Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0L1

Zbed3, Zinc finger BED domain-containing protein 3, mousemouse

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Length 228 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zbed3Q9D0L1 Gm8876-201ENSMUST00000120768 1122 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Zbed3Q9D0L1 Gm14052-201ENSMUST00000121434 1031 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Zbed3Q9D0L1 Gm45716-201ENSMUST00000124877 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Zbed3Q9D0L1 Apobr-203ENSMUST00000137646 457 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Zbed3Q9D0L1 Mocs2-201ENSMUST00000015680 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Zbed3Q9D0L1 Gm26550-201ENSMUST00000180699 1184 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Zbed3Q9D0L1 1700084F23Rik-202ENSMUST00000188461 747 ntTSL 3 BASIC12.76□□□□□ -0.37
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Zbed3Q9D0L1 Lsm3-205ENSMUST00000206947 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Zbed3Q9D0L1 E230034D01Rik-201ENSMUST00000214440 1212 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Zbed3Q9D0L1 Scgb2b2-201ENSMUST00000038835 520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Zbed3Q9D0L1 Rnasek-201ENSMUST00000040428 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Zbed3Q9D0L1 Prl7b1-201ENSMUST00000080595 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Zbed3Q9D0L1 Olfr553-201ENSMUST00000098222 981 ntAPPRIS P1 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Zbed3Q9D0L1 Rac1-201ENSMUST00000080537 4159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Zbed3Q9D0L1 Bcl2-202ENSMUST00000189999 2841 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Zbed3Q9D0L1 Srp54a-202ENSMUST00000220578 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Zbed3Q9D0L1 Kcnk18-201ENSMUST00000065204 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
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Zbed3Q9D0L1 Dhx57-202ENSMUST00000086555 5077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Zbed3Q9D0L1 Pbx1-205ENSMUST00000176540 6876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Zbed3Q9D0L1 4930579F01Rik-201ENSMUST00000012186 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Zbed3Q9D0L1 Cd247-205ENSMUST00000161559 1816 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Zbed3Q9D0L1 Ctnnal1-201ENSMUST00000045142 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Zbed3Q9D0L1 4930512J16Rik-201ENSMUST00000203704 1859 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Zbed3Q9D0L1 Wbp1l-204ENSMUST00000138302 3900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Zbed3Q9D0L1 AC160410.1-201ENSMUST00000219298 1972 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Zbed3Q9D0L1 Tcn2-207ENSMUST00000109993 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Zbed3Q9D0L1 Kdm5c-203ENSMUST00000112588 6449 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
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Zbed3Q9D0L1 Myh14-203ENSMUST00000107900 6400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
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Zbed3Q9D0L1 Lrp12-201ENSMUST00000022916 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
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Zbed3Q9D0L1 BC052040-201ENSMUST00000110918 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
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Zbed3Q9D0L1 Pml-211ENSMUST00000153820 2652 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
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Zbed3Q9D0L1 Gm45670-201ENSMUST00000211382 711 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
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Zbed3Q9D0L1 Itgal-201ENSMUST00000106306 5195 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Zbed3Q9D0L1 Eif1ax-201ENSMUST00000087143 5172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Zbed3Q9D0L1 Zfp14-201ENSMUST00000077787 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Zbed3Q9D0L1 Trh-201ENSMUST00000006046 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Zbed3Q9D0L1 Prr27-202ENSMUST00000101056 1337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Zbed3Q9D0L1 Prr27-201ENSMUST00000002310 1313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Zbed3Q9D0L1 Samd11-201ENSMUST00000179919 2610 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Zbed3Q9D0L1 Kif28-202ENSMUST00000211943 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Zbed3Q9D0L1 Rnf44-218ENSMUST00000177950 3941 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Zbed3Q9D0L1 Gm23769-201ENSMUST00000104441 121 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Zbed3Q9D0L1 Plekhg5-202ENSMUST00000105661 3842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Zbed3Q9D0L1 Derl2-202ENSMUST00000108523 884 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Zbed3Q9D0L1 Nifk-202ENSMUST00000112688 849 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Zbed3Q9D0L1 Gm8152-201ENSMUST00000120842 637 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Zbed3Q9D0L1 Gm14320-201ENSMUST00000137275 1023 ntTSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Zbed3Q9D0L1 Platr20-202ENSMUST00000143209 937 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Zbed3Q9D0L1 Gm5526-201ENSMUST00000153604 423 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Zbed3Q9D0L1 Gm26368-201ENSMUST00000157826 118 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Zbed3Q9D0L1 Gm4778-202ENSMUST00000159517 1241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Zbed3Q9D0L1 Gm16587-201ENSMUST00000161943 863 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Zbed3Q9D0L1 Gm7445-201ENSMUST00000192115 340 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Zbed3Q9D0L1 Gm37207-201ENSMUST00000194284 296 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Zbed3Q9D0L1 Gm18555-201ENSMUST00000197935 584 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Zbed3Q9D0L1 Gm3289-201ENSMUST00000200819 756 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Zbed3Q9D0L1 Gm5340-201ENSMUST00000203733 880 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Zbed3Q9D0L1 Gm44507-201ENSMUST00000206249 343 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.9 ms