Protein–RNA interactions for Protein: F6U8B9

Gm17555, Predicted gene, 17555, mousemouse

Predictions only

Length 371 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm17555F6U8B9 1700125G22Rik-201ENSMUST00000181124 861 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm17555F6U8B9 Gm9866-204ENSMUST00000183238 351 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm17555F6U8B9 Mir6979-201ENSMUST00000183927 56 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm17555F6U8B9 Vmn1r205-201ENSMUST00000185475 951 ntAPPRIS P1 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm17555F6U8B9 Gm29707-202ENSMUST00000198744 659 ntTSL 3 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm17555F6U8B9 Gm45575-201ENSMUST00000210283 548 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm17555F6U8B9 Gm19324-201ENSMUST00000213229 1169 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm17555F6U8B9 Cplx3-203ENSMUST00000217015 540 ntTSL 2 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm17555F6U8B9 AC164573.1-201ENSMUST00000218616 963 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm17555F6U8B9 AC134328.1-201ENSMUST00000222693 667 ntTSL 2 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm17555F6U8B9 Cmtm2b-201ENSMUST00000041973 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm17555F6U8B9 Abhd14a-201ENSMUST00000048685 1256 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm17555F6U8B9 Mkl1-204ENSMUST00000134469 4392 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm17555F6U8B9 Ap5z1-201ENSMUST00000038699 3689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm17555F6U8B9 Cycs-202ENSMUST00000161401 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm17555F6U8B9 Atf7ip2-201ENSMUST00000044005 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm17555F6U8B9 Pdzk1-202ENSMUST00000107069 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm17555F6U8B9 Irf5-202ENSMUST00000163511 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm17555F6U8B9 Mpv17-202ENSMUST00000200744 1653 ntTSL 2 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm17555F6U8B9 Ccdc15-204ENSMUST00000216042 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm17555F6U8B9 Mkks-202ENSMUST00000110089 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm17555F6U8B9 Grik1-201ENSMUST00000023652 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm17555F6U8B9 AC079680.2-201ENSMUST00000219181 1306 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm17555F6U8B9 Osr2-204ENSMUST00000228152 1324 ntAPPRIS P1 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm17555F6U8B9 Tasp1-203ENSMUST00000110079 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm17555F6U8B9 Rnft2-201ENSMUST00000117177 4381 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm17555F6U8B9 Uhrf1-202ENSMUST00000113035 3402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm17555F6U8B9 Nfya-201ENSMUST00000046719 3645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm17555F6U8B9 Gm12333-201ENSMUST00000155508 2669 ntTSL 3 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm17555F6U8B9 Zfp558-202ENSMUST00000034647 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm17555F6U8B9 Vstm2a-201ENSMUST00000109645 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm17555F6U8B9 Foxp1-201ENSMUST00000074346 2118 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm17555F6U8B9 Mthfsd-201ENSMUST00000047282 8312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm17555F6U8B9 Gm45132-201ENSMUST00000207234 2542 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm17555F6U8B9 Muc13-201ENSMUST00000023520 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm17555F6U8B9 Gm13347-201ENSMUST00000120298 1353 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm17555F6U8B9 Acp5-203ENSMUST00000165735 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm17555F6U8B9 1810053B23Rik-205ENSMUST00000188056 1592 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm17555F6U8B9 Arhgap15os-201ENSMUST00000139948 1761 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm17555F6U8B9 Cnga4-202ENSMUST00000210344 1977 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm17555F6U8B9 Gp2-201ENSMUST00000033255 1993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm17555F6U8B9 Nme1-203ENSMUST00000135884 3181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm17555F6U8B9 Aen-203ENSMUST00000107425 4956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm17555F6U8B9 Col9a1-201ENSMUST00000054588 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm17555F6U8B9 Calu-201ENSMUST00000031779 3229 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm17555F6U8B9 Rufy4-202ENSMUST00000127134 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm17555F6U8B9 Slamf7-204ENSMUST00000194531 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm17555F6U8B9 Pcdhga1-201ENSMUST00000194190 4692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm17555F6U8B9 Cage1-201ENSMUST00000074969 2856 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm17555F6U8B9 Crebrf-203ENSMUST00000142539 2674 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm17555F6U8B9 Ttc23-201ENSMUST00000032774 2492 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm17555F6U8B9 Coch-201ENSMUST00000085412 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm17555F6U8B9 Apol7a-203ENSMUST00000175919 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm17555F6U8B9 Gnas-223ENSMUST00000185956 3729 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm17555F6U8B9 Gnas-224ENSMUST00000186907 3729 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm17555F6U8B9 Ttll5-205ENSMUST00000110224 4647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm17555F6U8B9 Ifitm10-203ENSMUST00000105988 824 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm17555F6U8B9 Lyzl6-202ENSMUST00000107014 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm17555F6U8B9 Cdk2ap1-204ENSMUST00000111474 1286 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm17555F6U8B9 Gm13035-201ENSMUST00000117496 342 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm17555F6U8B9 Gm12566-201ENSMUST00000121479 359 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm17555F6U8B9 Prdx5-203ENSMUST00000149261 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm17555F6U8B9 Ubl5-206ENSMUST00000161486 794 ntTSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm17555F6U8B9 Slpi-202ENSMUST00000165980 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm17555F6U8B9 Gm17111-201ENSMUST00000169981 411 ntTSL 3 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm17555F6U8B9 4930562C15Rik-202ENSMUST00000171105 1299 ntTSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm17555F6U8B9 Gm18734-201ENSMUST00000172937 808 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm17555F6U8B9 3110045C21Rik-201ENSMUST00000180638 1135 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm17555F6U8B9 Gm27552-201ENSMUST00000183351 62 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm17555F6U8B9 Gm27844-201ENSMUST00000183613 62 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm17555F6U8B9 Gm43050-202ENSMUST00000201152 651 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm17555F6U8B9 Gm44867-201ENSMUST00000205675 530 ntTSL 3 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm17555F6U8B9 Gm6108-201ENSMUST00000208365 367 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm17555F6U8B9 Ssr4-201ENSMUST00000002090 765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm17555F6U8B9 AC134860.1-201ENSMUST00000224867 660 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm17555F6U8B9 Olfr686-201ENSMUST00000050157 1018 ntAPPRIS P1 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm17555F6U8B9 Wfdc21-201ENSMUST00000070832 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm17555F6U8B9 H2-M9-202ENSMUST00000087167 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm17555F6U8B9 Tceanc-202ENSMUST00000112188 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm17555F6U8B9 Gpatch2-204ENSMUST00000110943 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm17555F6U8B9 BC049352-203ENSMUST00000171799 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm17555F6U8B9 Smg6-201ENSMUST00000045281 5848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm17555F6U8B9 Cd300lg-201ENSMUST00000017453 2353 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm17555F6U8B9 Gm3294-201ENSMUST00000164104 7367 ntTSL 3 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm17555F6U8B9 Sh2d5-201ENSMUST00000105823 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm17555F6U8B9 Eif4g2-206ENSMUST00000161051 3548 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm17555F6U8B9 Maob-201ENSMUST00000040820 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm17555F6U8B9 Krtap10-10-201ENSMUST00000218843 1306 ntAPPRIS P1 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm17555F6U8B9 Olfr77-202ENSMUST00000217347 5980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm17555F6U8B9 Svil-204ENSMUST00000127297 6243 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm17555F6U8B9 Csnk1g1-214ENSMUST00000206594 2482 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm17555F6U8B9 Abcf1-201ENSMUST00000043757 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm17555F6U8B9 Smok3a-201ENSMUST00000085886 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm17555F6U8B9 Hk3-201ENSMUST00000052949 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm17555F6U8B9 A930016O22Rik-202ENSMUST00000208685 2349 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm17555F6U8B9 9530059O14Rik-201ENSMUST00000181107 3978 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm17555F6U8B9 Camk2b-210ENSMUST00000109815 3780 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm17555F6U8B9 Gm5380-201ENSMUST00000119296 2136 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm17555F6U8B9 Hsd3b3-203ENSMUST00000107018 1443 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm17555F6U8B9 6030466F02Rik-201ENSMUST00000212339 1434 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.3 ms