Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1J2

Nek4, Serine/threonine-protein kinase Nek4, mousemouse

Predictions only

Length 792 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nek4Q9Z1J2 Ptpn23-201ENSMUST00000040021 5346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Nek4Q9Z1J2 Zfp110-201ENSMUST00000004614 3591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Nek4Q9Z1J2 Galm-201ENSMUST00000039205 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Nek4Q9Z1J2 Gm26811-201ENSMUST00000181258 5485 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Nek4Q9Z1J2 Spesp1-201ENSMUST00000056949 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Nek4Q9Z1J2 Eid3-201ENSMUST00000211623 1305 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Nek4Q9Z1J2 Slx4ip-206ENSMUST00000180277 2723 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Nek4Q9Z1J2 Gm45675-201ENSMUST00000211202 3429 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Nek4Q9Z1J2 A230077H06Rik-202ENSMUST00000189574 2477 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Nek4Q9Z1J2 Chmp1b-202ENSMUST00000210564 2490 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Nek4Q9Z1J2 Gm10750-201ENSMUST00000099266 1506 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Nek4Q9Z1J2 Casc1-203ENSMUST00000111728 2682 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Nek4Q9Z1J2 Tmem254b-202ENSMUST00000100806 1108 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Nek4Q9Z1J2 Tmem254a-201ENSMUST00000100811 1108 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Nek4Q9Z1J2 Rmdn1-202ENSMUST00000108253 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Nek4Q9Z1J2 Mrpl55-205ENSMUST00000108787 718 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Nek4Q9Z1J2 Gm11949-201ENSMUST00000117640 372 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Nek4Q9Z1J2 Gm15573-201ENSMUST00000119487 540 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Nek4Q9Z1J2 Mup-ps26-201ENSMUST00000121751 202 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Nek4Q9Z1J2 Mir1896-201ENSMUST00000122641 81 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Nek4Q9Z1J2 Gm11791-201ENSMUST00000139327 336 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Nek4Q9Z1J2 Gm17231-202ENSMUST00000165858 663 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Nek4Q9Z1J2 Gm20662-201ENSMUST00000176356 601 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Nek4Q9Z1J2 Crnde-207ENSMUST00000180102 732 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Nek4Q9Z1J2 1700029J03Rik-201ENSMUST00000185803 789 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Nek4Q9Z1J2 Gm28306-201ENSMUST00000191315 529 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Nek4Q9Z1J2 Rbakdn-201ENSMUST00000198334 520 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Nek4Q9Z1J2 4930430O22Rik-202ENSMUST00000202548 579 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Nek4Q9Z1J2 9430078K24Rik-201ENSMUST00000218818 1082 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Nek4Q9Z1J2 Ankrd7-201ENSMUST00000031489 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Nek4Q9Z1J2 Tsga8-201ENSMUST00000049420 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Nek4Q9Z1J2 1700001J03Rik-201ENSMUST00000073721 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Nek4Q9Z1J2 Psd4-201ENSMUST00000056641 4748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Nek4Q9Z1J2 Gm4846-201ENSMUST00000143922 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Nek4Q9Z1J2 Gm37264-201ENSMUST00000194916 2192 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Nek4Q9Z1J2 Gm11571-201ENSMUST00000136820 2396 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Nek4Q9Z1J2 Pabpc1l-201ENSMUST00000067715 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Nek4Q9Z1J2 Olfr742-202ENSMUST00000213935 2117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Nek4Q9Z1J2 Bcat2-208ENSMUST00000211173 1684 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Nek4Q9Z1J2 Txlna-201ENSMUST00000046425 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Nek4Q9Z1J2 Furin-202ENSMUST00000120753 4332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Nek4Q9Z1J2 Ttc14-201ENSMUST00000099153 9661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Nek4Q9Z1J2 Inpp4a-208ENSMUST00000137266 2934 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Nek4Q9Z1J2 Anks1b-233ENSMUST00000183156 4248 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Nek4Q9Z1J2 Ptpro-201ENSMUST00000077115 5049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Nek4Q9Z1J2 Ikzf2-202ENSMUST00000187184 2013 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Nek4Q9Z1J2 Col20a1-202ENSMUST00000149179 3867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Nek4Q9Z1J2 Tcp10a-203ENSMUST00000129709 1778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Nek4Q9Z1J2 AW549877-201ENSMUST00000046633 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Nek4Q9Z1J2 Rbm47-202ENSMUST00000094757 4643 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Nek4Q9Z1J2 Mical1-203ENSMUST00000119962 3565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Nek4Q9Z1J2 Slitrk4-202ENSMUST00000114679 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Nek4Q9Z1J2 Zeb2-211ENSMUST00000153561 2070 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Nek4Q9Z1J2 Gm15883-201ENSMUST00000153562 1690 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Nek4Q9Z1J2 5033403F01Rik-201ENSMUST00000181376 1678 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Nek4Q9Z1J2 Spice1-201ENSMUST00000050897 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Nek4Q9Z1J2 Snhg18-201ENSMUST00000181536 1486 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Nek4Q9Z1J2 Vwa5b2-207ENSMUST00000159780 4042 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Nek4Q9Z1J2 Styxl1-205ENSMUST00000111164 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Nek4Q9Z1J2 4930595D18Rik-201ENSMUST00000121608 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Nek4Q9Z1J2 Rpl9-ps7-201ENSMUST00000140507 579 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Nek4Q9Z1J2 Tro-208ENSMUST00000164071 891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Nek4Q9Z1J2 Gm23045-201ENSMUST00000175041 96 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Nek4Q9Z1J2 Gm43916-201ENSMUST00000205062 967 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Nek4Q9Z1J2 4930479H17Rik-201ENSMUST00000208824 292 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Nek4Q9Z1J2 Ddo-207ENSMUST00000216830 806 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Nek4Q9Z1J2 Gm9111-201ENSMUST00000219394 709 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Nek4Q9Z1J2 Olfr1395-201ENSMUST00000059379 954 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Nek4Q9Z1J2 Rpl9-ps4-201ENSMUST00000075549 579 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Nek4Q9Z1J2 Gm5451-201ENSMUST00000080545 579 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Nek4Q9Z1J2 Tanc1-201ENSMUST00000037526 7873 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Nek4Q9Z1J2 Ranbp10-201ENSMUST00000041400 5308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Nek4Q9Z1J2 Ifit1bl1-202ENSMUST00000168254 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Nek4Q9Z1J2 Cyp2j13-202ENSMUST00000097973 1648 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Nek4Q9Z1J2 Gm19327-201ENSMUST00000220651 3271 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Nek4Q9Z1J2 Wdr33-201ENSMUST00000025264 6206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Nek4Q9Z1J2 Cldn19-202ENSMUST00000094823 4168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Nek4Q9Z1J2 Socs6-201ENSMUST00000070116 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Nek4Q9Z1J2 Sec16a-202ENSMUST00000114082 8797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Nek4Q9Z1J2 Tnpo3-201ENSMUST00000012679 4251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Nek4Q9Z1J2 Lhx9-205ENSMUST00000112030 4633 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Nek4Q9Z1J2 Rapgef2-206ENSMUST00000195708 6964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Nek4Q9Z1J2 Kyat1-201ENSMUST00000044038 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Nek4Q9Z1J2 Susd3-201ENSMUST00000021816 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Nek4Q9Z1J2 Ncf4-201ENSMUST00000096357 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Nek4Q9Z1J2 Rufy2-203ENSMUST00000122231 2664 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Nek4Q9Z1J2 Glb1l-201ENSMUST00000113623 2339 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Nek4Q9Z1J2 Zfp593-201ENSMUST00000030644 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Nek4Q9Z1J2 Gm43375-201ENSMUST00000196705 2480 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Nek4Q9Z1J2 Ttc7b-206ENSMUST00000223020 3307 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Nek4Q9Z1J2 Clpb-211ENSMUST00000209579 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Nek4Q9Z1J2 S100a4-201ENSMUST00000001046 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Nek4Q9Z1J2 Rtn2-202ENSMUST00000108468 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Nek4Q9Z1J2 Rpl28-ps1-201ENSMUST00000121497 414 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Nek4Q9Z1J2 Gm14199-201ENSMUST00000130021 495 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Nek4Q9Z1J2 Gm10051-201ENSMUST00000145209 414 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Nek4Q9Z1J2 Tbc1d22bos-201ENSMUST00000159875 826 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Nek4Q9Z1J2 1700030I03Rik-201ENSMUST00000192978 942 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Nek4Q9Z1J2 Gm37826-201ENSMUST00000195329 322 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Nek4Q9Z1J2 4933408A14Rik-201ENSMUST00000199037 729 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.9 ms