Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESF1

Otof, Otoferlin, mousemouse

Predictions only

Length 1,997 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OtofQ9ESF1 Zmym4-201ENSMUST00000106108 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
OtofQ9ESF1 Kcnk10-201ENSMUST00000110113 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
OtofQ9ESF1 Far2-201ENSMUST00000032443 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
OtofQ9ESF1 Snx27-208ENSMUST00000200642 1308 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
OtofQ9ESF1 Agbl4-202ENSMUST00000097920 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
OtofQ9ESF1 Kifc5b-201ENSMUST00000078961 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
OtofQ9ESF1 Fbxo28-201ENSMUST00000051431 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
OtofQ9ESF1 Fas-202ENSMUST00000112472 555 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
OtofQ9ESF1 Ifitm7-201ENSMUST00000117803 853 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
OtofQ9ESF1 Gm12950-201ENSMUST00000121683 417 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
OtofQ9ESF1 4930502E09Rik-201ENSMUST00000126016 755 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
OtofQ9ESF1 Ndufb5-204ENSMUST00000127477 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
OtofQ9ESF1 Gm12426-201ENSMUST00000153083 371 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
OtofQ9ESF1 Gm4858-201ENSMUST00000179064 735 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
OtofQ9ESF1 Xpnpep1-211ENSMUST00000183274 2120 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
OtofQ9ESF1 Gm18001-201ENSMUST00000212023 688 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
OtofQ9ESF1 Gm12216-207ENSMUST00000220191 1073 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
OtofQ9ESF1 Elfn1-201ENSMUST00000050519 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
OtofQ9ESF1 Olfr63-201ENSMUST00000067840 955 ntAPPRIS P1 BASIC10.96□□□□□ -0.65
OtofQ9ESF1 Taar5-201ENSMUST00000092659 1014 ntAPPRIS P1 BASIC10.96□□□□□ -0.65
OtofQ9ESF1 Gm15541-201ENSMUST00000147449 2713 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
OtofQ9ESF1 Pdcl-202ENSMUST00000112940 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
OtofQ9ESF1 Zfhx2os-202ENSMUST00000183750 4375 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
OtofQ9ESF1 Enpp7-201ENSMUST00000092373 1370 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.65
OtofQ9ESF1 Lrrc36-201ENSMUST00000067305 2082 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
OtofQ9ESF1 Cd19-201ENSMUST00000032968 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
OtofQ9ESF1 Synpo-211ENSMUST00000155195 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
OtofQ9ESF1 Usp20-211ENSMUST00000170476 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
OtofQ9ESF1 Zscan10-205ENSMUST00000120967 2609 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
OtofQ9ESF1 Tmem151a-201ENSMUST00000077066 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
OtofQ9ESF1 Parp9-203ENSMUST00000114878 3548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
OtofQ9ESF1 Tbp-203ENSMUST00000118001 1652 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
OtofQ9ESF1 Tbc1d14-204ENSMUST00000130417 2665 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.66
OtofQ9ESF1 Kansl3-201ENSMUST00000010597 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
OtofQ9ESF1 Gm26908-201ENSMUST00000181856 1637 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
OtofQ9ESF1 AC151836.1-201ENSMUST00000228730 1637 ntBASIC10.96□□□□□ -0.66
OtofQ9ESF1 Prkcd-201ENSMUST00000022521 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
OtofQ9ESF1 Gm37452-201ENSMUST00000194416 1160 ntBASIC10.96□□□□□ -0.66
OtofQ9ESF1 Gm43778-201ENSMUST00000199438 199 ntBASIC10.96□□□□□ -0.66
OtofQ9ESF1 Gm19640-201ENSMUST00000214849 464 ntBASIC10.96□□□□□ -0.66
OtofQ9ESF1 B230303A05Rik-204ENSMUST00000223006 748 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
OtofQ9ESF1 AC158986.2-201ENSMUST00000227487 618 ntBASIC10.96□□□□□ -0.66
OtofQ9ESF1 AC154806.7-201ENSMUST00000227998 202 ntBASIC10.96□□□□□ -0.66
OtofQ9ESF1 Slx4ip-201ENSMUST00000028737 2556 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
OtofQ9ESF1 Olfr1495-202ENSMUST00000215930 2025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
OtofQ9ESF1 Ccm2-202ENSMUST00000109721 1551 ntTSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
OtofQ9ESF1 Tfdp2-204ENSMUST00000179065 2213 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
OtofQ9ESF1 Gm38055-201ENSMUST00000195353 2217 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
OtofQ9ESF1 Acad8-201ENSMUST00000060513 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
OtofQ9ESF1 Ebf3-202ENSMUST00000106118 3736 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
OtofQ9ESF1 Rbm4b-201ENSMUST00000036744 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
OtofQ9ESF1 Gnb1l-204ENSMUST00000115601 3507 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
OtofQ9ESF1 Gm21939-201ENSMUST00000221137 2773 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
OtofQ9ESF1 Gem-202ENSMUST00000108304 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
OtofQ9ESF1 Olfr1428-203ENSMUST00000214103 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
OtofQ9ESF1 Foxp1-221ENSMUST00000176632 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
OtofQ9ESF1 Foxp1-222ENSMUST00000176850 2339 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
OtofQ9ESF1 Fzd6-201ENSMUST00000022906 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
OtofQ9ESF1 Dach2-201ENSMUST00000067219 2520 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
OtofQ9ESF1 Mmd2-201ENSMUST00000037048 3317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
OtofQ9ESF1 Pdzk1ip1-202ENSMUST00000106548 887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
OtofQ9ESF1 Plac8-203ENSMUST00000112910 1224 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
OtofQ9ESF1 Gm26368-201ENSMUST00000157826 118 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
OtofQ9ESF1 Gm24346-201ENSMUST00000158712 194 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
OtofQ9ESF1 Has2os-202ENSMUST00000163314 633 ntTSL 3 BASIC10.95□□□□□ -0.66
OtofQ9ESF1 Gm25998-201ENSMUST00000175397 53 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
OtofQ9ESF1 Gm26906-201ENSMUST00000180523 1228 ntTSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
OtofQ9ESF1 Anapc16-203ENSMUST00000182152 847 ntTSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
OtofQ9ESF1 Mmp7-201ENSMUST00000018767 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
OtofQ9ESF1 Fgfbp1-203ENSMUST00000199894 1228 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.95□□□□□ -0.66
OtofQ9ESF1 Gm6352-201ENSMUST00000203583 1134 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
OtofQ9ESF1 Ormdl2-203ENSMUST00000219215 1051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
OtofQ9ESF1 Rab29-201ENSMUST00000027693 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
OtofQ9ESF1 Nkg7-201ENSMUST00000070518 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
OtofQ9ESF1 Rhox8-201ENSMUST00000071885 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
OtofQ9ESF1 Ccdc153-201ENSMUST00000092426 1087 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
OtofQ9ESF1 Tnk2-205ENSMUST00000115124 4424 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
OtofQ9ESF1 Gm8684-201ENSMUST00000195078 1564 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
OtofQ9ESF1 Pigb-202ENSMUST00000098566 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
OtofQ9ESF1 Mtus2-203ENSMUST00000085558 7543 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
OtofQ9ESF1 Sertm1-201ENSMUST00000070342 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
OtofQ9ESF1 Vmn1r45-201ENSMUST00000054202 3341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
OtofQ9ESF1 Emp1-201ENSMUST00000032330 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
OtofQ9ESF1 Traf7-202ENSMUST00000088464 2504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
OtofQ9ESF1 Dcaf11-203ENSMUST00000117701 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
OtofQ9ESF1 C920021L13Rik-201ENSMUST00000120398 1723 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
OtofQ9ESF1 4930579F01Rik-201ENSMUST00000012186 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
OtofQ9ESF1 Gm38312-201ENSMUST00000195426 1746 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
OtofQ9ESF1 Cyp2j13-202ENSMUST00000097973 1648 ntTSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
OtofQ9ESF1 Megf6-201ENSMUST00000030897 6851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
OtofQ9ESF1 Iba57-201ENSMUST00000054523 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
OtofQ9ESF1 Chpf2-201ENSMUST00000088295 5371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.94□□□□□ -0.66
OtofQ9ESF1 Grin1-205ENSMUST00000114312 3838 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
OtofQ9ESF1 Grin1-207ENSMUST00000114317 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
OtofQ9ESF1 Kdm5b-201ENSMUST00000047714 8714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
OtofQ9ESF1 AC153524.2-202ENSMUST00000220401 1794 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
OtofQ9ESF1 4930517G19Rik-201ENSMUST00000206152 1676 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
OtofQ9ESF1 4933407I05Rik-204ENSMUST00000217562 1561 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
OtofQ9ESF1 Focad-202ENSMUST00000107147 1177 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
OtofQ9ESF1 AC034099.1-202ENSMUST00000133843 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
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