Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLF7

Tlr5, Toll-like receptor 5, mousemouse

Predictions only

Length 859 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tlr5Q9JLF7 Acsbg1-201ENSMUST00000034822 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Tlr5Q9JLF7 Camk1g-201ENSMUST00000016323 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Tlr5Q9JLF7 Mrpl55-205ENSMUST00000108787 718 ntTSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
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Tlr5Q9JLF7 Gm13937-201ENSMUST00000121000 988 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Tlr5Q9JLF7 Gm11952-201ENSMUST00000121172 821 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Tlr5Q9JLF7 2210406O10Rik-203ENSMUST00000149687 1198 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
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Tlr5Q9JLF7 4930535L15Rik-201ENSMUST00000175891 536 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Tlr5Q9JLF7 9530062K07Rik-201ENSMUST00000203332 787 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Tlr5Q9JLF7 Gm44698-201ENSMUST00000207382 384 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Tlr5Q9JLF7 4933402C05Rik-201ENSMUST00000208189 1035 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
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Tlr5Q9JLF7 Sdf2-201ENSMUST00000002133 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
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Tlr5Q9JLF7 Cd7-201ENSMUST00000026159 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Tlr5Q9JLF7 Tnfsf9-201ENSMUST00000039490 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Tlr5Q9JLF7 Tdpoz3-201ENSMUST00000081780 1098 ntAPPRIS P1 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Tlr5Q9JLF7 Olfr553-201ENSMUST00000098222 981 ntAPPRIS P1 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Tlr5Q9JLF7 Myo18a-205ENSMUST00000100794 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
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Tlr5Q9JLF7 C030037D09Rik-203ENSMUST00000138007 3220 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
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Tlr5Q9JLF7 Slc38a3-202ENSMUST00000167868 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Tlr5Q9JLF7 Atad2-201ENSMUST00000038194 5684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Tlr5Q9JLF7 Fzd4-201ENSMUST00000058755 6720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Tlr5Q9JLF7 Adck1-201ENSMUST00000101165 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Tlr5Q9JLF7 Kdelc1-201ENSMUST00000027213 1765 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Tlr5Q9JLF7 Epb41l2-204ENSMUST00000217929 3621 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Tlr5Q9JLF7 Dlec1-206ENSMUST00000140326 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Tlr5Q9JLF7 Gfra1-209ENSMUST00000169850 3224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Tlr5Q9JLF7 Cntnap1-201ENSMUST00000103109 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Tlr5Q9JLF7 Dna2-203ENSMUST00000131422 4122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
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Tlr5Q9JLF7 Tnip1-201ENSMUST00000018482 2810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Tlr5Q9JLF7 Angel1-201ENSMUST00000021682 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Tlr5Q9JLF7 Ccdc42os-201ENSMUST00000148019 1335 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
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Tlr5Q9JLF7 1500004A13Rik-209ENSMUST00000185189 1659 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Tlr5Q9JLF7 Ift88-201ENSMUST00000122063 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
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Tlr5Q9JLF7 Clu-201ENSMUST00000022616 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Tlr5Q9JLF7 Slc25a51-201ENSMUST00000107796 4433 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
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Tlr5Q9JLF7 Prss57-203ENSMUST00000169684 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
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Tlr5Q9JLF7 Gm17115-201ENSMUST00000164075 885 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
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Tlr5Q9JLF7 Gm10436-202ENSMUST00000220521 1788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Tlr5Q9JLF7 Rbm8a-203ENSMUST00000198027 2757 ntTSL 3 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Tlr5Q9JLF7 Colec11-201ENSMUST00000036136 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Tlr5Q9JLF7 Mpl-202ENSMUST00000102671 2934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
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Tlr5Q9JLF7 Fubp1-209ENSMUST00000198227 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Tlr5Q9JLF7 Tmem246-201ENSMUST00000042750 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Tlr5Q9JLF7 Tulp2-202ENSMUST00000085331 1525 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Tlr5Q9JLF7 Speg-201ENSMUST00000087122 10801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Tlr5Q9JLF7 Tfrc-201ENSMUST00000023486 4890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Tlr5Q9JLF7 Gm6559-201ENSMUST00000204678 1694 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Tlr5Q9JLF7 Src-204ENSMUST00000109531 3586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
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Tlr5Q9JLF7 Dennd4a-201ENSMUST00000038890 8645 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Tlr5Q9JLF7 Gpr26-201ENSMUST00000045840 11571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Tlr5Q9JLF7 A530032D15Rik-201ENSMUST00000160792 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Tlr5Q9JLF7 4933406M09Rik-201ENSMUST00000162187 1768 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Tlr5Q9JLF7 Ift140-201ENSMUST00000024983 5489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Tlr5Q9JLF7 Satb2-205ENSMUST00000177424 4694 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Tlr5Q9JLF7 Ttbk2-202ENSMUST00000057135 11066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
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