Protein–RNA interactions for Protein: Q9JM73

Srf, Serum response factor, mousemouse

Predictions only

Length 504 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrfQ9JM73 Mapk4-202ENSMUST00000159162 3514 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
SrfQ9JM73 Igkv3-10-201ENSMUST00000103397 356 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
SrfQ9JM73 Ighv1-50-201ENSMUST00000103521 390 ntAPPRIS P1 BASIC10.76□□□□□ -0.69
SrfQ9JM73 1700001C02Rik-202ENSMUST00000114743 729 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
SrfQ9JM73 Gm12461-201ENSMUST00000120231 1239 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
SrfQ9JM73 Gm11952-201ENSMUST00000121172 821 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
SrfQ9JM73 Gm13707-201ENSMUST00000123663 600 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
SrfQ9JM73 Lrrc75aos2-202ENSMUST00000128647 1227 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
SrfQ9JM73 AC034099.1-202ENSMUST00000133843 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
SrfQ9JM73 Gm27191-201ENSMUST00000145973 448 ntTSL 3 BASIC10.76□□□□□ -0.69
SrfQ9JM73 Acss2os-201ENSMUST00000148685 629 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
SrfQ9JM73 Gm25604-201ENSMUST00000158359 133 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
SrfQ9JM73 Gm16240-201ENSMUST00000161924 614 ntTSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
SrfQ9JM73 Gm24328-201ENSMUST00000175104 67 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
SrfQ9JM73 Scgb2b7-201ENSMUST00000178258 520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
SrfQ9JM73 Gm8705-201ENSMUST00000180823 812 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
SrfQ9JM73 Gm29164-201ENSMUST00000185454 1024 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
SrfQ9JM73 Gm28934-201ENSMUST00000186491 346 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
SrfQ9JM73 Gm29329-201ENSMUST00000189053 621 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
SrfQ9JM73 Gm28331-201ENSMUST00000191102 621 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
SrfQ9JM73 Gm31274-201ENSMUST00000197356 229 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
SrfQ9JM73 Gm42751-201ENSMUST00000198065 559 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
SrfQ9JM73 Lsm8-204ENSMUST00000201141 503 ntTSL 3 BASIC10.76□□□□□ -0.69
SrfQ9JM73 Gm20735-202ENSMUST00000212387 519 ntTSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
SrfQ9JM73 AC165245.1-201ENSMUST00000214181 636 ntTSL 3 BASIC10.76□□□□□ -0.69
SrfQ9JM73 Olfr1059-ps1-201ENSMUST00000215214 586 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
SrfQ9JM73 AC160105.1-201ENSMUST00000221931 682 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
SrfQ9JM73 AC102352.1-201ENSMUST00000224187 582 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
SrfQ9JM73 CT010480.2-201ENSMUST00000225424 737 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
SrfQ9JM73 AC115357.1-201ENSMUST00000227575 466 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
SrfQ9JM73 Olfr525-201ENSMUST00000078103 1050 ntAPPRIS P1 BASIC10.76□□□□□ -0.69
SrfQ9JM73 Gm5449-201ENSMUST00000081132 357 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
SrfQ9JM73 Ivns1abp-202ENSMUST00000097543 3337 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
SrfQ9JM73 Prkag3-201ENSMUST00000081636 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
SrfQ9JM73 Als2cl-206ENSMUST00000155014 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
SrfQ9JM73 Olfr707-203ENSMUST00000210644 1817 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.76□□□□□ -0.69
SrfQ9JM73 Mybph-201ENSMUST00000038445 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
SrfQ9JM73 Gm39321-203ENSMUST00000217090 1575 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
SrfQ9JM73 Palld-204ENSMUST00000121785 6349 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
SrfQ9JM73 Gm13871-202ENSMUST00000107319 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
SrfQ9JM73 Gm11757-202ENSMUST00000107321 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
SrfQ9JM73 Gm8177-201ENSMUST00000181591 1336 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
SrfQ9JM73 Gm43341-201ENSMUST00000200104 1308 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
SrfQ9JM73 Gm11342-203ENSMUST00000224879 1324 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
SrfQ9JM73 Etv3-205ENSMUST00000170036 5127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
SrfQ9JM73 Hyal3-202ENSMUST00000148440 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
SrfQ9JM73 Alox5-207ENSMUST00000170186 1929 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
SrfQ9JM73 Gm37082-201ENSMUST00000192629 1927 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
SrfQ9JM73 Gm10305-201ENSMUST00000195331 2475 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
SrfQ9JM73 Dcaf8-201ENSMUST00000074144 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
SrfQ9JM73 Nsun7-204ENSMUST00000202994 3632 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
SrfQ9JM73 Qrfpr-203ENSMUST00000197447 1690 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
SrfQ9JM73 Lclat1-201ENSMUST00000067545 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
SrfQ9JM73 Zmynd8-220ENSMUST00000170272 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
SrfQ9JM73 Qrsl1-201ENSMUST00000020012 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
SrfQ9JM73 Gm37644-201ENSMUST00000192190 2270 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
SrfQ9JM73 Gm14005-210ENSMUST00000225087 1413 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
SrfQ9JM73 Specc1-212ENSMUST00000202178 2932 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
SrfQ9JM73 Tpd52l2-202ENSMUST00000069712 1799 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
SrfQ9JM73 Grid2ip-203ENSMUST00000120825 3865 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
SrfQ9JM73 Ss18-202ENSMUST00000040964 4153 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
SrfQ9JM73 Gcfc2-201ENSMUST00000043195 4192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
SrfQ9JM73 Pik3cd-206ENSMUST00000122059 4832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
SrfQ9JM73 Hacd2-201ENSMUST00000061156 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
SrfQ9JM73 Sh3bp2-202ENSMUST00000101316 3031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
SrfQ9JM73 2900089D17Rik-201ENSMUST00000124015 2475 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
SrfQ9JM73 Lonp2-207ENSMUST00000163987 1556 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
SrfQ9JM73 M6pr-201ENSMUST00000007602 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
SrfQ9JM73 Lcp2-202ENSMUST00000109329 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
SrfQ9JM73 Fam107b-202ENSMUST00000115052 861 ntTSL 3 BASIC10.75□□□□□ -0.69
SrfQ9JM73 Gm1826-201ENSMUST00000118646 1162 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
SrfQ9JM73 Sval2-203ENSMUST00000120605 497 ntTSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
SrfQ9JM73 Gm5392-201ENSMUST00000122189 789 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
SrfQ9JM73 Gm13625-201ENSMUST00000149283 480 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
SrfQ9JM73 Gm11642-201ENSMUST00000150442 440 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
SrfQ9JM73 Ptges3-ps-201ENSMUST00000160012 480 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
SrfQ9JM73 Gm5916-201ENSMUST00000168452 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
SrfQ9JM73 Gm27956-201ENSMUST00000175604 260 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
SrfQ9JM73 1700084F23Rik-202ENSMUST00000188461 747 ntTSL 3 BASIC10.75□□□□□ -0.69
SrfQ9JM73 Gm38133-201ENSMUST00000195109 815 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
SrfQ9JM73 BB187690-201ENSMUST00000198619 1176 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
SrfQ9JM73 Gm5340-201ENSMUST00000203733 880 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
SrfQ9JM73 Gm45572-201ENSMUST00000211774 750 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
SrfQ9JM73 Gm4657-201ENSMUST00000213839 787 ntTSL 3 BASIC10.75□□□□□ -0.69
SrfQ9JM73 Akr1c18-201ENSMUST00000021635 1200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
SrfQ9JM73 AC153816.1-201ENSMUST00000217870 764 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
SrfQ9JM73 AC159293.2-201ENSMUST00000222289 424 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
SrfQ9JM73 Lsm3-201ENSMUST00000040607 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
SrfQ9JM73 Catsperz-201ENSMUST00000057716 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
SrfQ9JM73 Try5-201ENSMUST00000064324 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
SrfQ9JM73 Ttyh1-202ENSMUST00000079415 2882 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
SrfQ9JM73 Fam161a-203ENSMUST00000109557 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
SrfQ9JM73 Gm37014-201ENSMUST00000194723 2253 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
SrfQ9JM73 Gm44740-201ENSMUST00000205603 1614 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
SrfQ9JM73 Nrg1-206ENSMUST00000208205 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
SrfQ9JM73 Gm13404-201ENSMUST00000156633 1960 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
SrfQ9JM73 Llgl2-212ENSMUST00000177736 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
SrfQ9JM73 Srrt-209ENSMUST00000197466 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
SrfQ9JM73 Srrt-212ENSMUST00000199243 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
SrfQ9JM73 Calm1-201ENSMUST00000001204 3987 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 80.5 ms