Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIM3

Ercc6l2, DNA excision repair protein ERCC-6-like 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,537 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ercc6l2Q9JIM3 Glns-ps1-201ENSMUST00000120291 1118 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Ercc6l2Q9JIM3 Gm12136-201ENSMUST00000120460 1209 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Ercc6l2Q9JIM3 Pard3bos3-201ENSMUST00000147177 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ercc6l2Q9JIM3 Psd3-211ENSMUST00000178529 828 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ercc6l2Q9JIM3 Snrp1c-ps1-201ENSMUST00000205464 474 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Ercc6l2Q9JIM3 Gm5668-201ENSMUST00000220897 436 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Ercc6l2Q9JIM3 Cdca8-201ENSMUST00000030690 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ercc6l2Q9JIM3 Stpg4-201ENSMUST00000040609 847 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ercc6l2Q9JIM3 Lao1-201ENSMUST00000058651 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ercc6l2Q9JIM3 E330021D16Rik-201ENSMUST00000058713 1116 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ercc6l2Q9JIM3 Klra9-201ENSMUST00000071554 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ercc6l2Q9JIM3 Cplx3-201ENSMUST00000045068 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ercc6l2Q9JIM3 Otop1-202ENSMUST00000114099 3141 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ercc6l2Q9JIM3 Wdr89-201ENSMUST00000062370 2979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ercc6l2Q9JIM3 Ppnr-201ENSMUST00000190974 3525 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ercc6l2Q9JIM3 9530077C05Rik-201ENSMUST00000058868 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ercc6l2Q9JIM3 Gm27194-201ENSMUST00000175753 2936 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Ercc6l2Q9JIM3 Cpeb1-209ENSMUST00000178892 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ercc6l2Q9JIM3 Rgs9-204ENSMUST00000106706 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ercc6l2Q9JIM3 Abcc9-205ENSMUST00000204870 1458 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ercc6l2Q9JIM3 Oxr1-203ENSMUST00000090096 4515 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ercc6l2Q9JIM3 Hibch-202ENSMUST00000159352 1704 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ercc6l2Q9JIM3 Dctn1-205ENSMUST00000113919 4292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ercc6l2Q9JIM3 Actn1-201ENSMUST00000021554 3734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ercc6l2Q9JIM3 Il24-201ENSMUST00000121040 1159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ercc6l2Q9JIM3 Gm12962-201ENSMUST00000138697 580 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ercc6l2Q9JIM3 Optc-204ENSMUST00000149380 1180 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ercc6l2Q9JIM3 Gm16334-201ENSMUST00000159488 694 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ercc6l2Q9JIM3 Gm9513-201ENSMUST00000165591 306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ercc6l2Q9JIM3 1700034B16Rik-201ENSMUST00000180957 722 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ercc6l2Q9JIM3 Gm9553-201ENSMUST00000185703 996 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Ercc6l2Q9JIM3 Gm7516-201ENSMUST00000186198 706 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Ercc6l2Q9JIM3 1700030N03Rik-206ENSMUST00000191405 651 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ercc6l2Q9JIM3 9230114K14Rik-202ENSMUST00000198720 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ercc6l2Q9JIM3 Gm44753-202ENSMUST00000208297 562 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ercc6l2Q9JIM3 6430531B16Rik-205ENSMUST00000210254 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ercc6l2Q9JIM3 Gm18749-201ENSMUST00000222410 692 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Ercc6l2Q9JIM3 Olfr56-202ENSMUST00000102785 1930 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ercc6l2Q9JIM3 Olfr56-203ENSMUST00000179282 1935 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ercc6l2Q9JIM3 Taf1c-201ENSMUST00000093099 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ercc6l2Q9JIM3 Phactr3-203ENSMUST00000108915 2694 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ercc6l2Q9JIM3 Fstl5-201ENSMUST00000038364 5107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ercc6l2Q9JIM3 Reps1-210ENSMUST00000164556 2537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ercc6l2Q9JIM3 Anxa8-201ENSMUST00000022519 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ercc6l2Q9JIM3 Fam83a-202ENSMUST00000160942 2876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ercc6l2Q9JIM3 Slc4a2-202ENSMUST00000115047 4264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ercc6l2Q9JIM3 Slc13a5-205ENSMUST00000208056 3111 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ercc6l2Q9JIM3 Atxn2l-201ENSMUST00000040202 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ercc6l2Q9JIM3 Dlg4-201ENSMUST00000018700 3204 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ercc6l2Q9JIM3 AC125487.1-201ENSMUST00000217888 1300 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Ercc6l2Q9JIM3 Naa50-201ENSMUST00000063520 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ercc6l2Q9JIM3 Trib1-201ENSMUST00000067543 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ercc6l2Q9JIM3 Unc5b-203ENSMUST00000218637 3653 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ercc6l2Q9JIM3 Gm37324-201ENSMUST00000194500 4504 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Ercc6l2Q9JIM3 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ercc6l2Q9JIM3 5930420M18Rik-201ENSMUST00000202893 2281 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Ercc6l2Q9JIM3 Atp6v0e2-201ENSMUST00000040361 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ercc6l2Q9JIM3 Scarf1-201ENSMUST00000042808 2887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ercc6l2Q9JIM3 Papss1-205ENSMUST00000199878 2648 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ercc6l2Q9JIM3 Apoo-201ENSMUST00000113895 1173 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ercc6l2Q9JIM3 Ucma-202ENSMUST00000115010 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ercc6l2Q9JIM3 Ppil2-202ENSMUST00000115719 838 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ercc6l2Q9JIM3 Gm15363-201ENSMUST00000118897 631 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Ercc6l2Q9JIM3 Gm12950-201ENSMUST00000121683 417 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Ercc6l2Q9JIM3 Fam229b-208ENSMUST00000139743 679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ercc6l2Q9JIM3 Gm25426-201ENSMUST00000157606 170 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Ercc6l2Q9JIM3 Gm16470-201ENSMUST00000182456 998 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Ercc6l2Q9JIM3 Trav18-202ENSMUST00000186573 325 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ercc6l2Q9JIM3 Msra-204ENSMUST00000210363 1042 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ercc6l2Q9JIM3 Ccdc153-206ENSMUST00000216632 800 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ercc6l2Q9JIM3 Fabp5-201ENSMUST00000029046 987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ercc6l2Q9JIM3 Eya2-201ENSMUST00000063433 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ercc6l2Q9JIM3 Nup62cl-201ENSMUST00000101212 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ercc6l2Q9JIM3 Ankfn1-201ENSMUST00000050983 2665 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ercc6l2Q9JIM3 Lef1-202ENSMUST00000066849 3398 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ercc6l2Q9JIM3 Wwp2-204ENSMUST00000212205 2758 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ercc6l2Q9JIM3 Grm4-202ENSMUST00000118489 2976 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ercc6l2Q9JIM3 Rbm10-202ENSMUST00000082089 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ercc6l2Q9JIM3 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ercc6l2Q9JIM3 Fcer2a-201ENSMUST00000005678 2242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ercc6l2Q9JIM3 Slc39a3-205ENSMUST00000168076 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ercc6l2Q9JIM3 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ercc6l2Q9JIM3 Hspb7-201ENSMUST00000102486 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ercc6l2Q9JIM3 Dnaic2-202ENSMUST00000092469 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ercc6l2Q9JIM3 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ercc6l2Q9JIM3 Prkcsh-202ENSMUST00000115331 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ercc6l2Q9JIM3 Tsga10-208ENSMUST00000193669 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ercc6l2Q9JIM3 Foxb1-201ENSMUST00000071281 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ercc6l2Q9JIM3 Slc7a4-207ENSMUST00000172164 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ercc6l2Q9JIM3 3110039M20Rik-201ENSMUST00000127041 868 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ercc6l2Q9JIM3 Gm37988-201ENSMUST00000155020 825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ercc6l2Q9JIM3 Gm16755-201ENSMUST00000180595 933 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ercc6l2Q9JIM3 Gm43097-201ENSMUST00000196867 151 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Ercc6l2Q9JIM3 Hcst-203ENSMUST00000208740 366 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ercc6l2Q9JIM3 AC129590.1-201ENSMUST00000225573 852 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Ercc6l2Q9JIM3 Elfn1-201ENSMUST00000050519 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ercc6l2Q9JIM3 Olfr578-201ENSMUST00000056235 942 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ercc6l2Q9JIM3 Cyb5rl-201ENSMUST00000030364 2360 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ercc6l2Q9JIM3 Hmx2-201ENSMUST00000051997 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ercc6l2Q9JIM3 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.5 ms