Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWU5

Khdc3, KH domain-containing protein 3, mousemouse

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Length 440 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Khdc3Q9CWU5 Apoe-210ENSMUST00000174710 514 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Khdc3Q9CWU5 H2al1h-201ENSMUST00000177926 318 ntAPPRIS P1 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Khdc3Q9CWU5 H2al1d-201ENSMUST00000178595 318 ntAPPRIS P1 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Khdc3Q9CWU5 Bhmt-ps1-201ENSMUST00000178743 1224 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Khdc3Q9CWU5 H2al1c-201ENSMUST00000178806 318 ntAPPRIS P1 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Khdc3Q9CWU5 H2al1f-201ENSMUST00000179004 318 ntAPPRIS P1 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Khdc3Q9CWU5 Mir7051-201ENSMUST00000184167 73 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Khdc3Q9CWU5 Mrip-ps-201ENSMUST00000184613 940 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Khdc3Q9CWU5 Gm29264-201ENSMUST00000191240 1264 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Khdc3Q9CWU5 Gm43058-201ENSMUST00000197645 625 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Khdc3Q9CWU5 Gm35549-201ENSMUST00000203176 735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Khdc3Q9CWU5 Gm43916-201ENSMUST00000205062 967 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Khdc3Q9CWU5 Gng8-204ENSMUST00000205716 432 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Khdc3Q9CWU5 Net1-206ENSMUST00000222504 447 ntTSL 3 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Khdc3Q9CWU5 AC122350.1-201ENSMUST00000228135 533 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Khdc3Q9CWU5 Pgpep1l-201ENSMUST00000032770 953 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Khdc3Q9CWU5 Il17c-201ENSMUST00000050963 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Khdc3Q9CWU5 Cthrc1-201ENSMUST00000067072 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Khdc3Q9CWU5 Gm10775-201ENSMUST00000099425 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Khdc3Q9CWU5 Vgll4-201ENSMUST00000032459 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Khdc3Q9CWU5 Calcoco1-204ENSMUST00000171838 2968 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Khdc3Q9CWU5 Rbm39-201ENSMUST00000029149 2711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Khdc3Q9CWU5 Dcun1d2-201ENSMUST00000045366 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Khdc3Q9CWU5 Gm5860-202ENSMUST00000151038 1711 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Khdc3Q9CWU5 1110051M20Rik-202ENSMUST00000094835 1498 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Khdc3Q9CWU5 Elf2-206ENSMUST00000163748 2656 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Khdc3Q9CWU5 Pip5k1a-206ENSMUST00000107236 3618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Khdc3Q9CWU5 Radil-203ENSMUST00000110784 3106 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Khdc3Q9CWU5 Zswim9-203ENSMUST00000119558 3111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Khdc3Q9CWU5 Zfat-205ENSMUST00000162173 3561 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Khdc3Q9CWU5 Polq-202ENSMUST00000071452 7290 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Khdc3Q9CWU5 Hpcal4-201ENSMUST00000059667 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Khdc3Q9CWU5 Alas2-202ENSMUST00000112715 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Khdc3Q9CWU5 Pip5k1b-201ENSMUST00000025800 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Khdc3Q9CWU5 Slc25a51-201ENSMUST00000107796 4433 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Khdc3Q9CWU5 Anxa11-202ENSMUST00000112364 1625 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Khdc3Q9CWU5 Pak7-201ENSMUST00000035264 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Khdc3Q9CWU5 Rufy2-202ENSMUST00000119567 4130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Khdc3Q9CWU5 Zcchc4-201ENSMUST00000031077 5743 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Khdc3Q9CWU5 Pou6f1-204ENSMUST00000176271 4575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Khdc3Q9CWU5 Parp11-202ENSMUST00000112191 3414 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Khdc3Q9CWU5 Gm12198-201ENSMUST00000154068 1809 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Khdc3Q9CWU5 Mybph-201ENSMUST00000038445 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Khdc3Q9CWU5 Gm45206-201ENSMUST00000206885 2285 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Khdc3Q9CWU5 Tceanc-202ENSMUST00000112188 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Khdc3Q9CWU5 Itgal-204ENSMUST00000120857 4533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Khdc3Q9CWU5 Faim2-201ENSMUST00000023750 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Khdc3Q9CWU5 Nhsl1-202ENSMUST00000100054 6795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Khdc3Q9CWU5 Etfbkmt-209ENSMUST00000179873 1576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Khdc3Q9CWU5 Gm44153-201ENSMUST00000204162 1580 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Khdc3Q9CWU5 Ccnt2-201ENSMUST00000027587 6738 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Khdc3Q9CWU5 Lrrc74b-203ENSMUST00000100123 2231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Khdc3Q9CWU5 Sertad3-201ENSMUST00000068641 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Khdc3Q9CWU5 Mybpc3-203ENSMUST00000169776 4163 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Khdc3Q9CWU5 Flna-202ENSMUST00000101454 8345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Khdc3Q9CWU5 Tmem140-201ENSMUST00000074949 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Khdc3Q9CWU5 Tmem8b-209ENSMUST00000167153 4101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Khdc3Q9CWU5 Dopey2-201ENSMUST00000045004 7319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Khdc3Q9CWU5 Cstad-201ENSMUST00000102853 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Khdc3Q9CWU5 Gm13408-201ENSMUST00000119822 798 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Khdc3Q9CWU5 Gm13935-201ENSMUST00000121859 798 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Khdc3Q9CWU5 1700084C06Rik-201ENSMUST00000135674 750 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Khdc3Q9CWU5 Gm15412-201ENSMUST00000137193 1096 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Khdc3Q9CWU5 2610005L07Rik-201ENSMUST00000139264 948 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Khdc3Q9CWU5 Rpl9-ps7-201ENSMUST00000140507 579 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Khdc3Q9CWU5 Gm24992-201ENSMUST00000157412 130 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Khdc3Q9CWU5 Cryge-202ENSMUST00000161960 690 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Khdc3Q9CWU5 Gm21092-201ENSMUST00000178995 955 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Khdc3Q9CWU5 1600010M07Rik-202ENSMUST00000188662 654 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Khdc3Q9CWU5 Gm28694-201ENSMUST00000190681 722 ntTSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Khdc3Q9CWU5 Gm29067-201ENSMUST00000190821 470 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Khdc3Q9CWU5 Sox2ot-217ENSMUST00000200414 710 ntTSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Khdc3Q9CWU5 4933424G06Rik-204ENSMUST00000208994 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Khdc3Q9CWU5 Nt5dc1-206ENSMUST00000213269 802 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Khdc3Q9CWU5 AC141438.2-201ENSMUST00000215068 271 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Khdc3Q9CWU5 Ddo-207ENSMUST00000216830 806 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Khdc3Q9CWU5 Gm4797-201ENSMUST00000219075 1283 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Khdc3Q9CWU5 Csrp2-203ENSMUST00000219502 544 ntTSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Khdc3Q9CWU5 Gm5468-202ENSMUST00000227851 682 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Khdc3Q9CWU5 Tmem231-201ENSMUST00000034429 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Khdc3Q9CWU5 Fpr-rs3-201ENSMUST00000071189 1032 ntAPPRIS P1 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Khdc3Q9CWU5 Rpl9-ps4-201ENSMUST00000075549 579 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Khdc3Q9CWU5 Gm5451-201ENSMUST00000080545 579 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Khdc3Q9CWU5 Slc38a3-202ENSMUST00000167868 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Khdc3Q9CWU5 Mgat5-201ENSMUST00000038361 8436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Khdc3Q9CWU5 Cacna1c-210ENSMUST00000187474 6911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Khdc3Q9CWU5 Pax5-203ENSMUST00000107825 1445 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Khdc3Q9CWU5 Tcf7l2-207ENSMUST00000111653 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.71
Khdc3Q9CWU5 Gm10686-201ENSMUST00000215389 3247 ntBASIC10.65□□□□□ -0.71
Khdc3Q9CWU5 Styx-205ENSMUST00000226873 12974 ntAPPRIS P1 BASIC10.65□□□□□ -0.71
Khdc3Q9CWU5 Sdccag8-201ENSMUST00000027785 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Khdc3Q9CWU5 Tmem109-201ENSMUST00000038128 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Khdc3Q9CWU5 Lyplal1-201ENSMUST00000045388 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Khdc3Q9CWU5 Lrrc61-201ENSMUST00000101436 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Khdc3Q9CWU5 Syncrip-208ENSMUST00000174282 3404 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Khdc3Q9CWU5 Gm37368-201ENSMUST00000193173 3212 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Khdc3Q9CWU5 Gm9387-201ENSMUST00000098624 1320 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Khdc3Q9CWU5 Kalrn-205ENSMUST00000114953 4722 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Khdc3Q9CWU5 Rpap1-201ENSMUST00000048493 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Khdc3Q9CWU5 Cnot8-202ENSMUST00000108843 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
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