Protein–RNA interactions for Protein: A2A8L5

Ptprf, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase F, mousemouse

Predictions only

Length 1,898 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprfA2A8L5 Gm12052-201ENSMUST00000142151 933 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
PtprfA2A8L5 Gm27191-201ENSMUST00000145973 448 ntTSL 3 BASIC11.07□□□□□ -0.64
PtprfA2A8L5 Gm11915-201ENSMUST00000153669 358 ntTSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
PtprfA2A8L5 Scgb2b7-201ENSMUST00000178258 520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
PtprfA2A8L5 Gm24954-201ENSMUST00000178831 110 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
PtprfA2A8L5 9530085P06Rik-201ENSMUST00000182121 827 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
PtprfA2A8L5 Ighv1-2-201ENSMUST00000195325 378 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
PtprfA2A8L5 Adh6-ps1-202ENSMUST00000196293 754 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
PtprfA2A8L5 Nme6-214ENSMUST00000200468 865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.07□□□□□ -0.64
PtprfA2A8L5 AC116680.1-201ENSMUST00000222804 613 ntTSL 3 BASIC11.07□□□□□ -0.64
PtprfA2A8L5 Scgb2b2-201ENSMUST00000038835 520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
PtprfA2A8L5 Ensa-202ENSMUST00000058230 1130 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
PtprfA2A8L5 Rpl3-201ENSMUST00000081650 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
PtprfA2A8L5 Uqcc3-201ENSMUST00000096253 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
PtprfA2A8L5 4631405J19Rik-201ENSMUST00000099699 1225 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
PtprfA2A8L5 Fktn-204ENSMUST00000221657 6241 ntTSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
PtprfA2A8L5 Ces2h-201ENSMUST00000172032 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
PtprfA2A8L5 Tctn3-201ENSMUST00000025981 2743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
PtprfA2A8L5 Pdzrn4-202ENSMUST00000169942 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
PtprfA2A8L5 Catsper1-201ENSMUST00000043380 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
PtprfA2A8L5 Gm5532-201ENSMUST00000097531 1751 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
PtprfA2A8L5 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
PtprfA2A8L5 Hnrnph2-205ENSMUST00000113203 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
PtprfA2A8L5 Crybg3-205ENSMUST00000172910 2870 ntTSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
PtprfA2A8L5 AC154220.1-201ENSMUST00000225033 1705 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
PtprfA2A8L5 Mdm1-201ENSMUST00000020437 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
PtprfA2A8L5 Gm37160-201ENSMUST00000193081 1689 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
PtprfA2A8L5 Pex3-207ENSMUST00000170376 1381 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
PtprfA2A8L5 Clip1-202ENSMUST00000063905 4589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
PtprfA2A8L5 Il2rb-201ENSMUST00000089398 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
PtprfA2A8L5 Tbx3-203ENSMUST00000121021 4777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
PtprfA2A8L5 Mei4-203ENSMUST00000189832 2578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
PtprfA2A8L5 Atcayos-203ENSMUST00000150782 3057 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
PtprfA2A8L5 Gm14137-201ENSMUST00000069711 3067 ntAPPRIS P1 BASIC11.06□□□□□ -0.64
PtprfA2A8L5 Gm11411-201ENSMUST00000117951 719 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
PtprfA2A8L5 Gm6630-201ENSMUST00000119199 454 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
PtprfA2A8L5 Ube2d-ps-201ENSMUST00000121354 441 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
PtprfA2A8L5 Gm12745-201ENSMUST00000121767 214 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
PtprfA2A8L5 7420461P10Rik-201ENSMUST00000169439 781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
PtprfA2A8L5 Gm5865-201ENSMUST00000198713 637 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
PtprfA2A8L5 Olfr1358-201ENSMUST00000204477 1064 ntAPPRIS P1 BASIC11.06□□□□□ -0.64
PtprfA2A8L5 Klk1b15-ps-201ENSMUST00000206273 715 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
PtprfA2A8L5 Gm45258-201ENSMUST00000210042 853 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
PtprfA2A8L5 Cklf-210ENSMUST00000212939 737 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.06□□□□□ -0.64
PtprfA2A8L5 n-R5s71-201ENSMUST00000093668 119 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
PtprfA2A8L5 Arhgap28-201ENSMUST00000024840 5322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
PtprfA2A8L5 Slc2a4-201ENSMUST00000018710 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
PtprfA2A8L5 Chst10-205ENSMUST00000193441 4999 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
PtprfA2A8L5 Grm2-201ENSMUST00000023959 4711 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
PtprfA2A8L5 A1cf-202ENSMUST00000224304 2968 ntAPPRIS ALT1 BASIC11.06□□□□□ -0.64
PtprfA2A8L5 Kpna7-202ENSMUST00000110673 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
PtprfA2A8L5 Cacna2d1-205ENSMUST00000167946 7436 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
PtprfA2A8L5 Pcgf2-207ENSMUST00000179765 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
PtprfA2A8L5 Tnc-202ENSMUST00000107371 2928 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
PtprfA2A8L5 AC125409.1-201ENSMUST00000223213 3370 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
PtprfA2A8L5 Plch2-206ENSMUST00000135665 4349 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
PtprfA2A8L5 Ippk-201ENSMUST00000021817 2856 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
PtprfA2A8L5 Ano4-202ENSMUST00000181976 1410 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
PtprfA2A8L5 Adam20-201ENSMUST00000056331 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
PtprfA2A8L5 Eif2s2-201ENSMUST00000099173 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
PtprfA2A8L5 Heg1-201ENSMUST00000126532 6714 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
PtprfA2A8L5 Riox2-202ENSMUST00000120667 2200 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
PtprfA2A8L5 Slc44a4-202ENSMUST00000169230 2246 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
PtprfA2A8L5 4833420G17Rik-204ENSMUST00000225186 2627 ntAPPRIS P1 BASIC11.06□□□□□ -0.64
PtprfA2A8L5 Mfsd4b5-203ENSMUST00000164566 2372 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
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PtprfA2A8L5 Trub2-203ENSMUST00000113807 1035 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
PtprfA2A8L5 Hoxd3os1-203ENSMUST00000145799 511 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
PtprfA2A8L5 Gm32111-201ENSMUST00000207689 846 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
PtprfA2A8L5 AC154806.7-201ENSMUST00000227998 202 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
PtprfA2A8L5 Olfr63-201ENSMUST00000067840 955 ntAPPRIS P1 BASIC11.06□□□□□ -0.64
PtprfA2A8L5 Gm10580-201ENSMUST00000097985 396 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
PtprfA2A8L5 Gm10582-201ENSMUST00000097987 396 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
PtprfA2A8L5 Gm10583-201ENSMUST00000097988 396 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
PtprfA2A8L5 Habp2-201ENSMUST00000078284 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
PtprfA2A8L5 Kyat1-201ENSMUST00000044038 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
PtprfA2A8L5 Gm13104-201ENSMUST00000119651 1446 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
PtprfA2A8L5 Serinc5-201ENSMUST00000049488 5366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
PtprfA2A8L5 Cfap74-204ENSMUST00000123952 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
PtprfA2A8L5 AC156631.1-201ENSMUST00000215213 1358 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
PtprfA2A8L5 Ttc7b-206ENSMUST00000223020 3307 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
PtprfA2A8L5 Lig3-210ENSMUST00000173347 3631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
PtprfA2A8L5 Ldb3-202ENSMUST00000022328 2468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
PtprfA2A8L5 Sox8-201ENSMUST00000025003 3000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
PtprfA2A8L5 Hsd3b1-202ENSMUST00000107016 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
PtprfA2A8L5 Gm43713-201ENSMUST00000198251 1896 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
PtprfA2A8L5 Tmem178b-201ENSMUST00000061740 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
PtprfA2A8L5 Cd19-201ENSMUST00000032968 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
PtprfA2A8L5 Scnn1g-201ENSMUST00000000221 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
PtprfA2A8L5 Oxct1-201ENSMUST00000110690 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
PtprfA2A8L5 Eef1akmt4-202ENSMUST00000119224 1464 ntTSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
PtprfA2A8L5 Cycs-202ENSMUST00000161401 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
PtprfA2A8L5 4930432K21Rik-202ENSMUST00000118856 2366 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
PtprfA2A8L5 Vmn2r18-201ENSMUST00000165928 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
PtprfA2A8L5 Cd247-205ENSMUST00000161559 1816 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
PtprfA2A8L5 Polr2j-203ENSMUST00000111129 474 ntTSL 3 BASIC11.05□□□□□ -0.64
PtprfA2A8L5 D3Ertd751e-204ENSMUST00000119572 1011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
PtprfA2A8L5 Gm5909-201ENSMUST00000119768 1281 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
PtprfA2A8L5 Gm14165-201ENSMUST00000121456 952 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
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