Protein–RNA interactions for Protein: Q8K099

Lrit1, Leucine-rich repeat, immunoglobulin-like domain and transmembrane domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 624 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrit1Q8K099 Chrna10-201ENSMUST00000084830 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Lrit1Q8K099 Mxd1-201ENSMUST00000001184 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Lrit1Q8K099 Vmn1r38-201ENSMUST00000226457 3462 ntAPPRIS P1 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Lrit1Q8K099 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Lrit1Q8K099 Cd163l1-204ENSMUST00000209637 3210 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Lrit1Q8K099 1110051M20Rik-203ENSMUST00000102594 1977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Lrit1Q8K099 Tfrc-201ENSMUST00000023486 4890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Lrit1Q8K099 Elfn1-201ENSMUST00000050519 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Lrit1Q8K099 Siglec1-202ENSMUST00000110226 1861 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Lrit1Q8K099 Epb41-207ENSMUST00000105975 5235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
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Lrit1Q8K099 Slc13a5-201ENSMUST00000021161 3329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Lrit1Q8K099 Cdca8-202ENSMUST00000084296 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Lrit1Q8K099 Samd11-202ENSMUST00000217934 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Lrit1Q8K099 Mgat3-201ENSMUST00000044970 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
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Lrit1Q8K099 Tcof1-202ENSMUST00000175934 4595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Lrit1Q8K099 1700030J22Rik-201ENSMUST00000070577 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Lrit1Q8K099 Ttc17-203ENSMUST00000111237 4409 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
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Lrit1Q8K099 Art2b-202ENSMUST00000209526 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Lrit1Q8K099 Adipor2-202ENSMUST00000169744 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Lrit1Q8K099 Syvn1-207ENSMUST00000156550 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Lrit1Q8K099 4932438H23Rik-201ENSMUST00000035689 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
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Lrit1Q8K099 4930412O13Rik-202ENSMUST00000114919 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
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Lrit1Q8K099 Gm11465-201ENSMUST00000127942 435 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
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Lrit1Q8K099 Gm11770-201ENSMUST00000135048 548 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
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Lrit1Q8K099 Hcst-203ENSMUST00000208740 366 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
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Lrit1Q8K099 C030034I22Rik-202ENSMUST00000188481 4231 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Lrit1Q8K099 6030443J06Rik-201ENSMUST00000181209 2380 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
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Lrit1Q8K099 Oprm1-205ENSMUST00000078634 1695 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
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Lrit1Q8K099 Tgfbr1-202ENSMUST00000044234 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
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Lrit1Q8K099 9230114K14Rik-202ENSMUST00000198720 837 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
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Lrit1Q8K099 Phf5a-201ENSMUST00000023117 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
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Lrit1Q8K099 Olfr456-201ENSMUST00000057251 1052 ntAPPRIS P1 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Lrit1Q8K099 Foxb1-201ENSMUST00000071281 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Lrit1Q8K099 Olfr1330-201ENSMUST00000094830 948 ntAPPRIS P1 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Lrit1Q8K099 Cct4-204ENSMUST00000173867 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Lrit1Q8K099 Gm45663-201ENSMUST00000210429 1632 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Lrit1Q8K099 Cinp-201ENSMUST00000043716 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Lrit1Q8K099 Gm4925-202ENSMUST00000168843 1561 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Lrit1Q8K099 Epha6-201ENSMUST00000068860 3930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Lrit1Q8K099 Slc13a5-205ENSMUST00000208056 3111 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Lrit1Q8K099 Gm13814-201ENSMUST00000141341 3077 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
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Lrit1Q8K099 Fbxl12-203ENSMUST00000131128 4182 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
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