Protein–RNA interactions for Protein: F7CXU4

H2-M1, Histocompatibility 2, M region locus 1, mousemouse

Predictions only

Length 344 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-M1F7CXU4 Gm10479-201ENSMUST00000101568 318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
H2-M1F7CXU4 A230006K03Rik-201ENSMUST00000107533 977 ntTSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
H2-M1F7CXU4 Hist1h2bk-201ENSMUST00000110455 476 ntAPPRIS P1 BASIC10.01□□□□□ -0.81
H2-M1F7CXU4 Gm16219-201ENSMUST00000120096 274 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
H2-M1F7CXU4 Slc25a12-206ENSMUST00000151937 6351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
H2-M1F7CXU4 Plgrkt-209ENSMUST00000152936 604 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
H2-M1F7CXU4 Gm25492-201ENSMUST00000157383 129 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
H2-M1F7CXU4 Gm15978-201ENSMUST00000161043 738 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
H2-M1F7CXU4 Gm18159-201ENSMUST00000174516 1070 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
H2-M1F7CXU4 Gm9358-201ENSMUST00000183067 927 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
H2-M1F7CXU4 Gm27232-201ENSMUST00000184373 597 ntTSL 3 BASIC10.01□□□□□ -0.81
H2-M1F7CXU4 1700025F24Rik-201ENSMUST00000185238 894 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
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H2-M1F7CXU4 Cmbl-201ENSMUST00000070918 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
H2-M1F7CXU4 Krtap6-2-201ENSMUST00000082065 786 ntAPPRIS P1 BASIC10.01□□□□□ -0.81
H2-M1F7CXU4 Sipa1l2-202ENSMUST00000212168 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
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H2-M1F7CXU4 Grin2b-205ENSMUST00000152012 2461 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
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H2-M1F7CXU4 Otx2-202ENSMUST00000119070 1708 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
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H2-M1F7CXU4 Rgs12-203ENSMUST00000114280 2777 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
H2-M1F7CXU4 Gm4593-201ENSMUST00000205334 1555 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
H2-M1F7CXU4 Nudt13-207ENSMUST00000224311 1574 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
H2-M1F7CXU4 Ak8-201ENSMUST00000074156 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
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H2-M1F7CXU4 Nrip3-201ENSMUST00000033331 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
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H2-M1F7CXU4 Myt1l-201ENSMUST00000021009 5027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
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H2-M1F7CXU4 Nfx1-202ENSMUST00000091614 3617 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
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