Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKP7

Pole3, DNA polymerase epsilon subunit 3, mousemouse

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Length 145 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pole3Q9JKP7 Heatr6-201ENSMUST00000001002 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Pole3Q9JKP7 Arfgef3-201ENSMUST00000019999 5606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Pole3Q9JKP7 Fer1l5-202ENSMUST00000179162 6315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Pole3Q9JKP7 Spag16-202ENSMUST00000113940 3559 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Pole3Q9JKP7 3830406C13Rik-209ENSMUST00000224389 2444 ntAPPRIS P1 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Pole3Q9JKP7 Gm23200-201ENSMUST00000104379 132 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Pole3Q9JKP7 Tmem50a-202ENSMUST00000105863 719 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Pole3Q9JKP7 Fam71e1-201ENSMUST00000107927 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Pole3Q9JKP7 Eef1d-207ENSMUST00000116440 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Pole3Q9JKP7 2900011O08Rik-202ENSMUST00000118412 954 ntTSL 3 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Pole3Q9JKP7 Gm16341-201ENSMUST00000126385 377 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Pole3Q9JKP7 Tctex1d1-205ENSMUST00000140654 891 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Pole3Q9JKP7 Gm53-203ENSMUST00000143887 757 ntTSL 3 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Pole3Q9JKP7 Gm3948-201ENSMUST00000147795 421 ntTSL 3 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Pole3Q9JKP7 Gm13115-201ENSMUST00000156438 620 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Pole3Q9JKP7 Tmem267-202ENSMUST00000176171 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Pole3Q9JKP7 Gm17087-201ENSMUST00000184183 471 ntAPPRIS P1 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Pole3Q9JKP7 Gm37695-201ENSMUST00000191765 530 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Pole3Q9JKP7 Gm38319-201ENSMUST00000194537 1266 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Pole3Q9JKP7 Gm43349-201ENSMUST00000200047 503 ntTSL 2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Pole3Q9JKP7 Spata33-205ENSMUST00000212523 486 ntTSL 3 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Pole3Q9JKP7 AC102569.1-201ENSMUST00000221563 685 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Pole3Q9JKP7 Tube1-201ENSMUST00000019991 2929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Pole3Q9JKP7 Sept9-205ENSMUST00000106354 3869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Pole3Q9JKP7 Rxfp2-206ENSMUST00000201612 2470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Pole3Q9JKP7 Zzef1-207ENSMUST00000172220 11249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Pole3Q9JKP7 Ncdn-201ENSMUST00000030637 3681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Pole3Q9JKP7 Cd163-201ENSMUST00000032234 4404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Pole3Q9JKP7 Gm45501-201ENSMUST00000211468 2526 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Pole3Q9JKP7 AC079680.2-201ENSMUST00000219181 1306 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Pole3Q9JKP7 4930528D03Rik-203ENSMUST00000225577 1348 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Pole3Q9JKP7 Cfb-202ENSMUST00000128767 2751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Pole3Q9JKP7 Rbm8a-203ENSMUST00000198027 2757 ntTSL 3 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Pole3Q9JKP7 Gm45828-201ENSMUST00000206938 1836 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Pole3Q9JKP7 Tmem33-201ENSMUST00000037918 6247 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Pole3Q9JKP7 Fam53c-202ENSMUST00000097622 4256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Pole3Q9JKP7 Tram2-201ENSMUST00000037998 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Pole3Q9JKP7 Chrne-201ENSMUST00000014753 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Pole3Q9JKP7 Gm10681-202ENSMUST00000178221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Pole3Q9JKP7 Mad1l1-201ENSMUST00000031534 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Pole3Q9JKP7 Slc1a2-201ENSMUST00000005220 2127 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Pole3Q9JKP7 Mcm2-201ENSMUST00000058011 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Pole3Q9JKP7 Clcn3-202ENSMUST00000056508 5684 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Pole3Q9JKP7 Atp4a-204ENSMUST00000170371 3447 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Pole3Q9JKP7 Stx7-205ENSMUST00000220041 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Pole3Q9JKP7 Lrrc8b-201ENSMUST00000112707 6726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Pole3Q9JKP7 Inpp4a-208ENSMUST00000137266 2934 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Pole3Q9JKP7 Aff1-202ENSMUST00000054979 8323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Pole3Q9JKP7 Acsl6-208ENSMUST00000108899 1662 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Pole3Q9JKP7 Tia1-211ENSMUST00000130967 1445 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Pole3Q9JKP7 F10-205ENSMUST00000152034 1449 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Pole3Q9JKP7 Cyp26b1-205ENSMUST00000205228 4288 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Pole3Q9JKP7 Dab2-211ENSMUST00000161812 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Pole3Q9JKP7 Slc6a5-202ENSMUST00000107605 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Pole3Q9JKP7 Csnk1a1-204ENSMUST00000165123 4083 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Pole3Q9JKP7 Pde4b-203ENSMUST00000097950 2756 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Pole3Q9JKP7 Ppargc1b-201ENSMUST00000063307 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Pole3Q9JKP7 Gm37333-201ENSMUST00000192904 2251 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Pole3Q9JKP7 Adcyap1r1-204ENSMUST00000165857 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Pole3Q9JKP7 Wdr62-201ENSMUST00000108190 4742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Pole3Q9JKP7 Pck1-201ENSMUST00000029017 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Pole3Q9JKP7 Gm22920-201ENSMUST00000102175 109 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Pole3Q9JKP7 Mdh1-201ENSMUST00000102874 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Pole3Q9JKP7 Gm11568-201ENSMUST00000107434 1145 ntAPPRIS P1 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Pole3Q9JKP7 Gm22711-201ENSMUST00000116890 133 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Pole3Q9JKP7 Gm15617-201ENSMUST00000118973 771 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Pole3Q9JKP7 Vmn1r-ps104-201ENSMUST00000120960 771 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Pole3Q9JKP7 Cdpf1-205ENSMUST00000150995 566 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Pole3Q9JKP7 Olfml3-204ENSMUST00000169286 874 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Pole3Q9JKP7 U2af1l4-234ENSMUST00000171850 564 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Pole3Q9JKP7 Gm7741-201ENSMUST00000181445 989 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Pole3Q9JKP7 Pcdhga1-201ENSMUST00000194190 4692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Pole3Q9JKP7 Gm43692-201ENSMUST00000198236 1062 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Pole3Q9JKP7 Gm9353-201ENSMUST00000200472 604 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Pole3Q9JKP7 1700003I16Rik-201ENSMUST00000205198 1058 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Pole3Q9JKP7 Saa2-202ENSMUST00000210272 511 ntTSL 3 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Pole3Q9JKP7 Proz-203ENSMUST00000211363 984 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Pole3Q9JKP7 Gm19208-201ENSMUST00000213861 912 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Pole3Q9JKP7 AC141438.2-201ENSMUST00000215068 271 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Pole3Q9JKP7 4833405L11Rik-202ENSMUST00000222639 2145 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Pole3Q9JKP7 Prorsd1-201ENSMUST00000039900 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Pole3Q9JKP7 Rpl10a-ps2-201ENSMUST00000071184 642 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Pole3Q9JKP7 Rpl34-202ENSMUST00000079085 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Pole3Q9JKP7 Krtap19-1-201ENSMUST00000081334 493 ntAPPRIS P1 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Pole3Q9JKP7 Kng2-203ENSMUST00000115349 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Pole3Q9JKP7 Ankrd55-202ENSMUST00000056047 1556 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Pole3Q9JKP7 Morc2a-201ENSMUST00000093389 5085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Pole3Q9JKP7 Sparcl1-201ENSMUST00000031249 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Pole3Q9JKP7 Exoc3l4-201ENSMUST00000072646 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Pole3Q9JKP7 Gm45576-201ENSMUST00000210981 1322 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Pole3Q9JKP7 Gm5833-202ENSMUST00000190707 1932 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Pole3Q9JKP7 Rps6ka1-209ENSMUST00000174481 2228 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Pole3Q9JKP7 Gimap8-202ENSMUST00000203083 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Pole3Q9JKP7 Flot2-202ENSMUST00000073660 2568 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Pole3Q9JKP7 Sult1a1-201ENSMUST00000106371 1370 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Pole3Q9JKP7 Sult1a1-202ENSMUST00000106372 1369 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Pole3Q9JKP7 Ank1-206ENSMUST00000117662 6257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Pole3Q9JKP7 Plxnb3-201ENSMUST00000002079 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Pole3Q9JKP7 Kif1a-204ENSMUST00000171796 8206 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Pole3Q9JKP7 Kcnmb3-201ENSMUST00000164954 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.8 ms