Protein–RNA interactions for Protein: F7BCN0

Gm28048, Predicted gene, 28048 (Fragment), mousemouse

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Length 99 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm28048F7BCN0 Gm45675-201ENSMUST00000211202 3429 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm28048F7BCN0 Jarid2-208ENSMUST00000173246 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm28048F7BCN0 C330007P06Rik-203ENSMUST00000115249 1145 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm28048F7BCN0 Spg20-203ENSMUST00000117341 2957 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm28048F7BCN0 Rpl36-ps10-201ENSMUST00000117431 216 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm28048F7BCN0 Gm13665-201ENSMUST00000120830 528 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm28048F7BCN0 Gm13388-201ENSMUST00000126659 425 ntTSL 3 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm28048F7BCN0 Gm12050-201ENSMUST00000127483 615 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm28048F7BCN0 Pfn1-201ENSMUST00000018437 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm28048F7BCN0 Gm29187-201ENSMUST00000186681 689 ntTSL 3 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm28048F7BCN0 Gm28694-201ENSMUST00000190681 722 ntTSL 3 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm28048F7BCN0 Gpx1-204ENSMUST00000193987 653 ntTSL 3 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm28048F7BCN0 Gm38317-201ENSMUST00000195564 343 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm28048F7BCN0 Gm8615-202ENSMUST00000201946 737 ntTSL 3 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm28048F7BCN0 Gm44066-201ENSMUST00000203263 519 ntTSL 3 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm28048F7BCN0 Gm30459-201ENSMUST00000206203 1193 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm28048F7BCN0 Gm8342-201ENSMUST00000209839 757 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm28048F7BCN0 Hspb2-202ENSMUST00000217159 552 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm28048F7BCN0 AC151275.1-201ENSMUST00000224870 585 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm28048F7BCN0 Pemt-201ENSMUST00000000310 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm28048F7BCN0 Tsc22d4-201ENSMUST00000031738 1043 ntTSL 3 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm28048F7BCN0 Celsr2-201ENSMUST00000090558 10598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm28048F7BCN0 Nek4-207ENSMUST00000228328 4245 ntAPPRIS P2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm28048F7BCN0 Trim9-205ENSMUST00000221041 3767 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm28048F7BCN0 Gm32511-202ENSMUST00000217021 2069 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm28048F7BCN0 Rsph10b-203ENSMUST00000166847 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm28048F7BCN0 Slc38a11-201ENSMUST00000112420 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm28048F7BCN0 Capn8-201ENSMUST00000048941 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm28048F7BCN0 Abcg1-201ENSMUST00000024829 3610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm28048F7BCN0 Slc16a1-201ENSMUST00000046212 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm28048F7BCN0 Gm6015-201ENSMUST00000217493 1586 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm28048F7BCN0 Pgf-201ENSMUST00000004913 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm28048F7BCN0 Pabpc4-201ENSMUST00000078734 2700 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm28048F7BCN0 4921513H07Rik-201ENSMUST00000201403 2238 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm28048F7BCN0 Hsdl1-204ENSMUST00000212517 2215 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm28048F7BCN0 Orc4-201ENSMUST00000028098 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm28048F7BCN0 Prrx1-201ENSMUST00000027878 4952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm28048F7BCN0 Slc25a25-202ENSMUST00000052119 3529 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm28048F7BCN0 Astn1-205ENSMUST00000193042 7248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm28048F7BCN0 Allc-202ENSMUST00000110917 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm28048F7BCN0 Ptcd1-201ENSMUST00000031628 3087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm28048F7BCN0 Epb41l5-202ENSMUST00000052404 6442 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm28048F7BCN0 Actn2-201ENSMUST00000064204 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm28048F7BCN0 Gm16364-201ENSMUST00000153722 1313 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm28048F7BCN0 Ctnnd1-223ENSMUST00000111697 5294 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm28048F7BCN0 Olfr1121-202ENSMUST00000213792 1996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm28048F7BCN0 Rassf2-201ENSMUST00000028814 8233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm28048F7BCN0 Gm25148-201ENSMUST00000104611 123 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm28048F7BCN0 Ggt6-203ENSMUST00000108499 874 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm28048F7BCN0 Cetn2-203ENSMUST00000114551 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm28048F7BCN0 Kxd1-204ENSMUST00000121623 884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm28048F7BCN0 Gm12690-201ENSMUST00000132108 354 ntTSL 3 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm28048F7BCN0 Hoxb5os-202ENSMUST00000150698 596 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm28048F7BCN0 Gm24990-201ENSMUST00000157406 323 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm28048F7BCN0 Creb3-206ENSMUST00000167751 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm28048F7BCN0 Gm16505-201ENSMUST00000179981 232 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm28048F7BCN0 Cox6b2-204ENSMUST00000182173 391 ntTSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm28048F7BCN0 Gm7985-201ENSMUST00000183329 981 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm28048F7BCN0 Sox2ot-217ENSMUST00000200414 710 ntTSL 3 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm28048F7BCN0 Zfp787-205ENSMUST00000207957 880 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm28048F7BCN0 AC166349.1-201ENSMUST00000220866 695 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm28048F7BCN0 Pebp4-201ENSMUST00000022678 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm28048F7BCN0 AC137950.2-201ENSMUST00000227127 1089 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm28048F7BCN0 Ndufb3-201ENSMUST00000027193 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm28048F7BCN0 Uqcc1-201ENSMUST00000006036 808 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm28048F7BCN0 Rnase2b-201ENSMUST00000075648 759 ntAPPRIS P1 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm28048F7BCN0 Kxd1-201ENSMUST00000093456 1216 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm28048F7BCN0 Tmem107-202ENSMUST00000094081 1263 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm28048F7BCN0 Sox13-203ENSMUST00000144386 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
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Gm28048F7BCN0 Pex26-202ENSMUST00000118234 3778 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm28048F7BCN0 Pld5-203ENSMUST00000111167 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm28048F7BCN0 Aen-203ENSMUST00000107425 4956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm28048F7BCN0 Grip1-216ENSMUST00000154238 2482 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm28048F7BCN0 Eya2-201ENSMUST00000063433 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm28048F7BCN0 Ampd2-203ENSMUST00000102638 3650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm28048F7BCN0 Tdrd1-202ENSMUST00000111604 5187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm28048F7BCN0 Olfr6-203ENSMUST00000213651 4457 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm28048F7BCN0 Filip1l-202ENSMUST00000159414 3253 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm28048F7BCN0 Ticam1-201ENSMUST00000058136 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm28048F7BCN0 Pcdh11x-202ENSMUST00000113358 8607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm28048F7BCN0 Evi2a-201ENSMUST00000103236 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm28048F7BCN0 Gm12915-201ENSMUST00000131381 1499 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm28048F7BCN0 Drd3-201ENSMUST00000023390 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm28048F7BCN0 Dclk1-213ENSMUST00000199702 2922 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm28048F7BCN0 Gtf2i-222ENSMUST00000174354 4084 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm28048F7BCN0 Myo18a-208ENSMUST00000108375 7513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm28048F7BCN0 AC113282.1-201ENSMUST00000225278 1707 ntAPPRIS P1 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm28048F7BCN0 Ppp6r2-201ENSMUST00000088788 2887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm28048F7BCN0 Wdr60-201ENSMUST00000039349 3721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm28048F7BCN0 Rab13-202ENSMUST00000107373 1415 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm28048F7BCN0 Synpo2l-203ENSMUST00000119483 3696 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm28048F7BCN0 Znrf1-202ENSMUST00000166859 3650 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm28048F7BCN0 Rdh11-201ENSMUST00000085254 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm28048F7BCN0 Mical1-203ENSMUST00000119962 3565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm28048F7BCN0 Aqr-202ENSMUST00000102543 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm28048F7BCN0 Dido1-204ENSMUST00000103055 4613 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm28048F7BCN0 March10-204ENSMUST00000138977 2979 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm28048F7BCN0 Gm13187-202ENSMUST00000133873 1321 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm28048F7BCN0 Fpr1-201ENSMUST00000061516 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
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