Protein–RNA interactions for Protein: Q99KL7

Rab28, Ras-related protein Rab-28, mousemouse

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Length 221 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab28Q99KL7 Gtf3c2-201ENSMUST00000088010 4552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rab28Q99KL7 Elovl7-201ENSMUST00000022207 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rab28Q99KL7 Aff3-203ENSMUST00000095027 5857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rab28Q99KL7 Smg6-201ENSMUST00000045281 5848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rab28Q99KL7 Fam172a-201ENSMUST00000091459 3892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rab28Q99KL7 Fosb-201ENSMUST00000003640 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rab28Q99KL7 Gm21759-201ENSMUST00000178345 1828 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Rab28Q99KL7 Ntrk2-201ENSMUST00000079828 8744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rab28Q99KL7 Ccnt2-201ENSMUST00000027587 6738 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rab28Q99KL7 Stk17b-201ENSMUST00000027263 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rab28Q99KL7 Gm42463-201ENSMUST00000198041 4886 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Rab28Q99KL7 Eml5-201ENSMUST00000065716 9482 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rab28Q99KL7 Txlna-201ENSMUST00000046425 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rab28Q99KL7 Bms1-201ENSMUST00000032237 4345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rab28Q99KL7 Hgs-203ENSMUST00000106205 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rab28Q99KL7 Colec11-201ENSMUST00000036136 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rab28Q99KL7 Lrrc61-201ENSMUST00000101436 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rab28Q99KL7 Gusb-201ENSMUST00000026613 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rab28Q99KL7 Snord23-201ENSMUST00000116828 109 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Rab28Q99KL7 Olfr269-ps1-201ENSMUST00000120783 302 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Rab28Q99KL7 4930538E20Rik-202ENSMUST00000146717 497 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rab28Q99KL7 2210406O10Rik-203ENSMUST00000149687 1198 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rab28Q99KL7 Anp32e-206ENSMUST00000169426 915 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rab28Q99KL7 Dusp3-207ENSMUST00000176261 496 ntTSL 3 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rab28Q99KL7 Gm21964-201ENSMUST00000178785 936 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rab28Q99KL7 Nkx2-2os-202ENSMUST00000184407 458 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Rab28Q99KL7 Gm28215-201ENSMUST00000186146 346 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rab28Q99KL7 A930036K24Rik-201ENSMUST00000194146 1200 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
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Rab28Q99KL7 Olfr567-ps1-201ENSMUST00000210349 857 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
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Rab28Q99KL7 AC159196.1-201ENSMUST00000225524 377 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Rab28Q99KL7 AC129308.3-201ENSMUST00000225652 524 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Rab28Q99KL7 Naca-201ENSMUST00000073868 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rab28Q99KL7 Gm9962-201ENSMUST00000085241 321 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rab28Q99KL7 Gm13306-201ENSMUST00000098122 418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rab28Q99KL7 Anxa6-201ENSMUST00000102727 2471 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rab28Q99KL7 Abcg4-201ENSMUST00000034648 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rab28Q99KL7 Enpp4-201ENSMUST00000024757 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
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Rab28Q99KL7 Scaf1-206ENSMUST00000211735 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rab28Q99KL7 Rps6ka6-204ENSMUST00000113428 4135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
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Rab28Q99KL7 Sertm1-201ENSMUST00000070342 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rab28Q99KL7 Syt11-203ENSMUST00000107505 5020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rab28Q99KL7 Fam234b-202ENSMUST00000111916 2927 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rab28Q99KL7 Acad8-201ENSMUST00000060513 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rab28Q99KL7 Rufy2-204ENSMUST00000131718 2816 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rab28Q99KL7 Atl2-202ENSMUST00000112437 3371 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rab28Q99KL7 Fam110b-201ENSMUST00000054857 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
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Rab28Q99KL7 Cblb-203ENSMUST00000226593 3864 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rab28Q99KL7 Clcn4-201ENSMUST00000000619 4607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rab28Q99KL7 Angptl4-201ENSMUST00000002360 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
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Rab28Q99KL7 Rin1-201ENSMUST00000025818 4184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
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Rab28Q99KL7 Sln-201ENSMUST00000048485 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rab28Q99KL7 Pcdhgb8-201ENSMUST00000195764 4615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
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Rab28Q99KL7 Gm44696-201ENSMUST00000181943 1229 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
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Rab28Q99KL7 Rpain-201ENSMUST00000018593 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
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Rab28Q99KL7 Pars2-202ENSMUST00000106781 3046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rab28Q99KL7 Socs6-202ENSMUST00000123826 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rab28Q99KL7 Scn10a-201ENSMUST00000084787 6416 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rab28Q99KL7 Ss18l2-206ENSMUST00000215966 2316 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rab28Q99KL7 Myo7a-204ENSMUST00000107128 7506 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rab28Q99KL7 Gm20671-201ENSMUST00000144673 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rab28Q99KL7 Cep76-201ENSMUST00000097542 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rab28Q99KL7 Prx-201ENSMUST00000065487 4497 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rab28Q99KL7 Fnbp1-210ENSMUST00000113564 3892 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rab28Q99KL7 Akap12-202ENSMUST00000215696 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rab28Q99KL7 Tlr12-201ENSMUST00000074829 3177 ntAPPRIS P1 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rab28Q99KL7 Lox-201ENSMUST00000025409 3604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
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