPPRIS P1 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ifnb1P01575 Ly6l-201ENSMUST00000177479 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ifnb1P01575 Mrpl20-206ENSMUST00000185148 494 ntTSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ifnb1P01575 Iqcf3-202ENSMUST00000186668 633 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ifnb1P01575 Gm3551-201ENSMUST00000190750 664 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Ifnb1P01575 Gm7271-202ENSMUST00000191515 836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ifnb1P01575 Gm43701-201ENSMUST00000202047 391 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ifnb1P01575 Cox6b1-204ENSMUST00000208838 354 ntTSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ifnb1P01575 Nutf2-202ENSMUST00000212042 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ifnb1P01575 AC159819.2-201ENSMUST00000216151 342 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Ifnb1P01575 Gm17749-201ENSMUST00000216282 690 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ifnb1P01575 AC162938.2-204ENSMUST00000216455 984 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ifnb1P01575 Mettl6-204ENSMUST00000227595 1027 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Ifnb1P01575 AC154589.2-201ENSMUST00000228847 251 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Ifnb1P01575 Pbp2-201ENSMUST00000050471 1279 ntAPPRIS P1 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ifnb1P01575 4921508M14Rik-201ENSMUST00000061679 1099 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Ifnb1P01575 Cthrc1-201ENSMUST00000067072 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ifnb1P01575 Anp32e-202ENSMUST00000165307 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ifnb1P01575 AW549877-201ENSMUST00000046633 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ifnb1P01575 Mdm1-201ENSMUST00000020437 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ifnb1P01575 Tmprss5-202ENSMUST00000165088 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ifnb1P01575 Scamp2-201ENSMUST00000045791 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ifnb1P01575 Habp2-201ENSMUST00000078284 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ifnb1P01575 Sox8-201ENSMUST00000025003 3000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ifnb1P01575 Gm5532-201ENSMUST00000097531 1751 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ifnb1P01575 Slitrk4-202ENSMUST00000114679 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ifnb1P01575 Wdr78-203ENSMUST00000106868 4045 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ifnb1P01575 Mrrf-201ENSMUST00000028250 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ifnb1P01575 Tmem88b-201ENSMUST00000097742 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ifnb1P01575 Tubgcp6-201ENSMUST00000041656 5357 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ifnb1P01575 Gm5739-201ENSMUST00000208601 1703 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Ifnb1P01575 Grik4-201ENSMUST00000034515 3413 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ifnb1P01575 Med13l-201ENSMUST00000100816 9296 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ifnb1P01575 Synpo2l-201ENSMUST00000057090 4394 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ifnb1P01575 Edil3-202ENSMUST00000081769 5317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ifnb1P01575 Gm8899-201ENSMUST00000214635 1332 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Ifnb1P01575 Foxh1-201ENSMUST00000037824 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ifnb1P01575 Hyal2-206ENSMUST00000195681 2968 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Ifnb1P01575 Rps6ka6-204ENSMUST00000113428 4135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ifnb1P01575 Calhm2-201ENSMUST00000035822 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ifnb1P01575 Thbs2-201ENSMUST00000170872 5922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ifnb1P01575 Rbbp5-202ENSMUST00000187505 1977 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ifnb1P01575 Tmem140-201ENSMUST00000074949 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ifnb1P01575 Arid2-201ENSMUST00000096250 8507 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ifnb1P01575 Gm10646-201ENSMUST00000213227 3293 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ifnb1P01575 Ehbp1-202ENSMUST00000109563 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ifnb1P01575 Fdft1-201ENSMUST00000054963 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ifnb1P01575 Mir1896-201ENSMUST00000122641 81 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Ifnb1P01575 Tmem204-202ENSMUST00000153745 902 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ifnb1P01575 Gm5294-201ENSMUST00000179205 651 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ifnb1P01575 9930004E17Rik-201ENSMUST00000180031 498 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Ifnb1P01575 Gm10731-201ENSMUST00000181171 448 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Ifnb1P01575 Olfr431-ps1-201ENSMUST00000192435 544 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Ifnb1P01575 Gm44421-201ENSMUST00000205064 1221 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Ifnb1P01575 AC129219.2-201ENSMUST00000224324 701 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Ifnb1P01575 AC154276.3-201ENSMUST00000227643 998 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Ifnb1P01575 Rbp2-201ENSMUST00000035029 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ifnb1P01575 Tsga8-201ENSMUST00000049420 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ifnb1P01575 Abca3-202ENSMUST00000079594 6380 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ifnb1P01575 Gm25125-201ENSMUST00000083340 136 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Ifnb1P01575 4930523C07Rik-202ENSMUST00000097513 300 ntAPPRIS P1 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ifnb1P01575 Gpr37-202ENSMUST00000200812 3035 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ifnb1P01575 Tacc2-217ENSMUST00000209108 3310 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.3 ms