Protein–RNA interactions for Protein: Q8VCH8

Ubxn4, UBX domain-containing protein 4, mousemouse

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Length 506 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubxn4Q8VCH8 Gm45338-206ENSMUST00000211460 1155 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Ubxn4Q8VCH8 Gm19605-201ENSMUST00000220603 686 ntTSL 3 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Ubxn4Q8VCH8 Dnajc4-201ENSMUST00000025915 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Ubxn4Q8VCH8 Tex35-201ENSMUST00000027884 909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Ubxn4Q8VCH8 Apoc4-201ENSMUST00000003071 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Ubxn4Q8VCH8 Tnfrsf4-201ENSMUST00000030952 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Ubxn4Q8VCH8 Olfr569-201ENSMUST00000078191 945 ntAPPRIS P1 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Ubxn4Q8VCH8 Gm22042-201ENSMUST00000082989 165 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
Ubxn4Q8VCH8 Gm25125-201ENSMUST00000083340 136 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
Ubxn4Q8VCH8 Gm26110-201ENSMUST00000083971 165 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
Ubxn4Q8VCH8 Olfr582-201ENSMUST00000098212 960 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
Ubxn4Q8VCH8 Arhgap25-201ENSMUST00000071024 2635 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Ubxn4Q8VCH8 Gm15987-201ENSMUST00000141700 2231 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Ubxn4Q8VCH8 Nrap-202ENSMUST00000073536 5501 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Ubxn4Q8VCH8 AC108416.1-201ENSMUST00000228755 1558 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
Ubxn4Q8VCH8 Zfp652-201ENSMUST00000091565 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Ubxn4Q8VCH8 Gm5878-201ENSMUST00000113802 4643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Ubxn4Q8VCH8 Zfp606-202ENSMUST00000123589 3509 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Ubxn4Q8VCH8 Ikbkg-204ENSMUST00000114128 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Ubxn4Q8VCH8 Plpbp-203ENSMUST00000209525 5767 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Ubxn4Q8VCH8 Crry-ps-201ENSMUST00000079090 1309 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
Ubxn4Q8VCH8 Uhrf1-202ENSMUST00000113035 3402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Ubxn4Q8VCH8 Cyp26b1-205ENSMUST00000205228 4288 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Ubxn4Q8VCH8 Myh13-201ENSMUST00000081911 5817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Ubxn4Q8VCH8 Evi2a-201ENSMUST00000103236 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Ubxn4Q8VCH8 Gal3st4-201ENSMUST00000100530 3162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Ubxn4Q8VCH8 Gm45165-201ENSMUST00000207763 1631 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
Ubxn4Q8VCH8 Rps24-210ENSMUST00000225023 1613 ntAPPRIS P4 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Ubxn4Q8VCH8 Nfya-201ENSMUST00000046719 3645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.39
Ubxn4Q8VCH8 Msh3-201ENSMUST00000022220 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.39
Ubxn4Q8VCH8 AC164092.1-201ENSMUST00000215635 2232 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.39
Ubxn4Q8VCH8 Gm11571-201ENSMUST00000136820 2396 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Ubxn4Q8VCH8 Uaca-201ENSMUST00000050183 4428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Ubxn4Q8VCH8 Cts7-201ENSMUST00000021892 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Ubxn4Q8VCH8 Apol9a-202ENSMUST00000089452 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Ubxn4Q8VCH8 Atxn1l-201ENSMUST00000093162 7526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Ubxn4Q8VCH8 Col11a1-201ENSMUST00000092155 7667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Ubxn4Q8VCH8 Prom2-202ENSMUST00000103214 4190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Ubxn4Q8VCH8 AW549877-201ENSMUST00000046633 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Ubxn4Q8VCH8 Gm23061-201ENSMUST00000102348 116 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
Ubxn4Q8VCH8 Nudt7-203ENSMUST00000109109 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Ubxn4Q8VCH8 Gm12579-201ENSMUST00000118040 783 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
Ubxn4Q8VCH8 Gm15549-201ENSMUST00000121595 622 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
Ubxn4Q8VCH8 Igf1-206ENSMUST00000122100 651 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Ubxn4Q8VCH8 Ankrd29-202ENSMUST00000122408 850 ntTSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Ubxn4Q8VCH8 1810063I02Rik-201ENSMUST00000130205 274 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Ubxn4Q8VCH8 C030047K22Rik-201ENSMUST00000150382 1164 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Ubxn4Q8VCH8 Gm3150-201ENSMUST00000166418 204 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
Ubxn4Q8VCH8 H2-Q3-201ENSMUST00000172583 608 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
Ubxn4Q8VCH8 Gm20636-201ENSMUST00000176660 707 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Ubxn4Q8VCH8 Trub2-210ENSMUST00000177467 744 ntTSL 3 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Ubxn4Q8VCH8 Gm27246-201ENSMUST00000183611 1240 ntTSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Ubxn4Q8VCH8 Cyb561-206ENSMUST00000184086 1130 ntTSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Ubxn4Q8VCH8 Gm43758-201ENSMUST00000199500 367 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
Ubxn4Q8VCH8 AC102569.1-204ENSMUST00000222816 793 ntTSL 3 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Ubxn4Q8VCH8 AC134860.1-201ENSMUST00000224867 660 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
Ubxn4Q8VCH8 Ppie-201ENSMUST00000030404 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Ubxn4Q8VCH8 Tubb2b-201ENSMUST00000075774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Ubxn4Q8VCH8 Iqcf1-201ENSMUST00000085114 613 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Ubxn4Q8VCH8 Tank-204ENSMUST00000112501 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Ubxn4Q8VCH8 Spata33-207ENSMUST00000212760 4074 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
Ubxn4Q8VCH8 Cyp2j13-202ENSMUST00000097973 1648 ntTSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Ubxn4Q8VCH8 Ddx21-201ENSMUST00000045866 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Ubxn4Q8VCH8 Gfm2-201ENSMUST00000022170 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Ubxn4Q8VCH8 Olfr95-201ENSMUST00000060728 5129 ntAPPRIS P1 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Ubxn4Q8VCH8 Lrrfip1-204ENSMUST00000097650 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Ubxn4Q8VCH8 Pigo-202ENSMUST00000098109 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Ubxn4Q8VCH8 Zfp354b-201ENSMUST00000109124 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Ubxn4Q8VCH8 Snx31-203ENSMUST00000161202 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Ubxn4Q8VCH8 Ube2c-201ENSMUST00000001439 2191 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Ubxn4Q8VCH8 Ism2-201ENSMUST00000051601 1350 ntTSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Ubxn4Q8VCH8 Optc-201ENSMUST00000124051 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Ubxn4Q8VCH8 Vmn2r18-201ENSMUST00000165928 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Ubxn4Q8VCH8 Arhgap33-204ENSMUST00000207860 4396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Ubxn4Q8VCH8 Card14-202ENSMUST00000106250 4206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Ubxn4Q8VCH8 Gm11735-201ENSMUST00000106377 1581 ntBASIC12.57□□□□□ -0.4
Ubxn4Q8VCH8 Dusp11-201ENSMUST00000032071 6435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Ubxn4Q8VCH8 Gm3765-201ENSMUST00000130985 1447 ntBASIC12.57□□□□□ -0.4
Ubxn4Q8VCH8 Sgk3-203ENSMUST00000168907 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Ubxn4Q8VCH8 Plekhb1-205ENSMUST00000107046 2793 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Ubxn4Q8VCH8 Rcbtb2-219ENSMUST00000169513 3622 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Ubxn4Q8VCH8 Ccdc163-202ENSMUST00000106462 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Ubxn4Q8VCH8 Tatdn3-203ENSMUST00000110891 1214 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Ubxn4Q8VCH8 Tatdn3-204ENSMUST00000110893 1242 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Ubxn4Q8VCH8 Olfr1258-202ENSMUST00000111516 936 ntAPPRIS P1 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Ubxn4Q8VCH8 Gm12715-201ENSMUST00000121430 1128 ntBASIC12.57□□□□□ -0.4
Ubxn4Q8VCH8 Gm42420-201ENSMUST00000126621 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Ubxn4Q8VCH8 Gm10863-201ENSMUST00000130745 438 ntTSL 3 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Ubxn4Q8VCH8 Smim5-201ENSMUST00000131566 700 ntTSL 2 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Ubxn4Q8VCH8 Gm13115-201ENSMUST00000156438 620 ntTSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Ubxn4Q8VCH8 Gm29499-201ENSMUST00000189151 486 ntBASIC12.57□□□□□ -0.4
Ubxn4Q8VCH8 Gm5441-202ENSMUST00000190132 449 ntTSL 2 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Ubxn4Q8VCH8 Gm28329-201ENSMUST00000191208 689 ntBASIC12.57□□□□□ -0.4
Ubxn4Q8VCH8 Gm29171-201ENSMUST00000191397 486 ntBASIC12.57□□□□□ -0.4
Ubxn4Q8VCH8 Gm7504-201ENSMUST00000201449 424 ntBASIC12.57□□□□□ -0.4
Ubxn4Q8VCH8 Gm3961-201ENSMUST00000204425 994 ntBASIC12.57□□□□□ -0.4
Ubxn4Q8VCH8 Gm40639-201ENSMUST00000214642 625 ntTSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Ubxn4Q8VCH8 Pbld1-204ENSMUST00000219045 602 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Ubxn4Q8VCH8 5830428M24Rik-201ENSMUST00000221805 825 ntTSL 2 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Ubxn4Q8VCH8 AC154171.1-201ENSMUST00000224610 643 ntBASIC12.57□□□□□ -0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.9 ms